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Name : plnG (JDM1_0354) Accession : YP_003061940.1 Strain : Lactobacillus plantarum JDM1 Genome accession: NC_012984 Putative virulence/resistance : Virulence Product : bacteriocin ABC-transporter, ATP-binding and permease protein PlnG Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 374218 - 376368 bp Length : 2151 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCATTGGAGAAACTATGTTGCGCAAGTTGACGAGATGGACTGTGGGGTCGCAGCTTTAGCAATGATTTTGAAAAATTA TGGTTCGACAACATCATTGGCCTATCTAAGAAATATTGCTAAAACGAGTTTAGAAGGGACTACGGCATTAGGATTAGTAA AAACGGCCGAAAAGTTAGGTTTTGAAACCAAAGCAATTCAAGCAGATATGAGTCTTTTCGAGGTACAAGATTTACCATTG CCATTCATTGTGCATGTTACCAAAAATGGGGATCTACAGCATTTTTATGTCGTTGTAAAAACCTCGAAAACACATGTCGT GATTGCTGATCCGGACCCAACAGTTGCGGTTATCAGTATGTCAAAGGAACGGTTTGAAAGCGAATGGTCCGGAGTTGCCC TTTTCTTTGCACCGAAGTCGGAATATAAGCCAGTTAAGCAAGATAAGGGCTCACTATGGGGATTTATTCCAAGCTTATTA AAGCAGCGCCGACTGGTTATTAATATTGTGCTTGCTGCAGTTTTAATCACGATTATTAGTATCTGTGGGTCTTATTTCTT ACAAGCGGTGATTGATACTTATATTCCCAATAATATGCACAGTACATTGGCAGTGGTGGGCATTGGTCTAATCGTTTTTT ATACCTTTCAGGCTATCTTTACTTATGCCCAGAATTTTTTATTGGCGGTTTTAGGTCAACGACTTTCGATTGAAATTATT TTAGGCTATATTCGGCACGTCTTTGAATTGCCAATGAGTTTTTTTGCCACTCGGCGGACGGGGGAAATTGTTTCGAGGTT TACGGATGCCAGTAAGATTATTGATGCGTTAGCTAGCACAATTGTTTCGCTGTTTTTAGATGTCAGCATCGTTATTATTA TGGGGGCAATCTTGGTAATCCAGAATATGACACTTTTTTGGATTACGTTACTCTCGTTGCCAATCTACGCGGTTGTCATC TTAGCCTTTAATAAATCCTTTGAACGATTGAATCAAAAGGAAATGGAGAGCAATGCTATTTTGAGTTCAGCCATTATTGA GGATCTTCATGGGATTGAAACTGTTAAGGCGCTGAATGGTGAGACGGAACGTTATCAGAAAATTGATTCAGAATTTGTTG ATTATCTACGTAAGAGTTTGGCCTATCTTAAAGCGGATACTTTGCAACAGGCATTAAAACTGTTTATACAGTTAGTCTTA GAAGTTGTTGTTCTATGGGTGGGCGCCAATCTCGTCATTCATAATCAGTTATCAGTTGGGGAGCTCATGACATATAATGC TTTATTAGCCTATTTTGTTAATCCACTACAGAATATTATTAATTTGCAGACTAAGCTTCAAAGCGCTAAGGTCGCTAACA ACCGGTTAAATGAAGTGTATTTGGTCGCTAGTGAATTTGAGGCGTCACGGCCAATTCATAATGAAAGTCAATTAAATGGT GATATTAAGTTACAAGGGGTCAGCTATCGTTATGGTTACGGTGAAAATGTCTTAGATGATGTTAATTTGACGATTCGACA ACATGATAAGGTTGCAATTGTGGGGATGAGTGGCTCTGGCAAGTCCACGTTAGTTAAATTGCTTATTGATTTTTATCAAC CAAATAGTGGTGATGTCATATTGAACGGCTTCAACGTTAAGAACATCGATAAGCATACATTGCGGACCCATATTAACTAC ATCCCGCAGGAACCATACATCTTTTCAGCGACCATTGAAGAAAATTTAAGATTAGGTAATCGCAGCGGTATTACTGAGAA AGATATTGCGAAGGCTTGCCAATTGGCGTTAATTGATACGGATATTAATAAAATGGCCATGCAATACCAAACTAAGCTAG ATGAGAATGGTAATACACTATCAGGTGGTCAGCGACAACGATTAACGATTGCGAGAGCGTTATTATCACCCGCTCAAGTA TTGATATTTGATGAGTCGACGAGTGGACTGGATGCAATTACTGAAAAACAATTAATCGATAATTTAGTGGCAATGACTGA CAAGACGATTATTTTTATTGCCCACCGGTTGTCGATTGCAAAGCGGACGAATCATATCATCGTTCTGCATGATGGTCGGG TCGCTGAAGAGGGGACCCATGCGGCATTGTTGAATGAACATGGTTACTATTACGACTTGATCAATAGCTGA Protein sequence : MHWRNYVAQVDEMDCGVAALAMILKNYGSTTSLAYLRNIAKTSLEGTTALGLVKTAEKLGFETKAIQADMSLFEVQDLPL PFIVHVTKNGDLQHFYVVVKTSKTHVVIADPDPTVAVISMSKERFESEWSGVALFFAPKSEYKPVKQDKGSLWGFIPSLL KQRRLVINIVLAAVLITIISICGSYFLQAVIDTYIPNNMHSTLAVVGIGLIVFYTFQAIFTYAQNFLLAVLGQRLSIEII LGYIRHVFELPMSFFATRRTGEIVSRFTDASKIIDALASTIVSLFLDVSIVIIMGAILVIQNMTLFWITLLSLPIYAVVI LAFNKSFERLNQKEMESNAILSSAIIEDLHGIETVKALNGETERYQKIDSEFVDYLRKSLAYLKADTLQQALKLFIQLVL EVVVLWVGANLVIHNQLSVGELMTYNALLAYFVNPLQNIINLQTKLQSAKVANNRLNEVYLVASEFEASRPIHNESQLNG DIKLQGVSYRYGYGENVLDDVNLTIRQHDKVAIVGMSGSGKSTLVKLLIDFYQPNSGDVILNGFNVKNIDKHTLRTHINY IPQEPYIFSATIEENLRLGNRSGITEKDIAKACQLALIDTDINKMAMQYQTKLDENGNTLSGGQRQRLTIARALLSPAQV LIFDESTSGLDAITEKQLIDNLVAMTDKTIIFIAHRLSIAKRTNHIIVLHDGRVAEEGTHAALLNEHGYYYDLINS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 5e-130 | 41 |
