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Name : lysS (MHR_0531) Accession : YP_003856526.1 Strain : Mycoplasma hyorhinis HUB-1 Genome accession: NC_014448 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Lysyl-tRNA synthetase 1 Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : - Position : 646964 - 648442 bp Length : 1479 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTCTATAAATAAATTATCAGAGCAAGAATTAGTAAGGCAAAAAAAAGTTGAGTTATTAAATAAAAAAAACATTCCAGC TTATTCAGAAACTAAATTAGAAAATACTAATTGGCAAGAAGTAGTTGCTGAATTTGATGTTTTTAGTAAAGAAGAACTTG AACAAAAAAGTGTTAATATCAATGTTGCAGGTCGTATAGTTGCAATGCGTGGACCTTTTATAATTATTAATAGTTATTTT GATAAAATTCAACTTTATTATGATAAAAAATTACTTCAAATCGAAGAAAATAAAGACTTATTTGAACTTCTTGACTTGGG TGATATTATCCAAGCACAAGGTGTTGTTTTTAAAACTAAAACCAATGAATTGTCTTTAAAAGTAAATAAACTACAACTTC TTACTAAAGCTTTAAAACCCTTGCCTGATAAATTCCATGGAATTAATGATGTTGATGAAAAATATAGAAAACGTTATTTA GATTTAATCTCAAATCCAGAAACAAAACAAGTTTTTTTCACCAGAACAAAAATTATTTCTTTAATTAGACAGTTTTTAGA TAACCTCAATTATATGGAAGTTACTACTCCGATTTTACAATCTTTATTAACAGGAGCTAGCGCTCGTCCCTTTACTACTT TTTATAATTCGTTACATGCAAATTTTTATTTAAGAATAGCAACAGAATTACCACTTAAAAAATTATTAGTAGGTGGTTTA GATCGAGTTTATGAAATTGGAAAAATCTTTAGAAATGAAGGAGTGGATACAACTCACAATCCTGAATTTACTTCAATAGA GTTTTATGAGGCATATGCTAATTTAGAAACAATGATGGAAAGAACAGAAGCAATTTTCAAATTTTTAGTTGATAAATTAA ACATTAAAAATAAAAAAATTGTTTTTAGTGAGTACGAAATTGATTTTAATTTACCATTCAATAAATTTGATTTAGTAGAT AAAACTTCGGAAATTTTAGGAATTAATTTAAAAACACAATCATTTGAACAGTTAAAAGCTATTGCTCAAACACACAATAT CAAAATTGAAAAATTTTATCAATCAGGTCATATTATTAATGCTCTTTTTGAAGAATTTGTTGAACCCAAACTTATTCAGC CAACTTTTGTTTATGGACATCCTATTGAAATTTCTCCATTAGCTAAAAAAGATGAAAAAGATCCTCGTTTCACACAAAGA GCAGAACTTTTTATTGCTAAAAAAGAATTTGCTAATATGTTTAATGAATTAAATGATCCTGAGGATCAATTACAGCGTTT TGAAAATCAAATAAAAGAAAAAGATTTAGGAAATGAAGAAGCAAATGAAATTGACTATGATTTTGTTGATTCTTTAAAAT ACGGAATGCCACCAGCTGGTGGCTGTGGAATAGGAATTGACAGACTTGTAATGCTCTTAACTTCCAAAACATCTATTCGT GAAGTAATTTTATTTCCACAATTAAAGGCTAAAAAATAA Protein sequence : MSINKLSEQELVRQKKVELLNKKNIPAYSETKLENTNWQEVVAEFDVFSKEELEQKSVNINVAGRIVAMRGPFIIINSYF DKIQLYYDKKLLQIEENKDLFELLDLGDIIQAQGVVFKTKTNELSLKVNKLQLLTKALKPLPDKFHGINDVDEKYRKRYL DLISNPETKQVFFTRTKIISLIRQFLDNLNYMEVTTPILQSLLTGASARPFTTFYNSLHANFYLRIATELPLKKLLVGGL DRVYEIGKIFRNEGVDTTHNPEFTSIEFYEAYANLETMMERTEAIFKFLVDKLNIKNKKIVFSEYEIDFNLPFNKFDLVD KTSEILGINLKTQSFEQLKAIAQTHNIKIEKFYQSGHIINALFEEFVEPKLIQPTFVYGHPIEISPLAKKDEKDPRFTQR AELFIAKKEFANMFNELNDPEDQLQRFENQIKEKDLGNEEANEIDYDFVDSLKYGMPPAGGCGIGIDRLVMLLTSKTSIR EVILFPQLKAKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 1e-89 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_003856526.1 | Lysyl-tRNA synthetase 1 | VFG1668 | Protein | 8e-90 | 42 |
