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Name : UMN179_01704 (UMN179_01704) Accession : YP_004420616.1 Strain : Gallibacterium anatis UMN179 Genome accession: NC_015460 Putative virulence/resistance : Unknown Product : heme lyase subunit NrfE Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1841849 - 1843756 bp Length : 1908 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTGCCTGAACTCGGATTTTTAAGTTTACTCATTGTTGTTGCTTTAACCTTTTGTTTAGCTTTTTTGCCGGCTTACGG TTTATGGCGAAACAAACACGCTTTCGCACAATTAGCTTATCCATTAAGTATGCTTTATGCGCTCTTCTGTACAATAACGC TGATAGCATTAGCCTATGCCTTTGCTACTAATGATTTTTCGCTTGAATATGTTGCGCAACATTCTAATTCCAACCTGCCT TTATTCTATAAACTTGCTGCAACTTGGGGCGGGCACGAAGGCTCAATGCTGTTTTGGCTGTTTTCACTTGCGCTTTGGAC AGCCCTGTTTGCCTGTTATAACCGTCACAACGATCAGCGTCTTGTCATCTCAACACTAGTATTAATGGGGATGATCAGCT TTTGTTTTGCGGTTTTTATTCTGTTTTTATCTAATCCTTTCAATAGGTTATATCCAATTCCGCTTGAAGGGCGCGATCTC AATCCAATGCTGCAAGATATCGGTTTGATCGTACACCCACCGCTGTTGTACCTTGGTTATGTCGGTCTGGCGGTCAATTT TGCCTTAGTGATTGCTGCCTTGATTTACCAACAATTTAACGCTGCCTTTGCGAGGTTATGTCGCCCTTGGGTGCTAGCCT CTTGGGCATTTTTAACCATCGGTATCGTATTAGGTTCTTGGTGGGCTTACTATGAACTCGGTTGGGGTGGCTGGTGGTTT TGGGATCCGGTAGAAAATGCTTCACTTATGCCGTGGTTAGTCGCCACTGCGCTGCTACATACACTTATTGTCTATGAGAA ACGGGGAATTTTACTCTATTGGGTGGTCTTGCTCTCAATTTTTGCCTTTTCTTTAAGCCTATTGGGAACCTTTATTGTGC GTTCCGGTGTTTTGGCATCCGTACACGCATTTAGCATTGATCCGCAACGCGGACACGCTTTATTAGCAATCTTCCTGCTG TTCACTTTATGTGGGCTATTATTATTTGCTTTACGCATCAAAGAGTTACATTCAATAGTCAGATTTCAGCTGTTCTCTAA AGAAGCTGCTTTTTTATTCGCCAATATTTTATTCAGCCTCGCAACCTTTATTGTCTTCACCGGCACATTTTATCCAATGA TCTACAATATGTTGGGCTGGGGAACCATTTCTGTCGGCACACCCTATTTTAATCGTCTCATCGTGCCATTAATTTTTATT CTTTTGATCTTAATGCTGTTTTCGCCATATTTGCACTGGCAAAAACTTCCATTTTCATCAATGAAAAAAGTTGCGTTATA TCTGTTGCCGGCGGTAATCATTACCCTCTTACAAATCCTGATGGAACAGAATTTCAACTTTTCTCCGCCTCCGCTTTGGG CGTTTATCTGTTTAAGTTTAGCGTGGTGGTTGCTGCTTAATACGCTCTGTTGCTCACAATGGAAAAATAAAAAACAGTGG CCAATGCGGTTGGCACATATAGGTGTCGCGATCAGCATCATCGGTGGCACAATGAGCAACTATTATGCTAAAGAAATTAG CGTTAAAATGTCTCCCGGCGACACACAAACATTGCATAATTATCAATTTACTTATCTCGGTTTCCGCAATGAAATTGGTC CGAACTATACGGCAGAACGAACTTTTTTCGTGATTAGTCAACAAGATAAACTTATTGCTGAAGTCAGTGCCGAACGACGC TATTATGACGTACGCACAATGAATATGAGTGAAGTCGGGATAAAATGGAGCTGGTTATCCGATCTGTATATCGTTATGGG AAATAAAATTTCAGCGAATGAATTTGCCTTCCGCTTACACTACAAACCCTATATCCGTTGGTTATGGTTTGGCGGATTAT TAGCAATGTTAGGCGGATTTATCGCCGTTTGGAACGCCAGAAAACCCAAACTCAAAGGTGAAAAATGA Protein sequence : MLPELGFLSLLIVVALTFCLAFLPAYGLWRNKHAFAQLAYPLSMLYALFCTITLIALAYAFATNDFSLEYVAQHSNSNLP LFYKLAATWGGHEGSMLFWLFSLALWTALFACYNRHNDQRLVISTLVLMGMISFCFAVFILFLSNPFNRLYPIPLEGRDL NPMLQDIGLIVHPPLLYLGYVGLAVNFALVIAALIYQQFNAAFARLCRPWVLASWAFLTIGIVLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLVATALLHTLIVYEKRGILLYWVVLLSIFAFSLSLLGTFIVRSGVLASVHAFSIDPQRGHALLAIFLL FTLCGLLLFALRIKELHSIVRFQLFSKEAAFLFANILFSLATFIVFTGTFYPMIYNMLGWGTISVGTPYFNRLIVPLIFI LLILMLFSPYLHWQKLPFSSMKKVALYLLPAVIITLLQILMEQNFNFSPPPLWAFICLSLAWWLLLNTLCCSQWKNKKQW PMRLAHIGVAISIIGGTMSNYYAKEISVKMSPGDTQTLHNYQFTYLGFRNEIGPNYTAERTFFVISQQDKLIAEVSAERR YYDVRTMNMSEVGIKWSWLSDLYIVMGNKISANEFAFRLHYKPYIRWLWFGGLLAMLGGFIAVWNARKPKLKGEK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 5e-92 | 42 |
