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Name : Marme_3200 (Marme_3200) Accession : YP_004314253.1 Strain : Marinomonas mediterranea MMB-1 Genome accession: NC_015276 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome C biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 3518035 - 3519975 bp Length : 1941 bp Strand : - Note : KEGG: mmw:Mmwyl1_3410 cytochrome C biogenesis protein CcmF; TIGRFAM: cytochrome C biogenesis protein CcmF; PFAM: cytochrome C assembly protein DNA sequence : ATGATTCCTGAGTTAGCGCATTTTAGCTTGATGCTTGCGACATGCTTCGCGGCATTGGGTTTTGTCGTGCCCTTAGTGGG TTTATATAAACGAGACTCGTTGCTTGTTAGGTTTTCGTTGCCGCTAACCTACCTTGTGGGGGCGGCAGTGCTGATTGCTT TTGTTGGACTTTGTTATTCCTTTTCTGTGGATGACTTTAGTGTTCTTTATGTGGCGGATAATTCCAGTCGATCATTGCCT TTTGGGTTCAAAATTAGTGCGGTATGGGGTGGTCACGAAGGTTCGTTATTACTTTGGGGGCTCATACTATCGGGTTGGAG TTGCTGTGTAGCGTATCGAAGCCGGCATCTTCGAGAAGACGTAAGAGGGATTGTCTTAGCGGTACTGAGCTTGATTTCTT TAGGCTTTTTGTCTTTTCTGCTATTTACCTCGTCGCCTTTTATTCGATTGCTTCCCAATGTACCTCAAAGTGGAGGCGAC CTTAATCCACTTTTGCAAGACTTTGGTTTGATCATTCATCCGCCGATGCTGTATATGGGCTATGTAGGATTTGCTGTCCC GTTTGCGTTTGCCATTGCTGCCTTAGTGACGGGGGAGATGAATGCACAATGGGCTCGTTGGGTTCGACCTTGGGTAAACT TTGCGTGGGCTTTTTTAACGGTCGGTATTGCACTTGGAAGCTGGTGGGCATATTACGAGTTAGGCTGGGGCGGTTGGTGG TTTTGGGATCCAGTAGAAAATGCGTCGTTTATGCCATGGCTTGCGGGGACAGCGCTCATACATTCGTTAGCGGCGTCAGA GAAAAGAGGGGTATTTAAAAGCTGGACTCTGCTGTTAGCAATTTTCACCTTCGGTCTGTCTTTTCTCGGCACATTTCTTG TTCGCTCTGGGGTACTCACATCCGTACATGCCTTTGCGTCGGATCCTTCGAGAGGCGCTTATATCTTAACGATGTTGTTG CTGATTGTTGGTGGTGGGATGCTGCTATTTGCATTGCGTGCTTCCACTTTACGAACGGAGTCATTTTTTGAGTTTTCAGG CAAAGAGAGTTGGCTACTTCTTAATAATATCTTGCTGACAACGTTAACACTGATTGTTTTGGTCGGAACGCTTTCACCTT TAGTGTTGGAGTCAATGGGAATGGGGCGCGTATCCGTCGGCCCTCCTTATTTTAATGCCGTATTTAACCCGATTGCTTGT GCGCTTATTTTCTTGATAGGTATTGGGCCTATTTCTAGATGGCAAGCAACGAGTCCTTTGTACCTGTTACGCGTTAGCTG GTTTCCATTTGTTTTAGCGGTTGCTATCGCGTCATTTTGTTTTCAATTTCTTGTGTTTGATCTGTTTGCCTTTTTAGCGT TTTCGATAGCGCTTTGGGTGGTGATTATGACAATAAGAGATTTGATAGGTAAGGTTATCGTTAAAGATATCAACGTGTTT GAACGAATGCGACGGCTTCCTATGAGCCTCTATGGAATGCACGTGGCTCATCTCGGCGTTGCAATCAGTTTAATTGGCGT GATCCTTGTTAGCCTTAATTCAGAGGAACGTTTTGTTCGTTGGCATATTGGGGAATCGGTCGATGTAAAGCAATACCAGT TTATGTTGATGGATGTCGGTGTTAAGCGGGGAGCAAACTATATTGCCCAAGAGGCGGTCTTTCAAGTATCAGACAATAAT GTCGCATTAGGGGAGATGATTCCCGAAAAACGTTATTATCAAACGCGCGGACAAGTGATGACAGAAGCAGCATTGTCGCC TGGTTTTACCCGTGATTTGTACATCGCACTTGGTGAAAAGTACGATGATGATTCATGGAGTGTAAAAATTTATGTGAAAT CTTTTGTTCGTTGGATATGGTTAGGCGCACTTGTCATGATGCTGGGTGGCATACTCGCTGCGCTTGATAAACGATTTAAA CACCGTGGAGTAGCTGTGTGA Protein sequence : MIPELAHFSLMLATCFAALGFVVPLVGLYKRDSLLVRFSLPLTYLVGAAVLIAFVGLCYSFSVDDFSVLYVADNSSRSLP FGFKISAVWGGHEGSLLLWGLILSGWSCCVAYRSRHLREDVRGIVLAVLSLISLGFLSFLLFTSSPFIRLLPNVPQSGGD LNPLLQDFGLIIHPPMLYMGYVGFAVPFAFAIAALVTGEMNAQWARWVRPWVNFAWAFLTVGIALGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENASFMPWLAGTALIHSLAASEKRGVFKSWTLLLAIFTFGLSFLGTFLVRSGVLTSVHAFASDPSRGAYILTMLL LIVGGGMLLFALRASTLRTESFFEFSGKESWLLLNNILLTTLTLIVLVGTLSPLVLESMGMGRVSVGPPYFNAVFNPIAC ALIFLIGIGPISRWQATSPLYLLRVSWFPFVLAVAIASFCFQFLVFDLFAFLAFSIALWVVIMTIRDLIGKVIVKDINVF ERMRRLPMSLYGMHVAHLGVAISLIGVILVSLNSEERFVRWHIGESVDVKQYQFMLMDVGVKRGANYIAQEAVFQVSDNN VALGEMIPEKRYYQTRGQVMTEAALSPGFTRDLYIALGEKYDDDSWSVKIYVKSFVRWIWLGALVMMLGGILAALDKRFK HRGVAV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 4e-101 | 49 |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-85 | 48 |
