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Name : ccmF (VSAL_I2001) Accession : YP_002263387.1 Strain : Genome accession: NC_011312 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome C biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 2142795 - 2144681 bp Length : 1887 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGTTGCTGAAATAGGTCAGTTCTGGTTAATAGCAACGATGGTGCTGTCTGTTGTGGGTGTTATTTCTACCAGCTACGG AATCGTGAAAGGGAATATCTTGTGGCAAATGTCGATATTGCCACTTTCTCTGCTCAGTTGTATTTTTTGTTTGTTGTCTA TTTCTGCATTAGGTTATGGGTTTTACATCGATGATTTTTCTATTCGATATATTGCCGAGCATTCTAATTCTGATTTACCT GTCTTTTTTAAAGTGGCCGCGATTTGGGGAGGGCATGAAGGGTCATTATTGTTCTGGGTATTAACCTTAACGTTATGGGC AGGTGTCATAACTCTTAATCGAAAAACCATACAAACAGAATACGTTATTCGAGTTTTGTTGGTGCTTAATGCGTTAATTG CTATTTTTTCAGCCTTTACTTTATTTGCTTCAAATCCTTTCATTATTTACGTTAACACACCATTAGAAGGTCGAGATTTG AATCCAATGTTGCAAGATATTGGATTGATATTTCACCCACCATTATTGTATTTAGGCTACGTCGGATTTGCCGCGACATT TTCATTTGCACTTGCTGCGTTGATGATGAAAGACGTACCGCAATATTGGGTTAAACACGCAAGGCATTGGACACTATTAG CGTGGTCATTGTTGACCGCAGGGATCAGTTTAGGATCGTGGTGGGCATATTATGAGCTCGGTTGGGGCGGTTGGTGGTTT TGGGATCCGGTTGAAAACGCCTCTTTGTTGCCTTGGTTAACCGCAACGGGTTTACTGCATACCTTAATCGCGAGTGATAA GAAAAACCAACTTTTAAAAACGTCGATGATTCTGTCGTTAGTGACATTTTGTTTGAGTATTTTAGGGACGTTTGTTGTTC GCTCTGGGGTATTAACTTCGGTTCATGCCTTTGCGGTGGACCCAACTCGTGGGATCATTCTTCTTCTGATCTTGTTTGTG GTTATGCTGGCCTCTTTGTCTCTGTATGCATTCAAAAGTAGACAGTTAAATAGCCAACCTATTCGTCATTTTATCAGTCG TGATTTTCTATTTTTATTGCTCGCAGGTTTATTTTCAATCGCAACAATCACGGTATTACTTGGCACATTTTATCCTATGA TTTTCCAAATTTTCGGATTAGGAAATATCTCCGTTGGAGCGCCTTATTTTAATCTGTTATTTGTGCCAATGGCGATTGTT GCTTTGTTCATGATCGCCGTGTCGGTCTTTGTTCGTTGGGAAGGAAAAGCGACAAATGCAAATACCAAGAAGATCGTTAT TTCAAGCTTGATTTCTATTGTGCTAGGGCTAGGAATATATCGTGTTCAATATGAAAATATCGCAGTAATTCCTAGCTTGG TTTGGGTGTTAGCTTTCGCTGTAGTAATGGGGTCTATTTGGTCGCTGATACAGTCCAAAGGCAAAGCGATAGGAATGGTT ATCGCTCATATTGGTATTGCGATAGTGATGATTGGTGCAGCGATGAATAGTGAACACTCTTTTGAAAGCAGTGCGAAAAT GGAACCGAGCATAACCGCTAAATTAGCCGATTATGAGATCACTTATAAAGAAACCGAGCTGTTGGTTGCTTCAAATTACA CCGCAGAACAGGCAAATCTATTGATACGTGAAAATGGCAAAGAAATAGCCATGGTCCAGCCGCAGCGTCGTCATTATCAA GTTCGTGTAATGAACATGAGTGAGCCTGCAATGTATTGGTTTTGGCATGGTGACATATACGTGACGTTAGGCGAAAAATT AAAAGACGGCAGTTTCGCATTACGTTTACAATATAAAGCGTATGTACGATGGATTTGGTTTGGGTCTATTTTGATGGCGC TTGGTGGTGTATTAGCTATGGTAAAAAGAAAGAGTAATTATTCATGA Protein sequence : MVAEIGQFWLIATMVLSVVGVISTSYGIVKGNILWQMSILPLSLLSCIFCLLSISALGYGFYIDDFSIRYIAEHSNSDLP VFFKVAAIWGGHEGSLLFWVLTLTLWAGVITLNRKTIQTEYVIRVLLVLNALIAIFSAFTLFASNPFIIYVNTPLEGRDL NPMLQDIGLIFHPPLLYLGYVGFAATFSFALAALMMKDVPQYWVKHARHWTLLAWSLLTAGISLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLLPWLTATGLLHTLIASDKKNQLLKTSMILSLVTFCLSILGTFVVRSGVLTSVHAFAVDPTRGIILLLILFV VMLASLSLYAFKSRQLNSQPIRHFISRDFLFLLLAGLFSIATITVLLGTFYPMIFQIFGLGNISVGAPYFNLLFVPMAIV ALFMIAVSVFVRWEGKATNANTKKIVISSLISIVLGLGIYRVQYENIAVIPSLVWVLAFAVVMGSIWSLIQSKGKAIGMV IAHIGIAIVMIGAAMNSEHSFESSAKMEPSITAKLADYEITYKETELLVASNYTAEQANLLIRENGKEIAMVQPQRRHYQ VRVMNMSEPAMYWFWHGDIYVTLGEKLKDGSFALRLQYKAYVRWIWFGSILMALGGVLAMVKRKSNYS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 5e-84 | 41 |
