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Name : Clole_0113 (Clole_0113) Accession : YP_004307070.1 Strain : Clostridium lentocellum DSM 5427 Genome accession: NC_015275 Putative virulence/resistance : Virulence Product : bacteriocin ABC transporter Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG2274 EC number : 3.6.3.44 Position : 168582 - 170789 bp Length : 2208 bp Strand : + Note : SMART: ATPase, AAA+ type, core; TIGRFAM: peptidase C39, bacteriocin ABC transporter; KEGG: amt:Amet_1032 bacteriocin ABC transporter; PFAM: peptidase C39, bacteriocin processing; ABC transporter transmembrane domain; ABC transporter-like DNA sequence : ATGAAGATAGATATGAAAAAATATATTATTAAGCAGCATGATGAGAGGGACTGTGGTGCAGCTTGTCTTGCAATGATATC TTATTCTTATGGATTAAAATACCCTCTTCAGAGATACAGAGAATTTAGTAAAACAGATATAAGTGGAACGAACTTATATG GTTTAGTTGATGGAGCAACACAAATTGGATTACAAGCAGAAGCTTTAAATGGAAGCTTAGAAGATTTAGAGGTGGCTATT AATGGAGGAGAAATTAGTTTTCCATTTATTATTCATACAATAGAATCGCATTATATAGTTGTTTTTGATATCAAAAAAAA TAAAGTTACCATAGGTGATCCATCTAAAGGAAAGGTTAAGTATTCTAAAGAAGAATTTATAAAGATTTGGTCAGGGTATG TGATTACTTTCAAAAAAACGCAAGAATTTAAAGAAGGAGATTATTGCCAAGGTAATTTTGCCAGATTCTTTAAACTAATA GGTGAACAGAAGAGTATATTGATAAGTATTTTTTTCTTATCTTTGATTATTTCTTTGATTGGGATAATGGGGACATTTGT TTTTGAAGCAGTTATAGATAATTTCCTACCTAGTAAGGATTCTCTAACAAAAATAGTAAGAGGGCCTATTAATGGTATTT TAAGTTTTAATTTAGTTTTTATTGTTCTAATTGTAGTGTATTTAATTCAAGCAATTATGCAATTAGTAAGAAATTATTTA CTAGCTATTGTTTCAAAAAAAATAGATATTTCATTAATGCTTTCATACTATAGGCATTTAATGAATATTCCTGTTTCGGC TGTAAAAGGCAGGCTAACTGGTGAATATTTAGCACGATTTTCTGATGCTACAACAATACGTTCAGCGGTTTCGGGAGCTA CATTAACAATTATGTTAGATTCTACTATGGTTGTATTTGGAGGTATAATTCTATATTTTAAGAGTAGGTTATTATTTGCT ATATCATTAATAGTAATAAGTATATATTTAATAGTAATCTTATGTTATAAAAAAGCTATAAAAACTATAAATTATAGAAT AATGGAAAATAATTCAAAATTACAATCATATTTTAAAGAAACTATTGATGGAATAGAGACTATTAAAGCTAACCATGCAG AGGAAATAGTGACGCAGAATACAACTCGAAGATTTAATATATTAATTAACGATGTGCTAAAAGGAAGTATTATTAGCTCA TCCCAAGATGTGTTACTTAGATTAGTTGAAACAATTGGTATAGTGGTTGTTTTATGGGTTGGTTTCTATATGGTTTTAAA TGATATAATCACAGTGGGGATGTTACTTACTTTTTATGCATTACAAGGGTATTTTATATCACCTATTAAAAATATTATAA AATTGCAACCTATGATACAGACAGCAGTTGTTGCAGCAGAAAGGCTAAATGATATATTAGACATAGGAGTAGAACGCTAT GATAATGAAGTGGAGAAACTTAATATAGAGACCATAGAATATGAAGGTGTTAGCTTTCGTTATTCGAATAATGAATTAAC ATTAAGGGACATTAATCTAAAGATAAATGAAGGTGAGAGAATAGCAATAGTAGGTGAGAGCGGTTGTGGTAAAACTACGT TGGTAAAATTGCTGCTTGAATTCTATATTCCAGAGCAAGGAAACATAAAAATTAATGGACAAGATATTAGCAATATAAGT TTGGGCGATATAAGAAGAAATATAGCATATGTTGATCAAAATACATTTTTATTTTCGGATAGCATAATAAACAATTTAAA ACTAGGTAATCCAGAATCGACATTTGAGGAAATCAAAGAAGCATGTAGAATAAGTAAAGCTGATAAGTTTATAAATAAAA CACTATTGGGCTATGAAACGTATCTTGATGAAAATGGTCAGAATATTTCGGGAGGACAAAGACAACTTTTGTCAATTGCC AGATCTTTAGTAAAAGGAGCGAATATTATAGTTCTTGATGAAGCTACTAGCAATCTTGATACAATTACAGAAAATAATAT AGGGGATACCATCCTAGATTTAAGTAGAGAGTTAACTCTTATTATTATAGCACATAAACTAAGTACGATAAAAGAATGCG ATAGGATATACGTAATGAAAGAAGGGGGAATTGTTGAACATGGAACTCATAAGGAATTAATAGATAAGAAGGGGGTATAT TATCAAATGTATATAGCGGATAATAAAATAGCCATATGTGCTAATTAG Protein sequence : MKIDMKKYIIKQHDERDCGAACLAMISYSYGLKYPLQRYREFSKTDISGTNLYGLVDGATQIGLQAEALNGSLEDLEVAI NGGEISFPFIIHTIESHYIVVFDIKKNKVTIGDPSKGKVKYSKEEFIKIWSGYVITFKKTQEFKEGDYCQGNFARFFKLI GEQKSILISIFFLSLIISLIGIMGTFVFEAVIDNFLPSKDSLTKIVRGPINGILSFNLVFIVLIVVYLIQAIMQLVRNYL LAIVSKKIDISLMLSYYRHLMNIPVSAVKGRLTGEYLARFSDATTIRSAVSGATLTIMLDSTMVVFGGIILYFKSRLLFA ISLIVISIYLIVILCYKKAIKTINYRIMENNSKLQSYFKETIDGIETIKANHAEEIVTQNTTRRFNILINDVLKGSIISS SQDVLLRLVETIGIVVVLWVGFYMVLNDIITVGMLLTFYALQGYFISPIKNIIKLQPMIQTAVVAAERLNDILDIGVERY DNEVEKLNIETIEYEGVSFRYSNNELTLRDINLKINEGERIAIVGESGCGKTTLVKLLLEFYIPEQGNIKINGQDISNIS LGDIRRNIAYVDQNTFLFSDSIINNLKLGNPESTFEEIKEACRISKADKFINKTLLGYETYLDENGQNISGGQRQLLSIA RSLVKGANIIVLDEATSNLDTITENNIGDTILDLSRELTLIIIAHKLSTIKECDRIYVMKEGGIVEHGTHKELIDKKGVY YQMYIADNKIAICAN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 2e-135 | 45 |
