Gene Information

Name : vasG-1 (VSAL_I1177)
Accession : YP_002262652.1
Strain :
Genome accession: NC_011312
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : chaperone ClpB-1
Function : -
COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones
COG ID : COG0542
EC number : -
Position : 1281456 - 1284074 bp
Length : 2619 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGATAAATATTGAATTACAAAGTCTAGTAAAAAGATTAACCCCGGGGATGAAGGCTTCACTTGAAGCCGCAGCAGGAGA
ATGTGTTCAGCGTGGTCATTTTTCAATTGAATTTGAGCATTGGTTTGTCCAATTATTGCAACAGCCGACTGTGGGTTGGC
AAAAAGCGGTTGAGCAAACTGGAATGGCAAGCGAAAGTATTCTTGAGCAACTTAATAACCACTTGTCTAGTTTACCTCGT
GGCAATGACTCTGCACCGTCATTGTCACCCCAATTAGTTGAATTATTAAAAGACGCTTGGATGATTGGTTCTCTTAATCA
CGCTCAACTATCGATGAATGAATTTCATGTACTAATTGTATTAAAACAAAGAATTGAACAGGGGGCATATAACGGTGCGT
TATCTACCTGGATAAAAAGTTTGTCGTCTGAATGGCTAAATCGTCAATCGATTACTAAGACGGCATCAAGTCATCTTTCA
TCAACTTCTATGTTATGTGGTAAAAACCAAGGTATGGAAGGCAACATGAGTACTCCTGCTCTTGATAAGTACTCACAAAA
TTTAACTCAAGCGGCACGGAATGGTGATTTAGACCCAATCTCTGGGCGTGGTAATGAGATCAGAAAAGCCATCGATATCT
TGTGTCGTCGCCGTCAAAATAGTCCAATTTTAGTTGGTGATCCGGGAGTGGGTAAAACTGCTATTGTAGAAGGCTTAGCA
CAACAAATTGTAGACGGTAACGTGCCACCGGCATTAAAAAACGTAGAATTACGCAATTTAGATTTATCACTACTTCAAGC
AGGAGCAAGTATTAAAGGTGAGTTTGAGAACCGCCTTAAAGATGTGATTAATGAAATTAAACAATCAGCAACACCAATTA
TTGTGTTTATTGATGAAGCGCATACTTTAATTGGAGCGGGTGGTGCAGCTGGTCAAAATGATGCCGCGAATATCTTAAAA
CCCGCGTTGGCTCGTGGTGAATTTCGTTCTATTGCAGCCACAACATGGGCTGAGTATAAGCAGTATTTTGAATCAGATGC
CGCCTTAAGTCGTCGCTTTCAAGTCGTATCGATTGGTGAACCTAGTGAAGGTGATGCAATACACATGCTCAGCGGTGTAA
AGACATGTTTAGAGAAACACCATAATGTAAAAGTAATGCAAGAGGCAATTAATGCCGCAGTTTCATTATCTATTCGCTAT
TTACCGGAACGAAAATTACCGGATAAAGCGATAAGCTTATTAGATACAGCTTGTTCTCGAATTGGGTTAAGCCAAAGTGC
TCCCCCTCGGCAGTTAGAAGCAGTAGCTGAGCAAATCTGCTATGTTGAAAATGAAATCACAACCTTGAATCATGAAGCTG
CATTATGGTCAATTGATGATGATCGTTTAGAGCAAGTTCAACAACGTTTAATTGATCTACAAGAACAGCATCAAGAAATA
GGTAAGTGTTGGGAGCAAGAAAAAACCTTGGTAGAGGAGATCATTGTTCTGCAAACAAAACTAGATGAACAGTTTCTAAA
TGGTGATGATTTATCAGAAAATGAAGATAAATTCCTTTTAGCGATAAAGATGACAGAGTTGCATGCAATACAAGATGATC
AACCTTTAGTGCTTCCTCAAGTGAACGAACAAACCATAGCGGAAGTGATCTCTTTATGGACAGGAATCCCTGTCGGGAAT
ATGTTAAAAGAAGAAGTTGAACATTTAATGCATCTTGAAAAGCATATTGGTGAGCGAGTTATTGGTCAAATAGCTCCTAT
TGCGGAGATCTCTAAAGCGATCCGTATGTCTCGTGCAGGATTGACTGATCTTCGTAAGCCTGTCGGCGTGTTCTTGATGT
GTGGCCCAAGTGGTGTTGGTAAAACAGAAACAGCATTAGCGTTAACAGATCTGCTTTATGGTGGTAAGCGTAACATAACC
ACAATTAACATGACTGAATTTAAGGAAGAACATAAAGTATCTACGCTTCTTGGCTCTCCTGCCGGTTATGTCGGGTACGG
TAAAGGTGGTGTATTAACAGAAGCTGTACGTAAAAATCCATATTCCGTTTTATTATTGGATGAGATGGAAAAAGCGCACC
CTGGTGTTCATGATATCTTCTATCAAATTTTTGATAAAGGCTCTATTTCAGACAGTGAAGGTCGTGAAGTTGATTTCCGT
AATACCATCATCATTATGACATCTAATGCAGCCGATAGTGCGGTAGTTAATGGATGTGCTGATGGCCGTCCTTCTATCTC
AATATTAACCAAAGCTATCTTCCCTGAGCTGCAGAATTTCTTTAAACCTGCCTTCTTAGGTCGAACAACAATAGTGCCTT
ATTTCCCACTGAATGATGAAGAGATGAGTAAGATTGCTCAATTGTCTTTACGCCGCATTGAAAAACGAATTAAGCAACAT
TATAACGCGACGTTTGATTACGACACTCAAGTTATTGAACTGTTAGTGAGTATGAATCAATCACCAGAAACGGGAGCCCG
TGCAATTGAACAATTAATTAATCGTCAATTAATGCCAGAGCTAGCGAATCAATGCATCGTGAGAATGAGTCAATCACAGC
CAATTAGTGAAGTATTACTTACAGTGAATGGCAATAAATTTCAAATCGATATTAAATAA

