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Name : cycK (BARCL_0389) Accession : YP_004158656.1 Strain : Bartonella clarridgeiae 73 Genome accession: NC_014932 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome C-type biogenesis protein Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 422767 - 424740 bp Length : 1974 bp Strand : + Note : - DNA sequence : TTGGGTCATCTTTTTTTAGCTGCAGCATTTGCAGTTAGTTTGTTGCAGGCATTCTTACCAACATTTGGTGTTTTACAGCA AAAGCGTTTATTGATGCAATTGGCTGTGCCGCTAGCATATGTCATTTTTATATTATTGCTCTTATCTTTTTTGATTATTG TTTACGCTTATATTGTATCTGATTTTTCTGTTCTTAATGTTGTTGAGAATTCTCATTCAGAAAAGCCAATGCTTTATAAA ATCGTTGGTGTGTGGGGTAACCATGAAGGATCAATGTTATTATGGGTTTTGCTTTTAGGTTTTTTTAGTATATTGATTGC ATTGTTTTCTCAACAATTACCAGAACAGTTTAAAGCATTAGTTTTAGGTTGCCAAAGTTGGATCACAAGTGCTTTTCTTT TGTTTATTCTTTTTATATCTAATCCATTTATACGTGTTAATCCACCGGTATTGCAGGGAAAAGATCTTAATCCTGTTTTA CAGGATATTTCTTTAGTAATTCATCCCCCACTTCTTTATTTGGGCTATGTTGGTTTTGCGGTCTGTTTTTCTTTTTCAAT AGCTGCATTGATTATAGGATATGTTGACAAGGTTTGGGCGTATTGGATACGGCCATGGGTTTTGCTTGCATGGATTTTTT TGACAGTTGGTATCATGGTTGGGTCTTATTGGGCTTATTATGAATTAGGTTGGGGTGGTTATTGGTTTTGGGATCCGGTT GAAAATGTTTCATTAATGCCTTGGCTTTCAGGAACTGCCCTTTTACATTCAGTGATTATTTTTGAAAAACGAAATTTATT GAAAAGCTGGACCTTATTTTTAGCTATTATTACTTTTTCTCTTTCTCTTATGGGAACTTTTCTCGTTCGTTCCGGTATTT TAATGTCTATTCATAGTTTTGCTGTTGATCCAGCACGTGGGAAGGCAATTCTTGCTATTTTGTTTTTTTTCACGGGAGGA GCTCTTCTTCTTTTTGCTATACGTATGCCTATTTTGAAAAAAAGGGGATTTTTTCATCCAATTTCGCGTGAGGGTTTTAT TATTTTAAATAATTTGTTTCTCACAACAGCAACAGCAACAGTTTTAATTGGTACACTTTATCCTTATTTTTTTGAGGCAT TAACGGGACAAAAAATCTCTGTAGGTCCTGTTTTTTTTAATCTTACATTTGGACCTTTAATGATGATACTCTTGTTATTT GTTCCATTCGGTCCGATGATAGCTTGGAAACGTGGTGATTTTTTTGCAGTTTTCGAACGATTGTGGTGTGTATTTGCATT GGCTTGTATAGCCTGTTTTATAACATTTTATCTAGATTCTTTACGTGATATTTTTGCAGCTTTAGGCGTTGGACTTGCAG TTTTTGTTTTTTTGGGTGGTTTAGCTGATCTTTGGGGCAAGAGTGGTTATCACAAGGTTCCTTTTTTGGTGCGGGCTAAG AGATTTTTTAGGTTACCATTGTCTGTTTTTGGTGCTGCGTTGGCACATATGGGATTAGGAGTTACGTTATTTGGCATTAT CTGTGTTGCAACTTTTGGGCAAGAACGTATTTTAATTATGCAAATAAGAGATACGGTTACGATAGCTGGTAAGACTATTT GTTTTGATGAAGTTCGTAATATTGCAGGTTCGAATTACTCCGCAATACAATTTGGTTTTAAAATATATGAGGACAAAAAT TTGATAAGTAATATAATAGCATCGAAGCGTTTTTATTCAAGTCAAAATATATCAACGACGGAAGTTGGTATTCAAAGTCA TGGTTTTTCCCAATTTTATATTGCTCCTGGTCGTATAAATGATCAAGGGCTTGTTGTGCATATATGGTGGAAACCTTACG TGATATGTATTTGGTTTGGTGCGTTCATGATGGCAGTAGGGGGTGGCTTTTCTCTTTTAAGTCATTGGGTGCGTGTGGGT CGGTTGCGATGGATAACTTTTGGCTTTAAAAATATTGTAAAGGGATCAAGATGA Protein sequence : MGHLFLAAAFAVSLLQAFLPTFGVLQQKRLLMQLAVPLAYVIFILLLLSFLIIVYAYIVSDFSVLNVVENSHSEKPMLYK IVGVWGNHEGSMLLWVLLLGFFSILIALFSQQLPEQFKALVLGCQSWITSAFLLFILFISNPFIRVNPPVLQGKDLNPVL QDISLVIHPPLLYLGYVGFAVCFSFSIAALIIGYVDKVWAYWIRPWVLLAWIFLTVGIMVGSYWAYYELGWGGYWFWDPV ENVSLMPWLSGTALLHSVIIFEKRNLLKSWTLFLAIITFSLSLMGTFLVRSGILMSIHSFAVDPARGKAILAILFFFTGG ALLLFAIRMPILKKRGFFHPISREGFIILNNLFLTTATATVLIGTLYPYFFEALTGQKISVGPVFFNLTFGPLMMILLLF VPFGPMIAWKRGDFFAVFERLWCVFALACIACFITFYLDSLRDIFAALGVGLAVFVFLGGLADLWGKSGYHKVPFLVRAK RFFRLPLSVFGAALAHMGLGVTLFGIICVATFGQERILIMQIRDTVTIAGKTICFDEVRNIAGSNYSAIQFGFKIYEDKN LISNIIASKRFYSSQNISTTEVGIQSHGFSQFYIAPGRINDQGLVVHIWWKPYVICIWFGAFMMAVGGGFSLLSHWVRVG RLRWITFGFKNIVKGSR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 1e-76 | 42 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 5e-85 | 42 |
