|
Name : NT05HA_0041 (NT05HA_0041) Accession : YP_003006576.1 Strain : Aggregatibacter aphrophilus NJ8700 Genome accession: NC_012913 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 41028 - 42938 bp Length : 1911 bp Strand : + Note : identified by Glimmer3; putative DNA sequence : ATGATCCCCGAACTAGGCTTTCTTTCTCTTCTTCTTGCTACGATGAGTGCGTTGCTTCTCGCCGTTGTTCCACAACTTGG GCTTTGGTTGCGTAAGCCCTCGCTTACCCAATTGGCTTGGGGATTAAGCTATTGTTTCGGCTTATTTACTTTAGCCGCCA TTGCTATTTTGGCGTATTCCTTTGCGGCCGATGATTTTACGTTGGAATATGTCGCAGCCCATTCGAATTCTCAATTGCCG ACTTTCTTTAAAATTGCGGCAACTTGGGGTGGGCATGAAGGCTCGATGTTGTTTTGGTTATTTTCACTTTCTGTCTGGGT AGTGTTGTTTGCATTATTTAACCGAAAAAATGACCGCACTTTTGTGGCACAGAGCTTGGTGATTTTAGGCTTGATTTGTT TTAGCTTTGCGGTTTTTATCGTCTTTTTCTCCAATCCATATGGACGCATATTTCCCGCACCGTTGGAAGGACGTGATCTG AACCCGATGTTGCAGGATGTGGGGCTTATTTTCCATCCGCCGTTGTTGTATCTCGGTTATGTTGGCTTTGCCGTAAATTT TGCCTTGAGTATTACTGCATTGTTGCATCAACATTTAGAAAGCCAAATTGCCCGCGTGATGCGAGTTTGGGTATTGGTCT CTTGGTTGTTTTTAACGTTAGGTATTGTGCTAGGGGCGTGGTGGGCATATTACGAACTTGGCTGGGGCGGTTGGTGGTTC TGGGACCCGGTAGAAAACGCTTCATTAATGCCTTGGTTATTAGGTTTGGCCCTGTTACATAGTTTAATTGTCAGTGAAAA ACGGGGCATCTTTAATTATTGGACAACGCTTTTCTCGCTGTTAGTGTTCGCTTTCAGTGTACTCGGCACCTTTATCGTGC GCTCAGGTGCATTGACTTCTGTACATGCTTTCGCAGTCGATAGCCAGCGTGGCACCGCATTACTTGTGATTTTCTTCCTG TTGACTGTCGGGGCGCTCGGTCTGTTTGCTTTCAAAGCGAATATGCAGCAACAATCTGTGAAATTAAAGTTACTTTCCAA AGAAAGTGCGGTGCTTTTTTTGAATGTTTTATTGAGCATCGCTACTGTCAGCACGTTTCTTGGTACCTTCTACCCGATGC TATTCCAGGCCATGAATTGGGGCTCTATTTCTGTCGGTGCGCCTTACTTTAACTGTATTTTCATTCCGCTGATTGCGTTG GTGTTAATTACCATGGTGATTTCGCTCGGATTGTATTGGGCGAAAGCGGATAAACGCATTTTATTAAAACGTGCGGTATT ATTGTTGCCGTCTTTGTTGCTTTCCTATTTAGCCATTCACCACTTTATGCAAAATGACAGTGCGTTACAGTTCAAATGGA CAGCCTATTTCCTACTAACCTTAGCGATTTGGCTGTTATTGGCGACATTGTGGCAAAACTGGCGTAAGTTAGGTCTTTCT CACTATGCGATGATTTTTGCGCATAGCGGTGTTGCCATTGCAACGATGGGCGCTGTGATGAGTAGTTATTTCGGAAGTGA AATTGGTGTACGTTTATCGCCACAACAAAACCAACAACTTGGTGCATTTAATTTTCACTATGAACGATTTTCCAATGAAA TCGGCCCGAATTTTACGGCTGAAGTGGCGACGTTTAGCGTGACAGAAAATAGTAAGCCGTATGCCGAATTACAGCCGGAA CGCCGTTATTATGATGTGCGTACCATGACCATGAGTGAAGTGGGACTGTCCGGCGGTTTTTGGGGCGATTTGTATATTGT TATGGGGGATCCGCTCGGTAAGGGAAAGTTTACGTTCCGCCTTCATTATAAACCGTTGATTCGTTGGTTGTGGTTCGGCG GTGTATTGATGGCATTTGGTGCATTGTGTTCTGTATTGACGATGAAGCGAAGAGGAAAACGTGATGAATAG Protein sequence : MIPELGFLSLLLATMSALLLAVVPQLGLWLRKPSLTQLAWGLSYCFGLFTLAAIAILAYSFAADDFTLEYVAAHSNSQLP TFFKIAATWGGHEGSMLFWLFSLSVWVVLFALFNRKNDRTFVAQSLVILGLICFSFAVFIVFFSNPYGRIFPAPLEGRDL NPMLQDVGLIFHPPLLYLGYVGFAVNFALSITALLHQHLESQIARVMRVWVLVSWLFLTLGIVLGAWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLLGLALLHSLIVSEKRGIFNYWTTLFSLLVFAFSVLGTFIVRSGALTSVHAFAVDSQRGTALLVIFFL LTVGALGLFAFKANMQQQSVKLKLLSKESAVLFLNVLLSIATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGAPYFNCIFIPLIAL VLITMVISLGLYWAKADKRILLKRAVLLLPSLLLSYLAIHHFMQNDSALQFKWTAYFLLTLAIWLLLATLWQNWRKLGLS HYAMIFAHSGVAIATMGAVMSSYFGSEIGVRLSPQQNQQLGAFNFHYERFSNEIGPNFTAEVATFSVTENSKPYAELQPE RRYYDVRTMTMSEVGLSGGFWGDLYIVMGDPLGKGKFTFRLHYKPLIRWLWFGGVLMAFGALCSVLTMKRRGKRDE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 3e-96 | 43 |
