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Name : HICON_12340 (HICON_12340) Accession : YP_004138377.1 Strain : Haemophilus influenzae F3047 Genome accession: NC_014922 Putative virulence/resistance : Unknown Product : protein-export membrane protein SecD Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG0342 EC number : - Position : 1016592 - 1018442 bp Length : 1851 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAAACCGTTATCCATTATGGAAGAATTTGATGGTTATTTTTATTGTGGTCATCGGGATTTTATATTCTCTTCCAAA TATTTATGGTGAAGATCCTGCGGTGCAAATTTCCGGTACACGCGGTCAAGAAGCAAATACTAGCGTGCTTGGACAAGTTC AAGATGTGCTTAAAACCAATAATCTTCCAACCAAATCTATCGTGCTTGAGAATGGCTCAATTCTAGCTCGTTTTACTAAT ACCGATGATCAACTTCTTGCTAAAGATAAAATTGCTGAACGTCTTGGCAATAATTACACCACCGCATTAAATCTTGCTCC AGCCACTCCAGCTTGGTTAAGTATGTTTGGTGCGAATCCTATGAAATGGGGATTAGACTTACGTGGTGGAGTTCGTTTTT TGATGGAAGTCGATATGAATGCCGCACTTGTAAAACGCCAAGAGCAATTACAAGATAGTTTGCGTGGCGAACTTCGTAAA GAAAAAATTCAATATACTGCCATTAAAAATACTGAGCATTTTGGTACGTTGATAACCTTAGCTAATGTGAGCCAGCGTGC TAAAGCTGAGCGAATTATTCGCCAATTACATCCAACATTAGATATTACTGAGCCTGATGCTGATAGTATTAATTTAGGGC TATCTACTGCAGCATTAAATGAAGCTCGCGACTTAGCCATTGAGCAAAACTTAACGATTTTACGTAAACGTGTTGCTGAA TTAGGTGTTGCAGAAGCGGTAATTCAACGTCAAGGTGCGGAGCGTATTGTGATTGAATTACCAGGTGTTCAAGACACTGC ACGCGCAAAAGAAATTTTAGGGGCAACGGCAACACTTGAGTTTCGTATCGTAAATCAAAATGTTACGGCTGATGCTATTT CTCGTAATATGTTACCAGCTGATTCGGAAGTTAAATATGATCGCCAAGGTCATCCTGTTGCATTATTTAAACGTGCCGTA TTAGGTGGGGAGCATATTATTAATTCAAGCTCTGGTTTAGATCAGCATTCAAGCACGCCGCAAGTGAGTGTAACTTTGGA TAGCGAAGGTGGCGAGATTATGTCTCAGACCACTAAAAAATATTACAAGAAACCAATGGCAACGCTTTATGTTGAATATA AAGATAACGGTAAAAAAGATGAAAATGGTAAAACTATTTTAGAAAAGCATGAAGAAGTGATTAATGTTGCAACAATTCAA GGACGTTTTGGTTCTAATTTCCAAATTACTGGTATTGATAGTATTGCCGAAGCACATAATCTTTCTACCTTATTGAAATC TGGCGCATTAATTGCACCAATTCAAATTGTTGAAGAACGCACAATTGGCCCATCATTAGGTGCGCAAAACGTAGAGCAAG GGATTAATGCGAGTCTTTGGGGATTAGTTGCTGTTATTGCCTTTATGTTGTTTTACTACAAAATGTTTGGTGTGATTGCA AGTTTTGCACTTGTTATTAATATCGTATTACTTGTGGGATTAATGTCTATTTTACCTGGTGCGACACTTTCAATGCCGGG TATTGCGGGTATCGTTTTAACTTTAGGTATGTCAGTAGATGCGAATGTATTGATTTTTGAACGTATTAAAGAAGAAATTC GTAATGGTCGTTCAATTCAGCAAGCCATTAATGAAGGTTATAACAGCGCATTTACTTCTATTTTTGATGCAAACTTAACC ACAATCTTAACCGCAATTATTCTATACGCGGTAGGAACAGGCCCAATTCAAGGCTTTGCGATTACGCTTTCACTTGGTGT TGCGATTTCTATGTTTACCGCGATTACTGGAACTCGCGCATTAGTTAATGCCCTTTACGGCGGCAAACAACTTAAAAAAT TATTAATTTAG Protein sequence : MLNRYPLWKNLMVIFIVVIGILYSLPNIYGEDPAVQISGTRGQEANTSVLGQVQDVLKTNNLPTKSIVLENGSILARFTN TDDQLLAKDKIAERLGNNYTTALNLAPATPAWLSMFGANPMKWGLDLRGGVRFLMEVDMNAALVKRQEQLQDSLRGELRK EKIQYTAIKNTEHFGTLITLANVSQRAKAERIIRQLHPTLDITEPDADSINLGLSTAALNEARDLAIEQNLTILRKRVAE LGVAEAVIQRQGAERIVIELPGVQDTARAKEILGATATLEFRIVNQNVTADAISRNMLPADSEVKYDRQGHPVALFKRAV LGGEHIINSSSGLDQHSSTPQVSVTLDSEGGEIMSQTTKKYYKKPMATLYVEYKDNGKKDENGKTILEKHEEVINVATIQ GRFGSNFQITGIDSIAEAHNLSTLLKSGALIAPIQIVEERTIGPSLGAQNVEQGINASLWGLVAVIAFMLFYYKMFGVIA SFALVINIVLLVGLMSILPGATLSMPGIAGIVLTLGMSVDANVLIFERIKEEIRNGRSIQQAINEGYNSAFTSIFDANLT TILTAIILYAVGTGPIQGFAITLSLGVAISMFTAITGTRALVNALYGGKQLKKLLI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-117 | 45 |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 5e-118 | 45 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-118 | 45 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-118 | 45 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-118 | 45 |
