Name : plnG (LPST_C0351) Accession : YP_003923669.1 Strain : Lactobacillus plantarum ST-III Genome accession: NC_014554 Putative virulence/resistance : Virulence Product : bacteriocin ABC-transporter, ATP-binding and permease PlnG Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 368888 - 371038 bp Length : 2151 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCATTGGAGAAACTATGTTGCGCAAGTTGACGAGATGGACTGTGGGGTCGCAGCTTTAGCAATGATTTTGAAAAATTA TGGTTCGACAACATCATTGGCCTATCTAAGAAATATTGCTAAAACGAGTTTAGAAGGGACTACGGCATTAGGATTAGTAA AAACGGCCGAAAAGTTAGGTTTTGAAACCAAAGCAATTCAAGCAGATATGAGTCTTTTCGAGGTACAAGATTTACCATTG CCATTCATTGTGCATGTTACCAAAAATGGGGATCTACAGCATTTTTATGTCGTTGTAAAAACCTCGAAAACGCATGTCGT GATTGCTGATCCGGACCCAACAGTTGCGGTTATCAGTATGTCAAAGGAACGGTTTGAAAGCGAATGGTCCGGAGTTGCCC TTTTCTTTGCACCGAAGTCGGAATATAAGCCAGTTAAGCAAGATAAGGGCTCACTATGGGGATTTATTCCAAGCTTATTA AAGCAGCGCCGACTGGTTATTAATATTGTGCTTGCTGCAGTTTTAATCACGATTATTAGTATCTGTGGGTCTTATTTCTT ACAAGCGGTGATTGATACTTATATTCCCAATAATATGCACAGTACATTGGCAGTGGTGGCCATTGGTCTAATCGTTTTTT ATACCTTTCAGGCTATCTTTACTTATGCCCAGAATTTTTTATTGGCGGTTTTAGGTCAACGACTTTCGATTGAAATTATT TTAGGCTATATTCGGCACGTCTTTGAATTGCCAATGAGTTTTTTTGCCACTCGGCGGACGGGGGAAATTGTTTCGAGGTT TACGGATGCCAGTAAGATTATTGATGCGTTAGCTAGCACAATTGTTTCGCTGTTTTTAGATGTCAGCATCGTTATTATTA TGGGGGCAATCTTGGTAATCCAGAATATGACACTTTTTTGGATTACGTTACTCTCGTTGCCAATCTACGCGGTTGTCATC TTAGCCTTTAATAAATCCTTTGAACGATTGAATCAAAAGGAAATGGAGAGCAATGCTATTTTGAGTTCAGCCATTATTGA GGATCTTCATGGGATTGAAACTGTTAAGGCGCTGAATGGTGAGACGGAACGTTATCAGAAAATTGATTCAGAATTTGTTG ATTATCTACGTAAGAGTTTAGCCTATCTTAAAGCGGATACTTTGCAACAGGCATTAAAACTGTTTATACAGTTAGTCTTA GAAGTTGTTGTTCTATGGGTGGGCGCCAATCTCGTCATTCATAATCAGTTATCAGTTGGGGGGCTCATGACATATAATGC TTTATTAGCCTATTTTGTTAATCCACTACAGAATATTATTAATTTGCAGACTAAGCTTCAAAGCGCTAAGGTCGCTAACA ACCGGTTAAATGAAGTGTATTTGGTCGCTAGTGAATTTGAGGCGTCACGGCCAATTCATAATGAAAGTCAATTAAATGGT GATATTAAGTTACAAGGGGTCAGCTATCGTTATGGTTACGGTGAAAATGTCTTAGATGATGTTAATTTGACGATTCGACA ACATGATAAGGTTGCAATTGTGGGGATGAGTGGCTCTGGCAAGTCCACGTTAGTTAAATTGCTTATTGATTTTTATCAAC CAAATAGTGGTGATGCCATATTGAATGGCTTCAACGTTAAGAACATCGATAAGCATACATTGCGGACCCATATTAACTAC ATCCCGCAGGAACCATACATCTTTTCAGCGACCATTGAAGAAAATTTAAGATTAGGTAATCGCAGCGGTATTACTGAGAA AGATATTGCGAAGGCTTGCCAATTGGCGTTAATTGATACGGATATTAATAAAATGGCCATGCAATACCAAACTAAGCTAG ATGAGAATGGTAATACACTATCAGGTGGTCAGCGACAACGATTAACGATTGCGAGAGCGTTATTATCACCCGCTCAAGTC TTGATATTTGATGAGTCGACGAGTGGACTGGATGCAATTACTGAAAAACAATTAATTGATAATTTAGTGGCAATGACTGA CAAGACGATTATTTTTATTGCCCACCGGTTGTCGATTGCAAAGCGGACGAATCATATCATCGTTCTGCATGATGGTCGGG TCGCTGAAGAGGGGACCCATGCGGCATTGTTGAATGAACATGGTTACTATTACGACTTGATCAATAGCTGA Protein sequence : MHWRNYVAQVDEMDCGVAALAMILKNYGSTTSLAYLRNIAKTSLEGTTALGLVKTAEKLGFETKAIQADMSLFEVQDLPL PFIVHVTKNGDLQHFYVVVKTSKTHVVIADPDPTVAVISMSKERFESEWSGVALFFAPKSEYKPVKQDKGSLWGFIPSLL KQRRLVINIVLAAVLITIISICGSYFLQAVIDTYIPNNMHSTLAVVAIGLIVFYTFQAIFTYAQNFLLAVLGQRLSIEII LGYIRHVFELPMSFFATRRTGEIVSRFTDASKIIDALASTIVSLFLDVSIVIIMGAILVIQNMTLFWITLLSLPIYAVVI LAFNKSFERLNQKEMESNAILSSAIIEDLHGIETVKALNGETERYQKIDSEFVDYLRKSLAYLKADTLQQALKLFIQLVL EVVVLWVGANLVIHNQLSVGGLMTYNALLAYFVNPLQNIINLQTKLQSAKVANNRLNEVYLVASEFEASRPIHNESQLNG DIKLQGVSYRYGYGENVLDDVNLTIRQHDKVAIVGMSGSGKSTLVKLLIDFYQPNSGDAILNGFNVKNIDKHTLRTHINY IPQEPYIFSATIEENLRLGNRSGITEKDIAKACQLALIDTDINKMAMQYQTKLDENGNTLSGGQRQRLTIARALLSPAQV LIFDESTSGLDAITEKQLIDNLVAMTDKTIIFIAHRLSIAKRTNHIIVLHDGRVAEEGTHAALLNEHGYYYDLINS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 4e-129 | 41 |