Gene Information

Name : dnaQ (RJP_0829)
Accession : YP_004885163.1
Strain : Rickettsia japonica YH
Genome accession: NC_016050
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : DNA polymerase III subunit epsilon
Function : -
COG functional category : L : Replication, recombination and repair
COG ID : COG0847
EC number : -
Position : 1051249 - 1051938 bp
Length : 690 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGTCGAGTTTAAGAGAAATAATTTTAGATACCGAGACTACGGGACTTGACCCACGACAAGGTCATCGAATCGTTGAGAT
CGGTGCTATTGAGATGGTAAATAAGGTATTAACAGGCAAGAATTTTCATTTTTATATTAATCCTGAGCGAGATATGCCGT
TTGAGGCTTATAGAATTCATGGCATATCCGGCGAATTTTTAAAAGACAAGCCTCTATTTCATACAATAGCCGATGATTTT
TTAGAGTTTATTTCAGATAGCAAACTGATTATTCATAATGCTCCTTTCGATATTAAATTTCTAAATCACGAATTATCATT
ATTAAAAAGAACCGAAATTAAACTCTTGGAACTAGCAAATACTATTGATACTTTAGTAATGGCTAAAAGCATGTTTCCAG
GCTCAAAATATAATCTTGATGCATTATGTAAAAGATTTAAAGTTGATAATTCAGGTAGGCAGCTTCACGGAGCTTTGAAA
GATGCAGCATTACTTGCAGAAGTATATGTAGAGTTAATGGGCGGTAGACAATCCGCTTTTAAAATGGTTGATAAATCTGC
CGGAATAAATAATTTAGCAACTAATCAAGTAAATAACAAAACAGAGCAAGCTACTATTGTTATTAAACCTACAAAAGAAG
AGCTGCAAAAACATAAAGAGTTTCTCAGTAGGATTTTAAAAACTGCTTAG

Protein sequence :
MSSLREIILDTETTGLDPRQGHRIVEIGAIEMVNKVLTGKNFHFYINPERDMPFEAYRIHGISGEFLKDKPLFHTIADDF
LEFISDSKLIIHNAPFDIKFLNHELSLLKRTEIKLLELANTIDTLVMAKSMFPGSKYNLDALCKRFKVDNSGRQLHGALK
DAALLAEVYVELMGGRQSAFKMVDKSAGINNLATNQVNNKTEQATIVIKPTKEELQKHKEFLSRILKTA

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
dnaQ AAO17223.1 DnaQ Not tested tcd island Protein 5e-47 49