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Name : ccmF (LLO_1965) Accession : YP_003455435.1 Strain : Legionella longbeachae NSW150 Genome accession: NC_013861 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome C-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 2314799 - 2316748 bp Length : 1950 bp Strand : - Note : equals llo1965 DNA sequence : ATGATTGCAGAATTAGGATTGTTTTCGTTAATTTTGGCTTTGATTGCCTCCATCATGTTGGCTGTGATTCCTTTAGCTGG GGTGCAATTGAATCGTAACGACTGGATGAATGCCGCCAGGGTATATGCAGTTTGTCAGTTTTTCTTTATTGCCCTGTCAT ATTTGATGCTTACCCTGTGTTTTTTGCAGGATGATTTTTCAGTGATTTATGTGGTGAGTAATTCAAGTATTTCCTTACCC TGGTTTTATAAACTTTGTGCCGTGTGGGGTGGGCATGAAGGATCTATGCTCTTGTGGGTTTTAATTCTTGGTTTCTGGAC TTTGTTGGTTGCTTTTTTCAGTTCTGGTCTTGATAGGGAGATGCGTACACGGGTTTTAGTAGTTTTAGGCTGGTTGAGTA TTGGATTTATTCTTTTTTTATTGATCACATCCAATCCTTTTTTACGTCAATTTCAAGTTTTAAATACACAAGGACGTGAT TTGAACCCATTGTTACAAGATCCCGGATTTTTATTTCATCCCCCTATGTTGTATATGGGGTATGTTGGTTTTTCTGTGGC CTTTGCATTTGCAATTGCTGCGCTTTGGGCTGGTAAAGTAGAGTCAAGTTGGTCAAAATGGACAAGGCCTTGGACACTGG CTGCATGGTGTTGTTTAACAGCTGGAATTACATTAGGAAGCTGGTGGGCTTATCGCGAGTTAGGCTGGGGAGGATGGTGG TTTTGGGATCCTGTTGAAAATGCTTCATTTATGCCTTGGTTAGTAGGTACAGCTTTATTACATTCTCTAGCGGTAACAGA ACAACGGCAACAATTTAAAGCATGGACTATGTTACTTGCTATTGCTGCCTTTTCTTTAAGTCTAATTGGTACTTTTCTAG TTCGCTCAGGTGTTCTAACTTCGGTGCATGCCTTTGCTGTTGATCCTCAACGTGGATTATATATTTTAGGGTTTTTACTC TTTGTTATTGGCGGCTCGTTGGTATTATTTCTTTTTAGAGCACAAACATTACATTCAGAAAATAATCCAAGTCCATTTTC TCGGGAAAGTGCTTTATTATTAAATAATGTTTTTTTAGTGGTTATTATGCTTACTGTTTTAATGGGCACAGTTTATCCAC TTCTTATAGAGGGTTTAGGATTAGGTAAATTATCTGTAGGGGCTCCTTATTTTAATTCTGTATTTGTTCCTTTGATGGTT CCAATGTTGTTATTAATGGGCGTTGGTATTCATTTAAAATGGAATAAAGATAATTGGCGGGTAGTATTAAAAAAATTTTT GGGAACGGCCGCGCTGAGTTTATTGATTCCTTTTGTTTTATTAATGGGCACCAAGAAATTTGATGCTTCTGCTTATATGG GATTGTGTTTGTCTTTTTGGGTGATTTTAAGTACGGCTCAGGCAGCATATAAACGAGTCACTGAACGGGGTTTAAGCCAT GTGGGACAAGCATACTGGGGTATGGTTTTGGCTCATTTGGGCGTTGCTGCTACAGTAATTGGTATTGCCGTTTCTACTGC TTATGGAGTAGAAGATGATGTGCAGATGGCGCCAGGAAAAAAAGTATATTTGCTTGGTTACTCTATAGAGTTTATGCACC AAGAGCCGCTTATTGGCCCAAATTACAAAGGCACTAGGGCTCAATTTAAAATAAGCAATAATGGCAAAGCGAGAGTTATT TATCCTGAAAAAAGACTTTATACTGTAGGTCAAATGGCTATGACAGAATCTGCAATTGATGTGACGCCATTTAGGGATAT TTATGTGGCTTTGGGAGAACCTTTATCCAATGACTCATGGTCTGTACGACTTTATTATAAACCTTTTATCCGTTGGATTT GGTTTGGTGGTTTTATGATTTTAGCTGGTGGTTTTCTTGCCCTGACCGATAAACGCTATTATCAACGACGTCGTTCGGTA GTTGTAGGCGTTGAGGAGCTTAGCGTATGA Protein sequence : MIAELGLFSLILALIASIMLAVIPLAGVQLNRNDWMNAARVYAVCQFFFIALSYLMLTLCFLQDDFSVIYVVSNSSISLP WFYKLCAVWGGHEGSMLLWVLILGFWTLLVAFFSSGLDREMRTRVLVVLGWLSIGFILFLLITSNPFLRQFQVLNTQGRD LNPLLQDPGFLFHPPMLYMGYVGFSVAFAFAIAALWAGKVESSWSKWTRPWTLAAWCCLTAGITLGSWWAYRELGWGGWW FWDPVENASFMPWLVGTALLHSLAVTEQRQQFKAWTMLLAIAAFSLSLIGTFLVRSGVLTSVHAFAVDPQRGLYILGFLL FVIGGSLVLFLFRAQTLHSENNPSPFSRESALLLNNVFLVVIMLTVLMGTVYPLLIEGLGLGKLSVGAPYFNSVFVPLMV PMLLLMGVGIHLKWNKDNWRVVLKKFLGTAALSLLIPFVLLMGTKKFDASAYMGLCLSFWVILSTAQAAYKRVTERGLSH VGQAYWGMVLAHLGVAATVIGIAVSTAYGVEDDVQMAPGKKVYLLGYSIEFMHQEPLIGPNYKGTRAQFKISNNGKARVI YPEKRLYTVGQMAMTESAIDVTPFRDIYVALGEPLSNDSWSVRLYYKPFIRWIWFGGFMILAGGFLALTDKRYYQRRRSV VVGVEELSV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 3e-117 | 54 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-119 | 52 |
