Name : cycK (Bgr_05150) Accession : YP_002971518.1 Strain : Bartonella grahamii as4aup Genome accession: NC_012846 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CycK Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 622067 - 624046 bp Length : 1980 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGCTTGTCGAACTGGGTCATATTTTTTTAGCTGCAGCATTTTCAGTAAGCTTATTAGGGGCGTTCTTACCTGCTTTAGG TTTTTGGTGGAGAGAGCGTTTGTTAATGCAAACAGCTGTTCCTCTAACATATATCACTTTTACATTACTGCTTTTATCTT TTTTAGTGATAATTTATGCTTATGTTGTATCTGATTTTTCTGTTTTGAACGTTGTTGAGAATTCTCATTCAGAAAAACCG ATGCTCTATAAAATTACCGGTGTTTGGGGCAACCACGAAGGCTCTATGTTGTTATGGGTTTTAAGTCTTGCTTTTTTTAG TGCATTGATGGCCTTTTTTAGCCAACATTTGCCAGAAGATTTTAAGACGCTTGTTTTAATTTGCCAAAGTTGGATTACAA GTGCTTTTCTTTTATTTATTCTTTTTGTATCCAATCCATTTTTACGTGTGAATCCACCAGCATTGCAGGGAAATGGTCTC AATCCTCTTTTACAAGATATCGCATTAGCAATTCATCCACCGCTACTTTATTTAGGTTATGTTGGTTTTTCACTCTGTTT TTCTTTTGCCGTTGCGGCATTGATTATGGGACATGTTGATAGAATTTGGGCGCGTGGGATTCGTCCGTGGCTTTTACTTT CTTGGTGTTTTTTAACATTGGGTATTATGGTTGGCTCCTATTGGGCTTATTATGAGCTAGGATGGGGGGGCTATTGGTTT TGGGATCCTGTTGAAAATGTTTCGTTTATGCCTTGGCTTTCAGGAACGGCTCTTTTACATTCTGCTCTTGTTCTCGAAAA ACGAGAAATATTGAAAAGTTGGACTTTGTTTTTAGCGCTGCTTACTTTTTCCCTTTCTCTGATGGGAACTTTTCTTGTGC GTTCGGGGCTTTTAGTTTCTGTTCATAGTTTTGCTGTTGATCCAGCACGGGGGCAAGCAATTCTTGCGCTTTTATTTTTT TTTACGGGAGCGGCTTTTCTTCTTTTTGCTTTGCGCACCCCTATTTTAAAAACAGAAAGATTTTTTCAACCAATTTCACG TGAAGGGTTTATTGTTTTAAATAACTTGTTACTTACAACAATAACAGCAACAGTATTGATTGGTACGCTTTATCCTTATT TTATTGAGATATTAACAGGACAAAAAATTTCTGTAGGGGCTGCTTTTTTTAACCTTACCTGTGGACCGCTAATGGTTTTT CTGTTGTTGTTTGTTCCGTTTGGGACAATGATGGCATGGAAACGCGGTGATTTGCTGGCAGTTTTTGAACGGTTGTGGTT GGTTTTTGTATTGGTTGGTATCGTCTGTTTTATAATATTTTATGAGACATCTTTGCGTGATATTTTCGCAGTTTTAGGGA TTGGGCTTTCAGCGTTTGTTTTTTTAGGAAGTTTAGCGGATCTATGGGGAAAGAGTGGATATGGCAAGAGAGCTTTTTCA GTACGCGTTAAGAGATTTCTTGGATTGCCATGGTCTACTTTTGGTGCAGCAATAGCACATATGGGATTAGGTGTTACATT ACTTGGTATTGTTTGTGTGGCAAGTTTTGGGCAAGAACGTATTTTAATCATGAACGTAGGGGATAGGGTGACGATAGCGG ATAAAACGCTTCATTTTGATGCAGTGTATGAAGGTGTTGGTTCGAATTATTCGGCAATGGAGTTTTATTTTAAAATATAT GAAAATAAAAACATTGTGGGTCATGTAACAGCCTCAAAGCGATTTTATTCAAGCCAAAATACATCAACAACAGAAGTTGG TCTTCAAAATCATGGCTTATCGCAGCTATATATTGTACCAGGACATACCGATAATCGGGGTCTTGTTGTACACATATGGT GGAAGCCTTATGTAATATGTATTTGGTTAGGGGCATTCATGATGGCTGTAGGCGGATGTCTTTCTCTTCTGGGGTATTGG TTTCGCATTGGCATGTACAATAGGGTACTGCTTGCTTTAAATTTTTGGAAAAGACATTGA Protein sequence : MLVELGHIFLAAAFSVSLLGAFLPALGFWWRERLLMQTAVPLTYITFTLLLLSFLVIIYAYVVSDFSVLNVVENSHSEKP MLYKITGVWGNHEGSMLLWVLSLAFFSALMAFFSQHLPEDFKTLVLICQSWITSAFLLFILFVSNPFLRVNPPALQGNGL NPLLQDIALAIHPPLLYLGYVGFSLCFSFAVAALIMGHVDRIWARGIRPWLLLSWCFLTLGIMVGSYWAYYELGWGGYWF WDPVENVSFMPWLSGTALLHSALVLEKREILKSWTLFLALLTFSLSLMGTFLVRSGLLVSVHSFAVDPARGQAILALLFF FTGAAFLLFALRTPILKTERFFQPISREGFIVLNNLLLTTITATVLIGTLYPYFIEILTGQKISVGAAFFNLTCGPLMVF LLLFVPFGTMMAWKRGDLLAVFERLWLVFVLVGIVCFIIFYETSLRDIFAVLGIGLSAFVFLGSLADLWGKSGYGKRAFS VRVKRFLGLPWSTFGAAIAHMGLGVTLLGIVCVASFGQERILIMNVGDRVTIADKTLHFDAVYEGVGSNYSAMEFYFKIY ENKNIVGHVTASKRFYSSQNTSTTEVGLQNHGLSQLYIVPGHTDNRGLVVHIWWKPYVICIWLGAFMMAVGGCLSLLGYW FRIGMYNRVLLALNFWKRH |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 6e-64 | 41 |