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Name : LAC30SC_09745 (LAC30SC_09745) Accession : YP_004292987.1 Strain : Lactobacillus acidophilus 30SC Genome accession: NC_015214 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ABC transporter Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : - Position : 1887424 - 1889586 bp Length : 2163 bp Strand : - Note : COG2274 ABC-type bacteriocin/lantibiotic exporters, contain an N-terminal double-glycine peptidase domain DNA sequence : ATGTTAATACAATATAAATCAATCTATGTGCCACAAGTAGACGAATCAGATTGTGGTGTTGCCTGCTTAGCAATGATTCT TAAAAAATATCATTCTAGAGTATCTTTAGCCCATTTGCGGCATAGCGCACGAACTAATTTGGAGGGAACTACCGCTTTAG GTTTAGTAAAGACGGCTCAAGCTTTTAATTTAAATACGCAAGCCGTTAAAGCTGATATGTCATTGTTTGATTCAGATACA GATATTCAGTATCCATTTATTGTTCATGTCTTAAAGCAAGGTGAATTACTGCATTATTACGTAGTAATTAAAGCTACTAA AAAATACTTGATCATAGCTGATCCTGATCCCAGTGTTGGCTTAACCAAAATAGCAAAAGATAAATTTGCTCAAGAATGGA CAGGAATCGCTTTGCTGATGGCACCTAACGATAAATTTGAGCCAATTAAAGAGAAAAAACGTAATCTATGGTCGCTATTT CCTTATATGTTCAAGCAGAAAAGCTTGCTTACTAATATTATTCTAGCTTCTTTGTTAATGACGATTATTAGTATCTGTAG TTCATATTTCTTACAAGGGGTTATTGATACATATATTCCTAATGGCACATATCAGACTCTTTCTATCCTGGCAATTGGCT TATTGATAGCCTACGTATTTAATTCCATCTTTTCTTATGGTCAGAGCCTCTTACTTAATGTTCTAGGTCAAAGATTAAGT ATTGACCTTAATTTACAGTATATTCGCCATCTTTTTGAACTACCTATGGAATTTTTTGTAACTCGCAGAACTGGTGAAAT CACCTCACGTTTTTCGGATGCTAGTCGAATCATTGATGCCTTGGCCAGCACTGTGATTTCATTATTTCTTGATCTTTCAA TTGTAGTTGTGATGGGAATCGTGCTGGCGATTCAGAACTCCACTTTATTTGTAGTAACATTGCTGGCCTTGCCTTTTTAT GCGATTGTGATTCTTGGCTTTACTAAGAAATTCGATAAGATGAACAATGATCAGATGGAGAGTAACGCTGTATTAAGTTC ATCAGTAATTGAAGATATTCAGGGAATTGAAACAATCAAAGCTTTAAATAGCGAACAAACACGTTATCGTAAGATTGATA GTCAATTCGTCGATTACCTCAAGAAATCTTTTCGTTACAGTAAAACTGAATCTTTGCAGTCAGCTTTAAAGACCTTCATT CAGTTATCTCTCAATGTAATTATCCTCTGGGTAGGGGCTAAGGTTGTAATGAACGGGCAGATGAGCATTGGTCAATTAAT GACCTTCAACGCATTACTATCGTATTTTGTAGATCCACTTCAGAGCATTATTAATCTTCAACCAACTTTACAATCAGCTA ATGTAGCACAAAATCGATTGAATGAAGTATACATGGTTAAGAGTGAGTTCCAGAAAGATGCTCAGATTAGGGATGCCAAG CAATTAGCAGGTGAGATTGAATATCATCATGTTGACTACCATTATGGCTATGGAGTTGATGTATTAAAAGATATTAATTT AAAAATCGAACCCAATGATAAGTTGGCAATCGTAGGGATGAGTGGCTCAGGTAAGTCTACTATGGTCAAACTTTTAGTTG ATTTCTTCTCTCCAAGCAAAGGCAAGTTAACTTTTAATGGTTTTGATTCTACTAAAGTAGATAAGCATGTCTTACGGTCA TACGTAAACTATGTTCCCCAAACACCATACATCTTCTCAGGAACAATCAAAGAAAATCTGCTTTTAGGTAGTCGACCAGA TATTACAGAAAAAGATATATTGAAAGCCTGTCAGATAGCAGAAATTGAGTCTGAAATCGAACAATTACCACTGCAGTTTG AAACCAAGATGGATGAAAATGCCAAGATTTTATCCGGTGGGCAAAAGCAAAGGCTAACTATTGCACGTGCATTATTGTCA CCGGCTAAAATTTTAATTTTTGATGAAGCCACTAGCGGGCTTGATACGATTACAGAGAAAAAAGTAGTAGATAATTTAAT GAAATTAAAAGATAAAACGATTATTTTTATTGCTCATCGTTTAGCAATTGCACAAAGGACTAACAATATTGTGGTTGTAG ATCATGGTCAAATTGTTGAGCAAGGAAGTCATGAGGAATTAATGCAGAAACATGGCTTTTACTATAACTTAGTTGAGAAT TAG Protein sequence : MLIQYKSIYVPQVDESDCGVACLAMILKKYHSRVSLAHLRHSARTNLEGTTALGLVKTAQAFNLNTQAVKADMSLFDSDT DIQYPFIVHVLKQGELLHYYVVIKATKKYLIIADPDPSVGLTKIAKDKFAQEWTGIALLMAPNDKFEPIKEKKRNLWSLF PYMFKQKSLLTNIILASLLMTIISICSSYFLQGVIDTYIPNGTYQTLSILAIGLLIAYVFNSIFSYGQSLLLNVLGQRLS IDLNLQYIRHLFELPMEFFVTRRTGEITSRFSDASRIIDALASTVISLFLDLSIVVVMGIVLAIQNSTLFVVTLLALPFY AIVILGFTKKFDKMNNDQMESNAVLSSSVIEDIQGIETIKALNSEQTRYRKIDSQFVDYLKKSFRYSKTESLQSALKTFI QLSLNVIILWVGAKVVMNGQMSIGQLMTFNALLSYFVDPLQSIINLQPTLQSANVAQNRLNEVYMVKSEFQKDAQIRDAK QLAGEIEYHHVDYHYGYGVDVLKDINLKIEPNDKLAIVGMSGSGKSTMVKLLVDFFSPSKGKLTFNGFDSTKVDKHVLRS YVNYVPQTPYIFSGTIKENLLLGSRPDITEKDILKACQIAEIESEIEQLPLQFETKMDENAKILSGGQKQRLTIARALLS PAKILIFDEATSGLDTITEKKVVDNLMKLKDKTIIFIAHRLAIAQRTNNIVVVDHGQIVEQGSHEELMQKHGFYYNLVEN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 4e-123 | 41 |
