Gene Information

Name : HAPS_2130 (HAPS_2130)
Accession : YP_002476524.1
Strain : Haemophilus parasuis SH0165
Genome accession: NC_011852
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : di- and tricarboxylate transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0471
EC number : -
Position : 2093581 - 2094969 bp
Length : 1389 bp
Strand : +
Note : COG:P;COG0471

DNA sequence :
ATGTCGGTATCACATCAATCATCAAACCCAATAACAAGGAATGGACTTATTCTGTTATTTGATATTGTTTTATTCTTTGT
CTTATTAAATACATTACCTTTTGAACCCGCTGTAAGTAAAGGTTTAGCCTTATTAGTATTTGTTGCGGTTTTATGGCTTA
CGGAAGCTCTACACGTTACAGTAACGGCTCTACTTGTGCCTATTCTGGCGATTGGTCTAGGGTTAGTAAAATCTAAAGAA
GCCTTAAGTGCTTTTGCCGATCCAACAATCTTCCTTTTCTTTGGTGGTTTTGCTTTAGCTACAGCATTACACATTCAACA
GCTTGATCGCCTGATTGCAAATAAAATTATGGCAATGGCAAAAGGGAAATTATCCATTGCAGTGATTTACCTATTCTCTG
TTACTGCATTTCTTTCAATGTGGATGAGTAATACAGCAACCGCAGCAATGATGTTACCGCTTGCAATGGGGATTTTAAGT
AAATTAGATAAAGAAACTCACCACAACACCTATCTCTTTGTATTATTAGGGATTGCTTATAGTGCAAGTATTGGTGGAAT
GGGGACGCTGGTTGGTAGTCCACCAAATGCGATTGTGGCATCACAGCTGAATTTAACTTTTGCAGATTGGTTAAAATATG
GCTTGCCGATTATGTTTATCTTGATGCCATTAATGATCGCAACGCTATATGTAGTATTTAAACCGAAATTTGATGTTACT
TTTGAGCATAGTTTTGAAAAAATTGAGTTAAATCGCGAGCGTATTATTACCCTTTCTATCTTTGGCGTTATCGCAATTTG
TTGGGTATTTGGCGATAAAATTAACCCACTAATTTCTGGCTTATTAGGGCTACAAGGTAAAATTGGTAGTTTCGACAGTA
TCGTTGCTCTTTTTGCTGCAGTCTTAATTTGTATCACTAGAGTTGCTTCGTGGGACGATATTCAGAAAAATACCGAATGG
GGCGTATTAATGCTTTTCGGTGGCGGTTTAACCTTAAGCTCAGTGCTAGGTCAAACAGGGGCTAGTAAAGTAATGGCAGA
TGGTATCGTATTCTTAATTGAAGACGGATACTTCTACCTTATCGGATTACTGGTTGCAGCATTTATTATTTTCTTAACAG
AATTTACCTCTAATACAGCAAGTGCTGCATTATTAGTACCAATCTTTATTTCTATTGCTCAAGCCTTAAATATGCCGCCA
GTAGGGCTTGCATTAATTATCGGCTTAGGTGCGTCTTGTGCCTTTATGTTACCAGTTGCAACACCGCCAAATGCGATTGT
ATTTGGTACAGGGCAAATTAAACAGAGTGAGATGGTGAAAGCTGGTTTCTGGCTTAACATTATCTGTATTTTTGTCATTG
CAACGGCAGGGTATTTGTTCTGGTTGTAA

Protein sequence :
MSVSHQSSNPITRNGLILLFDIVLFFVLLNTLPFEPAVSKGLALLVFVAVLWLTEALHVTVTALLVPILAIGLGLVKSKE
ALSAFADPTIFLFFGGFALATALHIQQLDRLIANKIMAMAKGKLSIAVIYLFSVTAFLSMWMSNTATAAMMLPLAMGILS
KLDKETHHNTYLFVLLGIAYSASIGGMGTLVGSPPNAIVASQLNLTFADWLKYGLPIMFILMPLMIATLYVVFKPKFDVT
FEHSFEKIELNRERIITLSIFGVIAICWVFGDKINPLISGLLGLQGKIGSFDSIVALFAAVLICITRVASWDDIQKNTEW
GVLMLFGGGLTLSSVLGQTGASKVMADGIVFLIEDGYFYLIGLLVAAFIIFLTEFTSNTASAALLVPIFISIAQALNMPP
VGLALIIGLGASCAFMLPVATPPNAIVFGTGQIKQSEMVKAGFWLNIICIFVIATAGYLFWL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
orf77 AAO17231.1 Orf77 Not tested tcd island Protein 9e-97 60