|
Name : iscS (BCTU_398) Accession : YP_004590212.1 Strain : Buchnera aphidicola host: Cinara tujafilina Genome accession: NC_015662 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cysteine desulfurase Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG1104 EC number : - Position : 438176 - 439360 bp Length : 1185 bp Strand : + Note : IscS DNA sequence : ATGACAAATAAACCGATTTATTTAGATTACGCAGCAACTACCCCATTAGACCCAAAAGTAGCAAAAAAAATGAAAAATTA TTTTACTATTGATGGAAATTTTGGAAATGCAGCATCACGATCTCATCAATTTGGTTGGAATGCAGAAGAAGCAGTAGATA TTGCAAGAAATGAAATTGCTACTTTAATTGGAGCAGATTCACGGGAAATTATTTTTACTTCCGGAGCAACTGAATCTAAT AATTTAGCAATTAAAGGAATTTATGAATTTTATAAAAAAAAAAATAATCATATAATTACAAGTAAAATTGAACATAAATC CGTTTTAGATACTTGTAGATATTTAGAAAATGATGGTTGTCAAATAACATACTTAAGTCCTCAATCCAATGGTATAATAG ATATTGAAGAAATAAAAAAAAATATTCTACCCACTACACTATTAATATCTATCATGCATGTTAATAATGAAACTGGAGTA ATACAAGATATTAAATCAATTGGAAAATTATGTAAAAAAAAAGGAATATTTTTTCACGTTGATGCTACACAAAGTGTTGG AAAAATTCATATTAATTTAAAAAAATTAATGATTGATTTGTTATCTTGTTCTGCTCATAAAATATATGGACCTAAAGGTA TAGGAATTTTATATGTACGACGTCAACCTCGAGTACGTTTAACAGCTCAAATACATGGCGGAGGTCATGAACGAGGCATG AGATCTGGAACATTAGCAGTGCATCAAATTGTTGGTTTTGGAAAAGCCTGTAAAATATTAACAAAAAAAATGAAAAAAGA GAATATCCAATATATTCAATTAAGAAATATGTTATGGAATGGTATTAAAAATATACCAGAAATTTATTTAAATAGTCCAT TAAAATATATTACAAGCAATATTTTAAATGTTAGTTTTAATTTTATTGAGGGTGAATCATTAATAATGGCTTTAAAAAAT TTAGCAATTTCTTCAGGATCTGCTTGTACATCAGCTAGTTTAGAAGCCTCTTATGTATTACGTGCAATGGGTGTCAAAGA TGAATTGGCTCATAGTTCTATTCGTTTTTCTTTAGGTAGATTTACATCAATTAATGATATTCAACGTACAATAAAAAAAT ACATAAAGCAGTTAATAAATTACGAATTCTTTCTCCATTATGGGAAATGTTTGAAAAAGGTGTAA Protein sequence : MTNKPIYLDYAATTPLDPKVAKKMKNYFTIDGNFGNAASRSHQFGWNAEEAVDIARNEIATLIGADSREIIFTSGATESN NLAIKGIYEFYKKKNNHIITSKIEHKSVLDTCRYLENDGCQITYLSPQSNGIIDIEEIKKNILPTTLLISIMHVNNETGV IQDIKSIGKLCKKKGIFFHVDATQSVGKIHINLKKLMIDLLSCSAHKIYGPKGIGILYVRRQPRVRLTAQIHGGGHERGM RSGTLAVHQIVGFGKACKILTKKMKKENIQYIQLRNMLWNGIKNIPEIYLNSPLKYITSNILNVSFNFIEGESLIMALKN LAISSGSACTSASLEASYVLRAMGVKDELAHSSIRFSLGRFTSINDIQRTIKKYIKQLINYEFFLHYGKCLKKV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AAT96060.1 | cysteine desulfurase | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-107 | 61 |
