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Name : HIBPF01820 (HIBPF01820) Accession : YP_004134768.1 Strain : Haemophilus influenzae F3031 Genome accession: NC_014920 Putative virulence/resistance : Unknown Product : protein-export membrane protein secd Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0342 EC number : - Position : 183007 - 184857 bp Length : 1851 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAAACCGTTATCCATTATGGAAGAATTTGATGGTTATTTTTATTGTGGCCATCGGGATTTTATATTCTCTTCCAAA TATTTATGGTGAAGATCCTGCGGTGCAAATTTCCGGTACGCGCGGTCAAGAAGCAAATACTAGCGTGCTTGGACAAGTTC AAGATGTGCTTAAAACCAATAATCTTCCAACCAAATCTATCGTGCTTGAGAATGGCTCAATTCTAGCTCGTTTTACTAAT ACCGATGATCAACTTCTTGCTAAAGATAAAATTGCTGAACGTCTTGGCAATAATTACACCACCGCATTAAATCTTGCTCC AGCCACTCCAGCTTGGTTAAGTATGTTTGGTGCGAATCCTATGAAATGGGGATTAGACTTACGTGGTGGAGTTCGTTTTT TGATGGAAGTCGATATGAATGCCGCACTTGTAAAACGCCAAGAGCAATTACAAGATAGTTTGCGTGGCGAACTTCGTAAA GAAAAAATTCAATATACTGCCATTAAAAATACTGAGCATTTTGGTACGTTGATAACCTTAGCTAATGTGAGCCAGCGTGC TAAAGCTGAGCGAATTATTCGCCAATTACATCCAACATTAGATATTACTGAGCCTGATGCTGATAGTATTAATTTAGGGC TATCTACTGCAGCATTAAATGAAGCTCGCGACTTAGCCATTGAGCAAAACTTAACGATTTTACGTAAACGTGTTGCTGAA TTAGGTGTTGCAGAAGCGGTAATTCAACGTCAAGGTGCGGAGCGTATTGTGATTGAATTACCAGGTGTTCAAGACACTGC ACGCGCAAAAGAAATTTTAGGGGCAACGGCAACACTTGAGTTTCGTATCGTAAATCAAAATGTTACGGCTGATGCTATTT CTCGTAATATGTTACCAGCTGATTCGGAAGTTAAATATGATCGCCAAGGTCATCCTGTTGCGCTATTTAAACGTGCCGTA TTAGGTGGTGAGCATATTATTAATTCAAGCTCTGGTTTAGATCAGCATTCAAGCACGCCGCAAGTGAGTGTAACCTTGGA TAGCGAAGGTGGCGAGATTATGTCTCAGACCACTAAAAAATATTACAAGAAACCAATGGCAACGCTTTATGTTGAATATA AAGATAACGGTAAAAAAGATGAAAATGGTAAAACTATTTTAGAAAAGCATGAAGAAGTGATTAATGTTGCAACAATTCAA GGACGTTTTGGTTCTAATTTCCAAATTACTGGTGTTGATAGTATTGCCGAAGCACATAATTTTTCTACCTTGTTGAAATC TGGCGCATTAATTGCACCAATTCAAATTGTTGAAGAACGCACAATTGGCCCATCATTAGGTGCGCAAAACGTAGAGCAAG GGATTAATGCGAGTCTTTGGGGATTAGTTGCTGTTATTGCCTTTATGTTGTTTTACTACAAAATGTTTGGTGTGATTGCA AGTTTTGCACTTGTTATTAATATCGTATTACTTGTGGGATTAATGTCTATTTTACCCGGCGCGACACTTTCAATGCCGGG TATTGCGGGTATCGTTTTAACTTTAGGTATGTCAGTAGATGCGAATGTATTGATTTTTGAACGTATTAAAGAAGAAATTC GTAATGGTCGTTCAATTCAGCAAGCCATTAATGAAGGTTATAACAGCGCATTTACTTCTATTTTTGATGCAAACTTAACC ACAATCTTAACCGCAATTATTCTATACGCGGTAGGAACAGGCCCAATTCAAGGCTTTGCGATTACGCTTTCACTTGGTGT TGCGATTTCTATGTTTACCGCGATTACTGGAACTCGCGCATTAGTTAATGCCCTTTACGGCGGCAAACAACTTAAAAAAT TATTAATTTAG Protein sequence : MLNRYPLWKNLMVIFIVAIGILYSLPNIYGEDPAVQISGTRGQEANTSVLGQVQDVLKTNNLPTKSIVLENGSILARFTN TDDQLLAKDKIAERLGNNYTTALNLAPATPAWLSMFGANPMKWGLDLRGGVRFLMEVDMNAALVKRQEQLQDSLRGELRK EKIQYTAIKNTEHFGTLITLANVSQRAKAERIIRQLHPTLDITEPDADSINLGLSTAALNEARDLAIEQNLTILRKRVAE LGVAEAVIQRQGAERIVIELPGVQDTARAKEILGATATLEFRIVNQNVTADAISRNMLPADSEVKYDRQGHPVALFKRAV LGGEHIINSSSGLDQHSSTPQVSVTLDSEGGEIMSQTTKKYYKKPMATLYVEYKDNGKKDENGKTILEKHEEVINVATIQ GRFGSNFQITGVDSIAEAHNFSTLLKSGALIAPIQIVEERTIGPSLGAQNVEQGINASLWGLVAVIAFMLFYYKMFGVIA SFALVINIVLLVGLMSILPGATLSMPGIAGIVLTLGMSVDANVLIFERIKEEIRNGRSIQQAINEGYNSAFTSIFDANLT TILTAIILYAVGTGPIQGFAITLSLGVAISMFTAITGTRALVNALYGGKQLKKLLI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-117 | 45 |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 7e-117 | 44 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 2e-117 | 44 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 2e-117 | 44 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 2e-117 | 44 |
