Name : dnaQ (RJP_0829) Accession : YP_004885163.1 Strain : Rickettsia japonica YH Genome accession: NC_016050 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase III subunit epsilon Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0847 EC number : - Position : 1051249 - 1051938 bp Length : 690 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCGAGTTTAAGAGAAATAATTTTAGATACCGAGACTACGGGACTTGACCCACGACAAGGTCATCGAATCGTTGAGAT CGGTGCTATTGAGATGGTAAATAAGGTATTAACAGGCAAGAATTTTCATTTTTATATTAATCCTGAGCGAGATATGCCGT TTGAGGCTTATAGAATTCATGGCATATCCGGCGAATTTTTAAAAGACAAGCCTCTATTTCATACAATAGCCGATGATTTT TTAGAGTTTATTTCAGATAGCAAACTGATTATTCATAATGCTCCTTTCGATATTAAATTTCTAAATCACGAATTATCATT ATTAAAAAGAACCGAAATTAAACTCTTGGAACTAGCAAATACTATTGATACTTTAGTAATGGCTAAAAGCATGTTTCCAG GCTCAAAATATAATCTTGATGCATTATGTAAAAGATTTAAAGTTGATAATTCAGGTAGGCAGCTTCACGGAGCTTTGAAA GATGCAGCATTACTTGCAGAAGTATATGTAGAGTTAATGGGCGGTAGACAATCCGCTTTTAAAATGGTTGATAAATCTGC CGGAATAAATAATTTAGCAACTAATCAAGTAAATAACAAAACAGAGCAAGCTACTATTGTTATTAAACCTACAAAAGAAG AGCTGCAAAAACATAAAGAGTTTCTCAGTAGGATTTTAAAAACTGCTTAG Protein sequence : MSSLREIILDTETTGLDPRQGHRIVEIGAIEMVNKVLTGKNFHFYINPERDMPFEAYRIHGISGEFLKDKPLFHTIADDF LEFISDSKLIIHNAPFDIKFLNHELSLLKRTEIKLLELANTIDTLVMAKSMFPGSKYNLDALCKRFKVDNSGRQLHGALK DAALLAEVYVELMGGRQSAFKMVDKSAGINNLATNQVNNKTEQATIVIKPTKEELQKHKEFLSRILKTA |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
dnaQ | AAO17223.1 | DnaQ | Not tested | tcd island | Protein | 5e-47 | 49 |