|
Name : HIBPF13700 (HIBPF13700) Accession : YP_004135770.1 Strain : Haemophilus influenzae F3031 Genome accession: NC_014920 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein nrfe Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1289956 - 1291863 bp Length : 1908 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCTCCCAGAACTTGGCTTTTTCCTTCTTTTACTCGCAACAGCTAGCGCGTTTTTTCTTGCCTTAGTGCCTCAATTTGG GTTATTCAAAAAAAATTCGACTTTAATTAATGCTGCTTGGCCGCTTAGTTATATTTTTACCCTTGCGACGACGTTCTCAA TTGGTTTGCTTGCTTATTCTTTTGCGGTGGATGACTTTACCCTTGAATATGTAGCGGCACATTCTAATTCCCAATTACCT ACATTTTTTAAAGTGGCTGCCACTTGGGGAGGACATGAAGGTTCAATGTTGTTTTGGTTATTTTCATTGAGTTTATGGCT TGCTGCTTTTGCTTTTTTTAATCGAAAAAATGACCGCACTTTTTCCGCTCAATCTTTATCTTTATTGGGATTGATTTGCT TTGGTTTTGCGGTGTTTATTTTATTTTATTCCAATCCATTTGGACGCATTTTCCCTGCTCCCGCAGAAGGGCGCGATCTC AATCCAATGTTGCAAGATGTGGGATTAATTTTCCATCCGCCTTTATTATATGTTGGCTATGTGGGCTTTGCGGTAAATTT TGCAATGAGTTTGAGTGCGTTGATTTATAACCAGTCAGCACGACAAATTGCCCGCTCAATGCGTGGATGGGTGTTGGTTT CTTGGTTGTTTTTAACCATTGGCATTGTGCTTGGTGCCTGGTGGGCATATTACGAGCTCGGCTGGGGCGGTTGGTGGTTC TGGGATCCCGTAGAAAATGCGTCTTTAATGCCTTGGTTGCTTGGTTTGGCGTTATTACACAGTTTAATGGCGACGGAAAA ACAAGGCGTATTTAGTTATTGGACAACGCTTTTTTCTCTGCTTGCTTTTGCCTTTAGCGTATTAGGCACGTTTATTGTTC GTTCTGGTGCGCTCACTTCTGTGCACGCCTTTGCATTGGATAACACGCGCGGTTATGTGTTGTTATTAATTTTCTTTGTT TTGACAGCGTTAGCCTTTGGTTTATTCGCTTTACGAGCGGGAAGTTCATCAGAAAGTGCGGTGAAATTTCAGTTCGTTTC TAAATCGGGTGGCATTTTATTACTGAATATTTTGCTGACCATTGCGACGGTTTCTACCTTTTTAGGTACTTTTTACCCGA TGTTATTCCAAGCGATGAATTGGGGCTCAATTTCGGTGGGAAGTCCTTATTTTAATAGTATTTTCTTCCCCATTATTACG GCGATTTTAATCTTAATGGTAATTGTGCTTAGCATACGTAAGGAGCAATTTGATCGCACATTATTGATACGTTGTGGGTG GTTGCTTATTCCGTCTTTGATTCTTGCATGCCTAATGATTTGGCAACAGCTACGCCATAATTCTGCGTTGAATTTTCACG CTTTCGCCTTTGTGTTATTAACTCTTGCGATTTGGCTTTTATTCGTCACGTTATGGCAAAATTGGCGACAAATTCGCTTG TCTCAATTTGGGATGATTTTAGCACACTGTGGCGTGGCGATTGTGACTATTGGTGCGGTGATGACTGGGTATTTTGGCAG TGAAATTGGTGTGCGTTTAGCACCGCAACAAAGTCAAACGTTAGGGCAATATGAATTTCATTATCGCCAATTTTCTAATG AAATTGGGCCAAATTTTACGGCAGAAGTCGCCTTTTTTGACGTAACTAAAAATGGTAAACCTTATGCAGAAATTATCCCA GAACGCCGTTATTACGATGTACGAACAATGACAATGAGTGAAGTGGGGCTTGATGGTGGTTTTTGGGGCGATTTATATAT TGTGATGGGCGATTCTCTCGGCAAAGGGGAATTTACTTTCCGCTTACATTATAAACCACTGATTCGTTGGCTTTGGGCGG GCGGTATTTTAATGGCCTTTGGTGCACTTTTTAGCGTCTTCGGATTACGCAGAAAACAGGAAAAATAA Protein sequence : MLPELGFFLLLLATASAFFLALVPQFGLFKKNSTLINAAWPLSYIFTLATTFSIGLLAYSFAVDDFTLEYVAAHSNSQLP TFFKVAATWGGHEGSMLFWLFSLSLWLAAFAFFNRKNDRTFSAQSLSLLGLICFGFAVFILFYSNPFGRIFPAPAEGRDL NPMLQDVGLIFHPPLLYVGYVGFAVNFAMSLSALIYNQSARQIARSMRGWVLVSWLFLTIGIVLGAWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLLGLALLHSLMATEKQGVFSYWTTLFSLLAFAFSVLGTFIVRSGALTSVHAFALDNTRGYVLLLIFFV LTALAFGLFALRAGSSSESAVKFQFVSKSGGILLLNILLTIATVSTFLGTFYPMLFQAMNWGSISVGSPYFNSIFFPIIT AILILMVIVLSIRKEQFDRTLLIRCGWLLIPSLILACLMIWQQLRHNSALNFHAFAFVLLTLAIWLLFVTLWQNWRQIRL SQFGMILAHCGVAIVTIGAVMTGYFGSEIGVRLAPQQSQTLGQYEFHYRQFSNEIGPNFTAEVAFFDVTKNGKPYAEIIP ERRYYDVRTMTMSEVGLDGGFWGDLYIVMGDSLGKGEFTFRLHYKPLIRWLWAGGILMAFGALFSVFGLRRKQEK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-82 | 43 |
