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Name : glcD (NIES39_A06600) Accession : YP_005067036.1 Strain : Arthrospira platensis NIES-39 Genome accession: NC_016640 Putative virulence/resistance : Unknown Product : glycolate oxidase subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 629582 - 631051 bp Length : 1470 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCAAGCCCCACCGTAAGCCGGAACTGGAAACCGATAATCAAAGAATTTGCCGCCGTTGTAGGTAAGCGGGGGGTGGT TCAGCGACGGGAAGAATTGCTAGTTTATGAATGTGATGGACTAACCAGTTATCGCCAACGTCCGGCTTTGGTGGTTCTTC CTCGCACCACAGAAGAAGTCGCAGCAGCCGTGAAAATATGCGATCGCCATAATATACCCTGGGTAGCGAGAGGGGCGGGA ACCGGACTATCAGGAGGTGCATTACCCGTCACTGATTGCGTGATGATTGTCACCGCCCTAATGCGCCAAATTCTGAAAGT AGACCTCGAAAATCAGCAGGTCGTCGTACAACCAGGGGTGATTAATAACTGGGTAACTCAAACCGTCAGCGGTTCAGGAT TTTACTACGCCCCCGACCCCTCCAGCCAGATTATCTGTTCCATTGGCGGTAATGTAGCCGAAAATTCCGGTGGTGTTCAC TGTTTGAAATATGGAGTCACCACTAACCACGTCCTGGGCTTAAAAATCGTTACCCCAGACGGGTCTATCGTCGATTTAGG CGGTTCAATTCCGGAAATGCCAGGATATGACCTGACGGGTTTATTTGTGGGGTCAGAAGGGACTCTAGGCGTGGCTACGG AAATCACCCTCAGAATTCTGAAAGCCCCCGAATCGATTTGTGTTCTGTTGGCAGATTTTGCTACCATTGAAGAAGCCGGA CAATCGGTATCTGATATTATCGGGGCGGGGATTATTCCCGGTGGTATGGAAATTATGGATAATCTCAGTATTAATGCGGT GGAAGATGTCGTTAATACCGGATTATATCCCCGAGATGCCGGGGCGATTTTATTGGTAGAATTAGATGGTTTACAGGTGG AGGTAGACCGCAATAAACAGCGGGTGGCAGATATTTGTAAACAAAATGGGGCGCGGAATATTACTACCGCCAATGAACCG GAAAAACGCTTGAAAATGTGGAAGGGTCGGAAGGCGGCATTTGCGGCGGCGGGTCATGTTAGCCCGGATTATTATGTACA AGATGGGGTGATTCCTCGGACTCAGATGGCTTATGTATTGAAAGAAATTGCGGCTTTAAGCGAAAAGTATGGCTATCGCA TCGCTAATGTGTTTCATGCGGGAGATGGGAATTTACATCCTTTGATTCTCTATGATAATTCTGTGGCAGGTGCCTTAGAG ACGGTGGAAGAAATTGGCGGCGAAATTTTGAAAATTTGTGTTGATGTGGGTGGGAGTTTGTCCGGGGAACATGGTATCGG GGAAGATAAAAAGTGTTATATGAATAAGATGTTTAATGAAGAGGATTTGGAAACTATGCAATGGGTGCGATCGGTTTTTA ATGCTAAGGGTTTGGCTAATCCTGGTAAAATGTTCCCTACACCTCGCACCTGTGGAGAATCCGCTAAAGTTCAGAATGTT AAGAAGTTTGAAGGTGCTGAGGTATTTTGA Protein sequence : MSSPTVSRNWKPIIKEFAAVVGKRGVVQRREELLVYECDGLTSYRQRPALVVLPRTTEEVAAAVKICDRHNIPWVARGAG TGLSGGALPVTDCVMIVTALMRQILKVDLENQQVVVQPGVINNWVTQTVSGSGFYYAPDPSSQIICSIGGNVAENSGGVH CLKYGVTTNHVLGLKIVTPDGSIVDLGGSIPEMPGYDLTGLFVGSEGTLGVATEITLRILKAPESICVLLADFATIEEAG QSVSDIIGAGIIPGGMEIMDNLSINAVEDVVNTGLYPRDAGAILLVELDGLQVEVDRNKQRVADICKQNGARNITTANEP EKRLKMWKGRKAAFAAAGHVSPDYYVQDGVIPRTQMAYVLKEIAALSEKYGYRIANVFHAGDGNLHPLILYDNSVAGALE TVEEIGGEILKICVDVGGSLSGEHGIGEDKKCYMNKMFNEEDLETMQWVRSVFNAKGLANPGKMFPTPRTCGESAKVQNV KKFEGAEVF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcD | CAE85245.1 | GlcD protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-113 | 50 |
