Name : SP70585_0180 (SP70585_0180) Accession : YP_002739490.1 Strain : Streptococcus pneumoniae 70585 Genome accession: NC_012468 Putative virulence/resistance : Virulence Product : transport/processing ATP-binding protein ComA Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : 3.4.22.- Position : 155533 - 157764 bp Length : 2232 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00005; match to protein family HMM PF00664; match to protein family HMM PF03412; match to protein family HMM TIGR01193 DNA sequence : TTGAGTATTTCTATGTTAAAAAAATATCCTTGTACGATGCAACATGATCAGTCAGATTGTGCTGCGGCAGTTGTTTCAAC AGTTCTTTTATCTTACAAAAAGGAACTATCAATCATGAAGATTCGGGAAATTATTGGTACAGACATGTATGGAACGACTG TCAGTGGTATTGTTTCAGGTCTGAATAAGTTGAATTTTACAGTAAAAGCTGTTCGAGTAGCACTGGAAGATTTGACTCCA AAATTAACATTTCCTGCGATTCTTCAAGTTAAGAATGATTTAGGTCAAAATCATTTTGTGGTACTACATAGTATCAAAAG GAATAGTAAGTTCTACGTAGCAGACCCTGCTAGTGGCATACGCAAGATGTCAAGTGACGAACTGGGAGAAATTTATCAAG GTATTACTCTTTTTATGGTTCCAAATTCGGATTTTGAAAGAGGGAAACTAAAGGGAAAAGGACTTCTTGATTTATTTGGA AGGTTAATTTTTAATCAAAAAGGATTGATTAGTACAGTCATATTAGCTTCCTTTGTTTTAAGTATCATTGGTATTTTATC GAGTCTCTTTTCAAAAGTTATCATGGACGAGGTGATTCCATATGCTTTAAAAAATAGTCTGTATATGTTTTTGATAGTAT TTGGAATAGTGTCGTTCTTACAGACTCTTCTATCTGCATTTCGTCAGCACGTTCTTTTGTTTCTATCTCGAAAAATTGAT ATACCGGTTTTAATGGGATATTATGACCATATTATTCATCTTCCTTATAGTTTTTTTGGAAGTCGTAGAGTTGGTGATGT TTTAACAAGATTTCAAGATGCGATGACGATAAAGAATGTGTTTACGTCAGTCTCTATTTCATTAGTCATGGATATCACCT TGTCAGTTATTAGTGCGGTTGTCCTTTGGACTATTAATCAATCTTTATTTCTGATATTAGTTTTTATGGTTATTGTTAAC ATCATTCTTATATACTGTTTTAAAAAGCCTTATAAAAAAATTAATCATGAACAAATGGAAGCAAATGGACTTCTTAATTC ACAGTTAATTGAATCTATTCGTAACATTGATACCATTAAGTCTCAGCATGATGAGGAACAACGTTTAAACAAAATTGAAG AAAAATTTGTTCATACTTTAGAAATTGGTTATAAAGAGGGTGTTTTGCAGAATATTCAATCTACAATATCTTCAATGACC TCAACCATGGGTGGGTTATTATTTATGGGAGTGGGCGCCTTATTTATCATTGATGGAAAAATGACTATTGGGGACCTCTT GGTTTTTCAGACATTAAGTCAATATTTTACAGAACCTATTCAGAATTTAGTTGGCTTGCAGTTAACCTTTCAAGAGGTAC AGGTTGCGGTTAGTCGGCTTCAAGAATTGATGGAAGTAGATCGTGAAGACATTGCCTTGGATTATAGTATTAGAGACTTC ACCTTATGTGATGACATTGAATTTAAAGATGTAACATTTGCCTATGGTTCACGCCCTCCTGTTATCAAGGACTTTAATTT GCGAATTAAACAAGGAGAAAAAATAGCTTTTGTTGGAGAAAGCGGAGCAGGAAAAAGTACGCTAGTTCGTTTGTTATTAA GATTTATAAATCCGAGTGAGGGGAAAATTCGTATAGGAGAAAATGACTTATCAGATCTTGACTATGGTAAACTACGTAAG AAAATTTCCTACATTCCTCAGACCATAGAACTCTTTACAGGGACAATTATTGATAATCTAAAAATTGGTAATCCTTCTGT TACATATGAGGATATGGTGAGAGTTTGTCGTATTGTTGGTATTCATGATACGATTCAACGTCTTCAAAATCGTTATGGCT CCTTTGTAGAAGAAGACGGTCAAAATTTCTCGGGTGGAGAGAAACAACGATTGGCTATTGCAAGAGCACTACTGAGTAAA GCTGATTTGTATATATTTGATGAGGCAACCTCTAACTTAGATTCATTTAGTGAACAGATTATTCAGGATTTAATCTTTAA TAAAATAATGGATAAGACAACAATTGTAGTAGCCCACAGGCTGTCTACAATTCTTCGATGTGATAAGATATGCTTTTTAG AAAATGGGACTATTGTGGAATATGGGACTCATGAAGAACTAATGGCGAAAAATGGAAAGTATGCTAGAATGGTTGGTTTG CAGAGCGTTCAAGTGAATCAACAAATTCAGTCACAGGCTGTGTTAGATACAGAGGAGGTTACTTATGGCTAA Protein sequence : MSISMLKKYPCTMQHDQSDCAAAVVSTVLLSYKKELSIMKIREIIGTDMYGTTVSGIVSGLNKLNFTVKAVRVALEDLTP KLTFPAILQVKNDLGQNHFVVLHSIKRNSKFYVADPASGIRKMSSDELGEIYQGITLFMVPNSDFERGKLKGKGLLDLFG RLIFNQKGLISTVILASFVLSIIGILSSLFSKVIMDEVIPYALKNSLYMFLIVFGIVSFLQTLLSAFRQHVLLFLSRKID IPVLMGYYDHIIHLPYSFFGSRRVGDVLTRFQDAMTIKNVFTSVSISLVMDITLSVISAVVLWTINQSLFLILVFMVIVN IILIYCFKKPYKKINHEQMEANGLLNSQLIESIRNIDTIKSQHDEEQRLNKIEEKFVHTLEIGYKEGVLQNIQSTISSMT STMGGLLFMGVGALFIIDGKMTIGDLLVFQTLSQYFTEPIQNLVGLQLTFQEVQVAVSRLQELMEVDREDIALDYSIRDF TLCDDIEFKDVTFAYGSRPPVIKDFNLRIKQGEKIAFVGESGAGKSTLVRLLLRFINPSEGKIRIGENDLSDLDYGKLRK KISYIPQTIELFTGTIIDNLKIGNPSVTYEDMVRVCRIVGIHDTIQRLQNRYGSFVEEDGQNFSGGEKQRLAIARALLSK ADLYIFDEATSNLDSFSEQIIQDLIFNKIMDKTTIVVAHRLSTILRCDKICFLENGTIVEYGTHEELMAKNGKYARMVGL QSVQVNQQIQSQAVLDTEEVTYG |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
CPR_0658 | YP_697985.1 | lactococcin g processing and transport ATP-binding protein | Virulence | Not named | Protein | 2e-144 | 47 |