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Name : UMN179_01741 (UMN179_01741) Accession : YP_004420653.1 Strain : Gallibacterium anatis UMN179 Genome accession: NC_015460 Putative virulence/resistance : Unknown Product : heme lyase subunit NrfE Function : - COG functional category : O : Posttranslational modification, protein turnover, chaperones COG ID : COG1138 EC number : - Position : 1875982 - 1877940 bp Length : 1959 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTGCTGAACTCGGGAATTATGCGTTAGCGTTGGCATTGGCGATTGCTGTTTTGCTGACCATCGTGCCGTTATGGGG CGTTAAACAAAATAATCCATTATTAATTTCCTTAGCAAGACCGATGACAGTGGGGCTGTTTTTAAGCCTCTCTTTTGCTT TCTTTGCGCTAATGTATCTGTTTGCGATTAACGATTTTAGTGTGCAATATGTGGTAAATAATTCCAATAGTCAGTTACCG ATCTATTATCGCCTGTCCGCCGTTTGGGGATCGCACGAAGGATCTTTGTTGTTGTGGATCTGGTTATTATGTTGTTGGAG TTTGGCAGTTGCTGTTTTTAGCCGCCGTTTACCACAAGATTCGGTCGCCAGAGTGTTGGCGGTAATGGGAATGATCAGCA TCGGCTTCCTGATTTTTGTCATTTTTGCTTCCAATCCGTTTACACGCACATTTCCGGATTTGCCGGTTGATGGTAAAGAG TTGAATCCAATGTTGCAGGACATCGGGCTGATTTTCCATCCACCGTTGTTGTATATGGGATATGTCGGTTTTTCAGTGGC GTTTGCCTTTTCTATCGCCTCGTTGATGAGCGGCAATTTGGATACCGCTTGGGCAAGATGGTCAAGACCTTGGACATTAG CGGCTTGGTGTTTCCTGACATTGGGAATTGTGTTGGGATCTTGGTGGGCTTATTATGAGCTCGGCTGGGGCGGCTGGTGG TTTTGGGATCCGGTAGAGAATGCCTCGTTTATGCCGTGGCTTGCCGGTACAGCGTTATTGCATTCCCTTGCGGTAACGGA AAAACGTGGCAGTTTTAAAGCTTGGACAGTTTTATTAGCCATTTTAGTCTTTTCGCTCTGTTTATTAGGCACCTTTTTAG TGCGTTCCGGTATCTTGGTTTCGGTACACGCGTTTGCTTCTGATCCGACTCGTGGCTTATATATTTTGGCGTATTTAGTG GTTGTGATCGGGGGCTCACTGGCATTATATGCTTACAAAGGTAGCCAAATTCGCTCTCGGGATAATTATCAACGCTATTC ACGAGAATCAATGCTGTTACTCAATAATGTGTTGTTGATGACGGCGTTGGCAGTGGTGTTGTTAGGCACATTGTTGCCAT TGGTACATAAACAGTTAGGCTTAGGTTCAATCTCAATTGGCGCACCGTTTTTTGACCAAATGTTTTTAATTATTATGGTG CCTTTCTCTTTGTTGTTAGGAATTGGGCCTTTAGTTAAATGGCGACGCGATCAATTTTCTGTGATTAGAAAACCGGTGGT GATTAGCGTGATTTTAATGGCGTTATTAGGGTTTATTTTGCCGTTAATATTGGCAGATAACATCACGGTTAGCGTTGTTT TAGGCACAATGATGACAGCAATTATCGTATTGTTGGGTGGTTATGAATTGCAGCAACGTGCCTCACATCGCAGCTCGTTT TTGCAAGGCATCGGTAAACTTTCTCGTTCACATTGGGGAATGTTTTTTGCCCATATCGGTGTTGCAGTTACTGTATTCGG CATTGCTTTCAGTCAAAATTTCAGCATTGAAAAAGATGTGCGAATGAGTGTCGGAGATAGCGTTGAAGTTGCCGGTTATC AATTTACCTTCAGTCAGGTTAAAGAGAGTAATGGGCCTAATTATTTAGGTGCTACGGCAGAAATTGATGTCAGCAGAGAG GGCAAAAAAATTACGCAATTGGAAGCGGAAAAACGTTTTTATCAAGTGAGCCGAATGAGTATGAGTGAAGCGGCGATTGA TGGCGGGATTACGCGCGATCTTTATGCTGCACTGGGCGAACGTTTGGATAACGGTGCTTGGGCAGTAAGACTCTATTATA AGCCGTTTATCCGCTGGATTTGGTTTGGTGGTTTATTGATGGCATTGGGCAGTGTTTTATGTATGTGCGACCGCCGTTAT CGTTTCAGTAAATTGGTGAAGGGGGCAGTTTATGAATAA Protein sequence : MIAELGNYALALALAIAVLLTIVPLWGVKQNNPLLISLARPMTVGLFLSLSFAFFALMYLFAINDFSVQYVVNNSNSQLP IYYRLSAVWGSHEGSLLLWIWLLCCWSLAVAVFSRRLPQDSVARVLAVMGMISIGFLIFVIFASNPFTRTFPDLPVDGKE LNPMLQDIGLIFHPPLLYMGYVGFSVAFAFSIASLMSGNLDTAWARWSRPWTLAAWCFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENASFMPWLAGTALLHSLAVTEKRGSFKAWTVLLAILVFSLCLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPTRGLYILAYLV VVIGGSLALYAYKGSQIRSRDNYQRYSRESMLLLNNVLLMTALAVVLLGTLLPLVHKQLGLGSISIGAPFFDQMFLIIMV PFSLLLGIGPLVKWRRDQFSVIRKPVVISVILMALLGFILPLILADNITVSVVLGTMMTAIIVLLGGYELQQRASHRSSF LQGIGKLSRSHWGMFFAHIGVAVTVFGIAFSQNFSIEKDVRMSVGDSVEVAGYQFTFSQVKESNGPNYLGATAEIDVSRE GKKITQLEAEKRFYQVSRMSMSEAAIDGGITRDLYAALGERLDNGAWAVRLYYKPFIRWIWFGGLLMALGSVLCMCDRRY RFSKLVKGAVYE |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 6e-152 | 66 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 3e-136 | 54 |
