|
Name : SPSINT_2015 (SPSINT_2015) Accession : YP_004150179.1 Strain : Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 Genome accession: NC_014925 Putative virulence/resistance : Virulence Product : bacteriocin ABC transporter family protein Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 2084340 - 2086484 bp Length : 2145 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAAAATTAAATTAATAAGACAATTTGATGAAACGGATTGTGGACCTACGTGTTTAGCAATGATAAGCAGATATTACGG TAAAAATGTTTCAGTTACTAAAATAAGAGAACTAGCTAAAACGGATAAATTTGGAACTAGTATTTTTGGTCTGATTCAAG CAGGAAAGGAATTAGGTTTATTAGTTGAAGCATATGAATTAGATGAAATAAAAGAGCTAGAGGTTTTTAATCACCCAATA ATAGCACACGTAAAAACTCAAAATAACTTTGAGCACTTTATTGTGATTGAAAAAACCTTAAATGGCAAAGTAATTATTAA AGATCCAGATAAAGGAAGTTATTCATTAACATATGAAGAATTTTATGAGATATTTACATTAATTATTTTAGATATTAATA AAGAGAAGCACTTTTCAAAATCTAATGAAGTTACAACGGTTAGAAAAGTTTTAATGCCATTGCTAAAAAATAATGTTAAA TTTTTAATATTGATAATTGTCATTTCATTATTAATAAATTTAGTAGGAATTGCAGGAGCTTTATACTTTCAATATCTAAT CGATGATATAATACCTATTGAAGATTTTCATGCTTTACATAAGGTTTCAGCGTCAATATTATTATTATATTTTATTAATT TATTTGTATCATTCTTCAGATATTATCTTAGTTTGAAAATAAGTTTGAATATTGATTATAGTCTTATGAAAAAATATTAT AATCATGTAATAAAATTACCTAGCAGTTTTTTTGACAATAGAAAAACTGGAGAAATACTATCACGTTTTAACGACATTCA CAATATTAGGGAATCATTATCTTCAGTAACAGTAACTTTATTTGTTGATCTTATACTTGTTTTGGGAGGCAGTATTATTC TTTATCAAGAAAGTGGAATATTACTTCTACTATGTTCTTGTATTCTTCCTATTTACATCATTTTATCTTTAGTTTTAAAA AGACCATTTGAAATAAATAATAGAAAATTAATGGAAGAAAGTGCAGTATTAAGCTCGTATTTAATTGAATCATTTGAAAA TAATTTAATAATAAAAAGTTATAATTATGAGAATGATATGTATAGTAGGGGGAAGAAAAGATTTAACTCTCTTGTAAATA AAGCATTAAAGTTAGGGTTATATAACAATTATCAATTATCAATAAGTAACTTTGTAAATATTTTTATCAGTCTGATAGTC TTATGGGTTGGTTCATATTTAGTTATTGACAAGGAATTAACTTTAGGCTCTTTAATAGCATTTAATGCGTTATTAATTTA TTTTTTAGATCCATTTGAAAGAATTATAAATATGCAACCAATTATACAATCATCTATAGTTGCAATTAAGCGTGTAGGCG AAATTTTTGATTTGGAAACTGAAAAAAGAGAAAAAAGTATGTTTCGTCCATTGCAAAATGCAATTGTTTTTAATGATGTT TGCTTTCAATATGGCTTTAGAAGAGATATATTATCAAATGTTAATATGACCTTTACTAAAGGGAAAAAAGTAGGTATTGT TGGATCAAGTGGATCGGGAAAATCTACAATTGGAAAATTACTAATACAACTTTATAGTTGTCAGAATGGGAATATTTATT GGGATGGAAAACCAATAGAAGATTTATCACTTATGAAATTGAGGGATAATATTGGATATGTGCCACAAGATGATTTTTGG TTCAATGGTTCTATTATTGAAAACCTAACTTTAAACAAAAAAAATGTTTCAAAAGAAGTAGTTATTCAAGCTTGTAAAGA ATCAGGAGCACATGATTTTATAAGTGACCTTACTAACAAATATGAATCAATTATCGAAAACGGGGGGGGGAATTTGTCAG GTGGTCAAAAACAGAAATTATCCATAGCGCGTGCTCTTATTAAAGATCCTGATATTTATATATTTGATGAACCAACTAGT TCTTTGGATACTTTATCTGAATATAAAATATTAGAGTTATTAGAAAAACTATCTTCAAATAATAAAACAATCATTTTAAT TTCTCATAAATTAAAGAGTATAGCAAATTCGGATTATATATACGTATTGAAACATGGGAGGATTATTGAAGAAGGTTCCC ATAACGAATTGATTTTTAATGGTAGTGAATATAAGTCATTGTGGGAGAAGCAATGTGCTAGGTAA Protein sequence : MKIKLIRQFDETDCGPTCLAMISRYYGKNVSVTKIRELAKTDKFGTSIFGLIQAGKELGLLVEAYELDEIKELEVFNHPI IAHVKTQNNFEHFIVIEKTLNGKVIIKDPDKGSYSLTYEEFYEIFTLIILDINKEKHFSKSNEVTTVRKVLMPLLKNNVK FLILIIVISLLINLVGIAGALYFQYLIDDIIPIEDFHALHKVSASILLLYFINLFVSFFRYYLSLKISLNIDYSLMKKYY NHVIKLPSSFFDNRKTGEILSRFNDIHNIRESLSSVTVTLFVDLILVLGGSIILYQESGILLLLCSCILPIYIILSLVLK RPFEINNRKLMEESAVLSSYLIESFENNLIIKSYNYENDMYSRGKKRFNSLVNKALKLGLYNNYQLSISNFVNIFISLIV LWVGSYLVIDKELTLGSLIAFNALLIYFLDPFERIINMQPIIQSSIVAIKRVGEIFDLETEKREKSMFRPLQNAIVFNDV CFQYGFRRDILSNVNMTFTKGKKVGIVGSSGSGKSTIGKLLIQLYSCQNGNIYWDGKPIEDLSLMKLRDNIGYVPQDDFW FNGSIIENLTLNKKNVSKEVVIQACKESGAHDFISDLTNKYESIIENGGGNLSGGQKQKLSIARALIKDPDIYIFDEPTS SLDTLSEYKILELLEKLSSNNKTIILISHKLKSIANSDYIYVLKHGRIIEEGSHNELIFNGSEYKSLWEKQCAR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 1e-107 | 41 |
