Name : HIBPF11730 (HIBPF11730) Accession : YP_004135624.1 Strain : Haemophilus influenzae F3031 Genome accession: NC_014920 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein ccmf Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1117630 - 1119576 bp Length : 1947 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTGCTGAATTAGGAAATTATGCGCTGGCTTTAAGTTTAGCTGTATCGCTTATGTTGGCGATTTTCCCTTTGTGGGG GGCGGAAAAGGGCAATGCACAATTAATGGCATTAGCTCGCCCAATGACTTATGGTTTATTTGCAAGCCTAAGCATTGCTT TTGCTGCGCTATTTTATCTATTCGCAGTCAATGATTTTAGCGTGCAATATATTGTAAATAATTCTAATACTACTTTACCC ATTTATTATCGTTTATCTGCGGTATGGGGTTCCCATGAAGGCTCTTTGTTACTGTGGATTTGGTTACTGGCGGTTTGGTC ATTTGCCGTTGCTTTATTGAGTAAACATTTACCCCAAGAAGCGGTTGCTCGCGTGCTTGGTATTATGGGGATTATTAGCG TCGGTTTTGTATTGTTCGTCTTGTTTACCTCAAATCCTTTCACGCGTACTTTCCCAGATTTCCCAGTAGATGGAAAAGAA CTTAATCCAATGTTGCAAGATGTAGGCTTGATTTTCCACCCTCCATTACTTTATATGGGCTATGTGGGTTTTTCGGTGGC ATTTGCGTTTGCGATTGCATCCTTAATGACTGGAAAATTAGATTCAGCTTGGGCTCGTTGGTCACGTCCTTGGACGCTTG CTGCTTGGGTGTTTTTAACTTTAGGTATCGTACTCGGTTCTTGGTGGGCTTATTATGAGCTTGGCTGGGGGGGCTGGTGG TTCTGGGATCCAGTAGAAAACTCATCGTTTATGCCGTGGCTTGCTGGTACTGCATTGATTCACTCTCTTTCTGTGACAGA AAAACGTGGTTCTTTCAAAGCTTGGACGGTATTACTTGCGATTTTAGCCTTTTCACTTTGTCTGCTCGGCACCTTCTTAG TTCGTTCTGGTATCTTAGTTTCAGTTCACGCATTTGCATCGGATCCAACTCGTGGTTTGTATATTTTGGCTTACCTCGTT GTGGTAATTGGCGGTTCGCTTGCACTCTATGCGTATAAAGGCAGTCAAATTCGTTCTCGTGATAATGCAGAACGCTATTC ACGTGAAAGTATGTTGTTATTAAATAATATCTTATTAATGACCGCACTTTGCGTTGTATTCTTAGGAACGTTGTTACCAC TCGTTCACAAACAACTTGGTTTAGGCTCTATTTCTATTGGTGCGCCGTTCTTTGATCAAATGTTCTTAATTATTATGACA CCATTTGCATTATTGCTTGGTATTGGACCTTTAGTGAAATGGCGTAGAGACCAATTTTCTGCAATTCGTACGCCTGTTGT TATCTGCGTATTTGTTATGCTGATTGCAGGTTTTGCGTTACCTTATTTCTTGCAAGATAAAATTACCGTGAGTTCAGTGC TTGGTTCAATGATGACTGTGATTATTGTGTTACTTGTGCTTTATGAATTGCAACAACGTGCGACGCATCGTGAATCATTC TTTGTTGGCGTACGCAAACTATCTCGTTCTCATTGGGGAATGATGTTAGCTCACTTAGGCGTAGCTATGACTGTTTGGGG GATCGCATTTAGCCAAAACTTTAGCGTAGAACGTGATGTGAGAATGAAAGTTGGCGAGAACGCACAAATTGGTCGTTACG ATTTTAAATTCGTTGGTGTGACGGATGAAAATGGTCCAAACTATATTGGTGGAAAAGCTCAAATTGATATTTCTAAAGAT GGGCAACCAGAGGCGAGTTTATTCGCAGAAAAACGTTTTTACACAGTAAGTCGGATGTCTATGACGGAAGCCGCTATTGC TGGTGGTTTAACTCGTGACCTTTATGTGGCACTTGGCGAAAAACTTGAGGATAATTCTTGGGCGTTACGCTTATATTACA AGCCATTTATTCGCTGGATTTGGATTGGCGGCTTGTTTATGGCGTTAGGTGGATTGTTGTGTATGTTCGATCGACGCTAT TGGTTTAATGTGTTGTTGAAGAAATAA Protein sequence : MIAELGNYALALSLAVSLMLAIFPLWGAEKGNAQLMALARPMTYGLFASLSIAFAALFYLFAVNDFSVQYIVNNSNTTLP IYYRLSAVWGSHEGSLLLWIWLLAVWSFAVALLSKHLPQEAVARVLGIMGIISVGFVLFVLFTSNPFTRTFPDFPVDGKE LNPMLQDVGLIFHPPLLYMGYVGFSVAFAFAIASLMTGKLDSAWARWSRPWTLAAWVFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENSSFMPWLAGTALIHSLSVTEKRGSFKAWTVLLAILAFSLCLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPTRGLYILAYLV VVIGGSLALYAYKGSQIRSRDNAERYSRESMLLLNNILLMTALCVVFLGTLLPLVHKQLGLGSISIGAPFFDQMFLIIMT PFALLLGIGPLVKWRRDQFSAIRTPVVICVFVMLIAGFALPYFLQDKITVSSVLGSMMTVIIVLLVLYELQQRATHRESF FVGVRKLSRSHWGMMLAHLGVAMTVWGIAFSQNFSVERDVRMKVGENAQIGRYDFKFVGVTDENGPNYIGGKAQIDISKD GQPEASLFAEKRFYTVSRMSMTEAAIAGGLTRDLYVALGEKLEDNSWALRLYYKPFIRWIWIGGLFMALGGLLCMFDRRY WFNVLLKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 9e-157 | 62 |
ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-135 | 55 |