Protein sequence :
MINIELQSLVKRLTPGMKASLEAAAGECVQRGHFSIEFEHWFVQLLQQPTVGWQKAVEQTGMASESILEQLNNHLSSLPR
GNDSAPSLSPQLVELLKDAWMIGSLNHAQLSMNEFHVLIVLKQRIEQGAYNGALSTWIKSLSSEWLNRQSITKTASSHLS
STSMLCGKNQGMEGNMSTPALDKYSQNLTQAARNGDLDPISGRGNEIRKAIDILCRRRQNSPILVGDPGVGKTAIVEGLA
QQIVDGNVPPALKNVELRNLDLSLLQAGASIKGEFENRLKDVINEIKQSATPIIVFIDEAHTLIGAGGAAGQNDAANILK
PALARGEFRSIAATTWAEYKQYFESDAALSRRFQVVSIGEPSEGDAIHMLSGVKTCLEKHHNVKVMQEAINAAVSLSIRY
LPERKLPDKAISLLDTACSRIGLSQSAPPRQLEAVAEQICYVENEITTLNHEAALWSIDDDRLEQVQQRLIDLQEQHQEI
GKCWEQEKTLVEEIIVLQTKLDEQFLNGDDLSENEDKFLLAIKMTELHAIQDDQPLVLPQVNEQTIAEVISLWTGIPVGN
MLKEEVEHLMHLEKHIGERVIGQIAPIAEISKAIRMSRAGLTDLRKPVGVFLMCGPSGVGKTETALALTDLLYGGKRNIT
TINMTEFKEEHKVSTLLGSPAGYVGYGKGGVLTEAVRKNPYSVLLLDEMEKAHPGVHDIFYQIFDKGSISDSEGREVDFR
NTIIIMTSNAADSAVVNGCADGRPSISILTKAIFPELQNFFKPAFLGRTTIVPYFPLNDEEMSKIAQLSLRRIEKRIKQH
YNATFDYDTQVIELLVSMNQSPETGARAIEQLINRQLMPELANQCIVRMSQSQPISEVLLTVNGNKFQIDIK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
STY0294 NP_454876.1 ClpB-like protein Not tested SPI-6 Protein 9e-144 41

• Homologs from VFDB (virulence genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
vasG-1 YP_002262652.1 chaperone ClpB-1 VFG2076 Protein 0.0 44
vasG-1 YP_002262652.1 chaperone ClpB-1 VFG2084 Protein 4e-161 42