Gene Information

Name : glcB (BDGL_000970)
Accession : YP_004995238.1
Strain : Acinetobacter calcoaceticus PHEA-2
Genome accession: NC_016603
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : malate synthase G
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1017177 - 1019342 bp
Length : 2166 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGACTGCACGTATTCAAAAAGGCAAGTTAGCGATTGCTAAAGAACTTTACGATTTTATCGAAAATGAAGCTTTACCAGG
TTCTGGTTTAGATAGTGAAACTTACTGGAAGAACTTTGAGCAAGTTGTTGTCGATCTTAGCCCAAAAAATAAAGCATTAT
TGGCTAAGCGTGATGAATTACAAGCAAAAATTGATGAGTGGCACCGTAACAACAAATTTGAATTAGGTGCTTATAAAGCG
TTCTTAACTGAAATTGGTTATTTATTACCAGAAGTTGAAGATTTTCAAATCACTACTGAAAATGTAGATGAAGAAATTGC
GTTGTTGGCAGGACCACAGTTAGTTGTACCTGTACGTAATGCACGTTATTGCTTAAATGCAGCAAATGCCCGTTGGGGTT
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AACAAAATATGCAATTGAGCAAAATAAACTCGTTGTAACTTTGAAAGATGGTTCAAAAACAGGTTTAGCTCATGAAGCTC
AGTTTGTTGGTTTCAATGGTGAGGAAGCAAATCCTTCAGAAGTTGTACTTTTAAGTAATGGTCTTCATGTCATTATCGAA
ATTGATGCAAATAGCCCAATTGGACAAACTGATCCAGCGGGTGTTAAAGATTTAACATTTGAAGCGGCAGTAACCACAAT
TCAAGATTTGGAAGACTCTGTTGCGGCTGTCGATGCAGAAGAAAAAGTTGAAGGTTACCGTAACTGGTTAGGTTTAATGA
AGGGTACACTTCAAGAATCTATTGAAAAGAATGGTAAAACGATTGTTCGTGATCTAAATAAAGATCGCGAAATTAAAAAC
TTAATTGGTGGTACAACAAAACTTCATGGTCGTTCACTTATGTTACTTCGTAACGTAGGTCACTTAATGACTAACCCAGC
TATTTTGGTAGACGGCGAAGAAATTTTTGAAGGTATTATGGATGCATTGGTAACTCCATTGTTATCAATTGCTGATATTC
GTAGTACAAACGAAAATAAAAACTCTCGTAAAGGTTCTATGTATATTGTTAAGCCAAAAATGCATGGTCCTGAAGAAGTT
GCGTTTGCTGTAGAGTTATTTGAACGTGCTGAACAGGCGATTGGATTACCACCTAAATCGTTAAAAATCGGTATTATGGA
TGAAGAGCGCCGTACGTCTGTAAACTTGAAAAACTGTATTGCTGCTGCTAAAGACCGTACAATCTTTATTAATACTGGCT
TTATGGACCGTACGGGTGACGAAATCCATACTTCTATGGAAGCTGCGCCAGTTGTTCGTAAGGAAGCTGTTAAAACACAA
AAATGGATTGCTGCTTACGAAAACCGTAACGTTGCAATTGGCTTGAAATGTGGTTTACAAGGTAAAGCACAGATTGGTAA
AGGCATGTGGCCAAAGCCAGATAGCATGAAGGATATGTTAGCAACTAAAGCTGCACATCCAAATGCTGGTGCTTCATGTG
CTTGGGTTCCATCTCCAACTGGTGCTGTACTTCACGCGATGCATTACCATCAAGTGAATGTAAAAGCACGTCAAGATCAG
TTAAAAGCTGAAGAAATGTTGTCATTAGATGACTTGTTAACTCCTCCATTTGCACCTGATACAAATTGGTCAGCGGAAGA
GATTAACAATGAACTTGAAAATAACTGCCAAGGTATCTTAGGTTATGTTGTTCGTTGGGTTGACTTAGGTGTAGGTTGTT
CGAAAGTTCCTGATATTAACAACGTGGGCTTAATGGAAGACCGTGCAACATTACGTATTTCTTCTCAACACGTTGCTAAC
TGGTTACGTCACGGTATTGTAACTCGTGAACAAGTTGAAGAAGTGCTTAAACGTATGGCAAAAATTGTTGATGAGCAAAA
TGCGAATGACCCATTGTATAAACCAATGGCATCTAACTTTGAAACAAATATTGCTTTCCAAGCAGCTTCTGACCTTATCT
TCAAAGGTTGTGAACAGCCTTCTGGTTACACTGAGCCGTTACTTCATGCTGCTCGTTTGAAGTTAAAAGGTTATACAGGT
GATTAA

Protein sequence :
MTARIQKGKLAIAKELYDFIENEALPGSGLDSETYWKNFEQVVVDLSPKNKALLAKRDELQAKIDEWHRNNKFELGAYKA
FLTEIGYLLPEVEDFQITTENVDEEIALLAGPQLVVPVRNARYCLNAANARWGSLYDALYGFDVISEEGGAEKGKGYNPV
RGAKVIEFAKNFLNEVFPLAQGSHADATKYAIEQNKLVVTLKDGSKTGLAHEAQFVGFNGEEANPSEVVLLSNGLHVIIE
IDANSPIGQTDPAGVKDLTFEAAVTTIQDLEDSVAAVDAEEKVEGYRNWLGLMKGTLQESIEKNGKTIVRDLNKDREIKN
LIGGTTKLHGRSLMLLRNVGHLMTNPAILVDGEEIFEGIMDALVTPLLSIADIRSTNENKNSRKGSMYIVKPKMHGPEEV
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LKAEEMLSLDDLLTPPFAPDTNWSAEEINNELENNCQGILGYVVRWVDLGVGCSKVPDINNVGLMEDRATLRISSQHVAN
WLRHGIVTREQVEEVLKRMAKIVDEQNANDPLYKPMASNFETNIAFQAASDLIFKGCEQPSGYTEPLLHAARLKLKGYTG
D

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcB CAE85241.1 GlcB protein, malate synthase G Not tested PAI V 536 Protein 0.0 58