Gene Information

Name : SP70585_0180 (SP70585_0180)
Accession : YP_002739490.1
Strain : Streptococcus pneumoniae 70585
Genome accession: NC_012468
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : transport/processing ATP-binding protein ComA
Function : -
COG functional category : V : Defense mechanisms
COG ID : COG2274
EC number : 3.4.22.-
Position : 155533 - 157764 bp
Length : 2232 bp
Strand : +
Note : identified by match to protein family HMM PF00005; match to protein family HMM PF00664; match to protein family HMM PF03412; match to protein family HMM TIGR01193

DNA sequence :
TTGAGTATTTCTATGTTAAAAAAATATCCTTGTACGATGCAACATGATCAGTCAGATTGTGCTGCGGCAGTTGTTTCAAC
AGTTCTTTTATCTTACAAAAAGGAACTATCAATCATGAAGATTCGGGAAATTATTGGTACAGACATGTATGGAACGACTG
TCAGTGGTATTGTTTCAGGTCTGAATAAGTTGAATTTTACAGTAAAAGCTGTTCGAGTAGCACTGGAAGATTTGACTCCA
AAATTAACATTTCCTGCGATTCTTCAAGTTAAGAATGATTTAGGTCAAAATCATTTTGTGGTACTACATAGTATCAAAAG
GAATAGTAAGTTCTACGTAGCAGACCCTGCTAGTGGCATACGCAAGATGTCAAGTGACGAACTGGGAGAAATTTATCAAG
GTATTACTCTTTTTATGGTTCCAAATTCGGATTTTGAAAGAGGGAAACTAAAGGGAAAAGGACTTCTTGATTTATTTGGA
AGGTTAATTTTTAATCAAAAAGGATTGATTAGTACAGTCATATTAGCTTCCTTTGTTTTAAGTATCATTGGTATTTTATC
GAGTCTCTTTTCAAAAGTTATCATGGACGAGGTGATTCCATATGCTTTAAAAAATAGTCTGTATATGTTTTTGATAGTAT
TTGGAATAGTGTCGTTCTTACAGACTCTTCTATCTGCATTTCGTCAGCACGTTCTTTTGTTTCTATCTCGAAAAATTGAT
ATACCGGTTTTAATGGGATATTATGACCATATTATTCATCTTCCTTATAGTTTTTTTGGAAGTCGTAGAGTTGGTGATGT
TTTAACAAGATTTCAAGATGCGATGACGATAAAGAATGTGTTTACGTCAGTCTCTATTTCATTAGTCATGGATATCACCT
TGTCAGTTATTAGTGCGGTTGTCCTTTGGACTATTAATCAATCTTTATTTCTGATATTAGTTTTTATGGTTATTGTTAAC
ATCATTCTTATATACTGTTTTAAAAAGCCTTATAAAAAAATTAATCATGAACAAATGGAAGCAAATGGACTTCTTAATTC
ACAGTTAATTGAATCTATTCGTAACATTGATACCATTAAGTCTCAGCATGATGAGGAACAACGTTTAAACAAAATTGAAG
AAAAATTTGTTCATACTTTAGAAATTGGTTATAAAGAGGGTGTTTTGCAGAATATTCAATCTACAATATCTTCAATGACC
TCAACCATGGGTGGGTTATTATTTATGGGAGTGGGCGCCTTATTTATCATTGATGGAAAAATGACTATTGGGGACCTCTT
GGTTTTTCAGACATTAAGTCAATATTTTACAGAACCTATTCAGAATTTAGTTGGCTTGCAGTTAACCTTTCAAGAGGTAC
AGGTTGCGGTTAGTCGGCTTCAAGAATTGATGGAAGTAGATCGTGAAGACATTGCCTTGGATTATAGTATTAGAGACTTC
ACCTTATGTGATGACATTGAATTTAAAGATGTAACATTTGCCTATGGTTCACGCCCTCCTGTTATCAAGGACTTTAATTT
GCGAATTAAACAAGGAGAAAAAATAGCTTTTGTTGGAGAAAGCGGAGCAGGAAAAAGTACGCTAGTTCGTTTGTTATTAA
GATTTATAAATCCGAGTGAGGGGAAAATTCGTATAGGAGAAAATGACTTATCAGATCTTGACTATGGTAAACTACGTAAG
AAAATTTCCTACATTCCTCAGACCATAGAACTCTTTACAGGGACAATTATTGATAATCTAAAAATTGGTAATCCTTCTGT
TACATATGAGGATATGGTGAGAGTTTGTCGTATTGTTGGTATTCATGATACGATTCAACGTCTTCAAAATCGTTATGGCT
CCTTTGTAGAAGAAGACGGTCAAAATTTCTCGGGTGGAGAGAAACAACGATTGGCTATTGCAAGAGCACTACTGAGTAAA
GCTGATTTGTATATATTTGATGAGGCAACCTCTAACTTAGATTCATTTAGTGAACAGATTATTCAGGATTTAATCTTTAA
TAAAATAATGGATAAGACAACAATTGTAGTAGCCCACAGGCTGTCTACAATTCTTCGATGTGATAAGATATGCTTTTTAG
AAAATGGGACTATTGTGGAATATGGGACTCATGAAGAACTAATGGCGAAAAATGGAAAGTATGCTAGAATGGTTGGTTTG
CAGAGCGTTCAAGTGAATCAACAAATTCAGTCACAGGCTGTGTTAGATACAGAGGAGGTTACTTATGGCTAA

Protein sequence :
MSISMLKKYPCTMQHDQSDCAAAVVSTVLLSYKKELSIMKIREIIGTDMYGTTVSGIVSGLNKLNFTVKAVRVALEDLTP
KLTFPAILQVKNDLGQNHFVVLHSIKRNSKFYVADPASGIRKMSSDELGEIYQGITLFMVPNSDFERGKLKGKGLLDLFG
RLIFNQKGLISTVILASFVLSIIGILSSLFSKVIMDEVIPYALKNSLYMFLIVFGIVSFLQTLLSAFRQHVLLFLSRKID
IPVLMGYYDHIIHLPYSFFGSRRVGDVLTRFQDAMTIKNVFTSVSISLVMDITLSVISAVVLWTINQSLFLILVFMVIVN
IILIYCFKKPYKKINHEQMEANGLLNSQLIESIRNIDTIKSQHDEEQRLNKIEEKFVHTLEIGYKEGVLQNIQSTISSMT
STMGGLLFMGVGALFIIDGKMTIGDLLVFQTLSQYFTEPIQNLVGLQLTFQEVQVAVSRLQELMEVDREDIALDYSIRDF
TLCDDIEFKDVTFAYGSRPPVIKDFNLRIKQGEKIAFVGESGAGKSTLVRLLLRFINPSEGKIRIGENDLSDLDYGKLRK
KISYIPQTIELFTGTIIDNLKIGNPSVTYEDMVRVCRIVGIHDTIQRLQNRYGSFVEEDGQNFSGGEKQRLAIARALLSK
ADLYIFDEATSNLDSFSEQIIQDLIFNKIMDKTTIVVAHRLSTILRCDKICFLENGTIVEYGTHEELMAKNGKYARMVGL
QSVQVNQQIQSQAVLDTEEVTYG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
CPR_0658 YP_697985.1 lactococcin g processing and transport ATP-binding protein Virulence Not named Protein 2e-144 47