Gene Information

Name : sdcS (BpOF4_05525)
Accession : YP_003426059.1
Strain : Bacillus pseudofirmus OF4
Genome accession: NC_013791
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : sodium:dicarboxylate cotransporter DASS family
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0471
EC number : -
Position : 3366587 - 3368251 bp
Length : 1665 bp
Strand : +
Note : COG0471 Di- and tricarboxylate transporters

DNA sequence :
ATGAAAAGTATGGTAGCGAATGTTTGGAACGGCCTGTGGAACTCACACCGCCAAACGAAGAATTTGCTCAATGTCTTTTC
CTATCAAAAAGGATCAGCTGCAAAAGCTGCAAATGCAAGCGCCACGAACGCACGTGAGGGGCAGTCGATGCAGCCGCAGA
ATAATGATAATGAACCGAAAAATTCGTATTCAAAAGCACAAATGATCGGACTGATTTTAGGTCCAGCACTCTTTTTACTT
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TATGATTGCTACAGCATTTTTATCAATGTGGGTATCGAATACGGCAGCCGTTATGATGATGGTGCCGATGGGACTTGCTA
TCACGGCTCAAGTAGCAGCAGCTCTTAAAGGAAAGCCTGAAGAGCGCGACTTGCCGAAATTTGAAAAAGCGCTGATCTTC
GGTGTAGGTTATGCGGGTACAATCGGTGGTCTTGGTACGTTAATCGGGACGCCGCCAAATATTATTTTAGCTGCACAAGC
ACAGCAATTATTTGATGTTGAAATTTCATTTGCAAGATGGATGATGGTCGGGGTTCCTGTTGTTATTCTTCTCTTAGTCA
GTGCCTGGATGTACCTTGGACGTGTGGCATTTAAGATGAGTATCACAGGCCTTCCTGGAGGCAAAAATTTAATTCAAAGC
GAGCGCTCTAAGCTTGGAAAAACGTCATTTGAAGAAAAAGCTGTAGCTGCTGTATTCTCGTTTGCTGCATTCATGTGGAT
CTCCCGCGAATTTATCTGGGTCGATCTTGTTCCTGAATTACGTGATGGTATGATTGCCGTATTAGCCGCTGTTATGCTGT
TTGTCATTCCAACTTCACGTAAATTTGGTTCTCGTATTTTAGAATGGAAAGACTCGCGTGATATTCCTTGGGGCGTGCTT
CTTCTATTCGGGGGCGGTCTTGCGATTGCTGCTGGATTTAGAGAAACAGGCTTATCTGATTGGATGGGTACGCAGCTTAC
AGTCCTTGACGGCTTGCACTTAATCGTCATGATCGCTGCAACAGCTCTATTCGTTCTATTCTTAACAGAGATCACATCAA
ACACAGCGACAGCGACAATGATTATTCCAGTTGTTGCGTCCCTTGCACTAGCGTTAAATATTCACCCATTCGCCCTCATG
ATTCCTTGTGCGATGGCTGCTAACTGTGCATTTATGCTTCCGGTTGGTACCCCGCCAAATGCGATCATTTTCGGTACGGG
GAAATTAAAAATTATCGAAATGGTACGAGTCGGGTTCTTAGTTAACCTTATCGCTGCAGTATTGATTGTCCTTGCCGTGT
ACTTCATGGTGCCGCTATTCTGGGGCATTGATCTAAATGTAGTACCAGCTGGATTCAGCTTATAA

Protein sequence :
MKSMVANVWNGLWNSHRQTKNLLNVFSYQKGSAAKAANASATNAREGQSMQPQNNDNEPKNSYSKAQMIGLILGPALFLL
TILFFSPEGLSFEARAVLAITLWVATWWITEAIPIPATSILPIFLLPITGALDGGTVTSAYGDDIIFLFLGGFFIATAME
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• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
DIP0179 NP_938571.1 hypothetical protein Not tested Not named Protein 1e-59 41