|
Name : Cycma_4248 (Cycma_4248) Accession : YP_004776182.1 Strain : Cyclobacterium marinum DSM 745 Genome accession: NC_015914 Putative virulence/resistance : Unknown Product : anion transporter Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0471 EC number : - Position : 5164556 - 5166016 bp Length : 1461 bp Strand : + Note : PFAM: Sodium:sulfate symporter transmembrane region; TIGRFAM: anion transporter; COGs: COG0471 Di- and tricarboxylate transporter; InterPro IPR001898; KEGG: zpr:ZPR_4168 sodium:sulfate symporter; PFAM: Sodium/sulphate symporter; SPTR: Anion transporter; T DNA sequence : ATGCAAACTAAAAAAATCGGGTTGTTCCTAGGCCCCATTGTATTTCTAGGTATCTATTTTGGCATTGCGCCTGATGGATT GTCTCCTGAAGGTATTTCGTTACTTGCTGTTACATTTTGGATAGCCATTTGGTGGATAACAGAAGCCATTCCAATTGCAG CCACCGCCCTACTTCCTTTAGTAATCTTTCCGTTAACTGGAATTATGGCCTTAAAACCTACCTCTATACCCTATTCTGAT CCGATGGTACTACTGTATATGGGGGGCTTTATGATTGCCGTAAGTATTGAGAAATGGAACCTTCACAAAAGGATAGCCCT GAAAATTATCTCTTACTTAGGTACAGATTTAAAAAGAATAGTCCTGGGATTTATGGTGGCCACAGCTTTTCTTTCCATGT GGATTTCCAATACTGCCACTTCCTTAATGATGCTTCCCATTGCCATAGCTGTGGTGGTTCAAATGTCTCAGTCCAATAAA GGAACCGAAAACGCTTTTGGGCAATCCTTAATGTTAGGAATTGCCTACAGTGCCTCAATTGGCGGTATTGCTACCATCAT AGGAACTCCAACAAATATTATATTGACAGGGGTGGTAAAAAGCACTTACGGGATGGAGATTAGTTTTGCGCAATGGATGT TAATCGGTTTGCCTTTAGCTAGTTCACTTTTATTTGTATGCTGGTATTATTTGGTGAATTATGCTTTTAAATTTCCTAAA AGCTTACAATTGGAAGGTGGTAAAGATGAAATTAACCGTCAGTTGGAAGCGTTGGGTCCAATTAGTTTGCAAGAACGTAG GGTGCTTTATGTATTTTTAATGGTGAGTTTCTGCTGGATGTTTAGAAGTTTTATCTTGCAAACCTATATTCCGGTATTGA ATGATACCATTATTGCCATTTTTGGCGTATTGTTACTCTTCGTAATCCCTGCCTCCAATGAAAAAAATGAGCGCTTATTG GATTGGAAGGTAGCTGAGAAAATTCCTTGGGGGATTTTAATCTTATTTGGGGGTGGATTATCTCTGGCCAAAGCTTTTCA AGAAACCGGTTTAGCCAATTGGATTGGAGAACAATTTGTACTGCTCAATAATGTTCCCTTTTGGCTGTTTTTATTCATTA TTATTGCAGCTGTAAATTTCCTGACAGAAATAACTTCCAATGTAGCCACTGCATCTATGCTTCTACCCATCCTATCTGCA GTTGCTTTGGCCATGGGGGTACATCCTTATGCTTTAATGGTAGGGGCCACAATGGCCGCTTCATGTGCTTTTATGTTACC TGTAGCCACTCCTCCCAATGCAGTTGTTTTTGGTTCCGGTTATTTAACCATTCCGGTGATGATGCGAACCGGATTATTTC TAAATCTACTCTCAATAATTTTGATATTAATCGTGGCTTTATTTTACCTACCGTGGATTTGGGACCTTGATTTAAATAAA TATCCATCAGCATGGAAGTAA Protein sequence : MQTKKIGLFLGPIVFLGIYFGIAPDGLSPEGISLLAVTFWIAIWWITEAIPIAATALLPLVIFPLTGIMALKPTSIPYSD PMVLLYMGGFMIAVSIEKWNLHKRIALKIISYLGTDLKRIVLGFMVATAFLSMWISNTATSLMMLPIAIAVVVQMSQSNK GTENAFGQSLMLGIAYSASIGGIATIIGTPTNIILTGVVKSTYGMEISFAQWMLIGLPLASSLLFVCWYYLVNYAFKFPK SLQLEGGKDEINRQLEALGPISLQERRVLYVFLMVSFCWMFRSFILQTYIPVLNDTIIAIFGVLLLFVIPASNEKNERLL DWKVAEKIPWGILILFGGGLSLAKAFQETGLANWIGEQFVLLNNVPFWLFLFIIIAAVNFLTEITSNVATASMLLPILSA VALAMGVHPYALMVGATMAASCAFMLPVATPPNAVVFGSGYLTIPVMMRTGLFLNLLSIILILIVALFYLPWIWDLDLNK YPSAWK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| DIP0179 | NP_938571.1 | hypothetical protein | Not tested | Not named | Protein | 1e-55 | 41 |
