|
Name : nrfE (Pmu_12960) Accession : YP_005177151.1 Strain : Pasteurella multocida 36950 Genome accession: NC_016808 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein NrfE Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1401011 - 1402936 bp Length : 1926 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATCCCAGAACTTGGTTTTTTGGCTTTACTGATCGCTTCTTTGTGTGCGTTCTTGCTTGCGCTAGTGCCACAAGTCGG CATTTTTTTGCGTAAGCCGTATATGATTGGTACTGCGTGGAATTTGAGTTATCTCTTTGGGATATTTACTTGTATAGCGT TATTCTGCCTTGCCTATGCCTTTGCGCTCGATGATTTTTCTGTGCAATATGTGGCACATCATTCTAATTCACAACTGCCA ATTTTCTTTAAAGTGTCTGCTACTTGGGGTGGACATGAAGGGTCGATGCTATTTTGGTTGTTTGCTTTAGCACTCTGGTT GATTCTCTTTGCGTTTTCCAGTCGTCATAAAGATCCGATTATTTGTGCGCGAGCACTTTCAGTGCTTGGGCTCATTTGTT TTGGTTTTTGTCTCTTTATTTTATTTTTATCAAATCCATTTGAACGCAGTTTTCCACAAGCATTTGAAGGGCGTGATTTA AATCCGATGTTGCAAGATGTGGGGCTGATTTTTCACCCACCTTTATTGTATTTGGGCTATGTGGGCTTTGCAGTCAATTT TGCTATTACCATTTCTGCTTTAGTGAGTGGGCATTTAGATGCCGCCGTGGCTCGCATGATGCGCCCTTGGGTTTTGCTAT CTTGGTTATTTTTAACTTTAGGGATTGTGTTAGGGTCTTGGTGGGCGTATTACGAACTAGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTT TGGGATCCGGTCGAGAACGCCTCATTGATGCCTTGGTTATTAGGTTTGGCACTATTACATAGTCTATCTATCACAGAACA GCGTGGCATTTTTAGTTACTGGACGCTGCTATTTTCACTTTTGGCATTTTCTTTCAGTTTACTGGGTACCTTCATCGTGC GCTCGGGCGTCTTAACTTCTGTGCACGCGTTTGCAGTAGATGGCGATCGGGGAATTGCCTTACTGATTTTATTCTTTTTA TTGACTGTGAGTGCATTCACTTTATTTGCATTAAAGGTTAACTTGCCACAAAGTGCGGTACGTTTCCGTTTAATTTCGAA GGAAAATGCTCTGTTGCTTCTCAATATTTTATTGACGATTGCCACGGTCAGTGTCTTTTTAGGCACTTTTTATCCGATTG TCTTTACCGCATTACAATGGGGATCTATTTCAGTCGGCGCGCCGTATTTTAATACAATTTTTCTGCCACTGTTTGTGATG GCAATGCTTGCTATGATTTTGGTGTTGTCTTTACGTTGGAAAACACTGAATAAAAAACCGTTTATTCAACGTACGTTATT GTTATTTCCCGCGCTTATATTGGCTTATGGATTAATCCGTTATTATGTAGATCATAACCAAGGGTTGCCTTTCAATTTCA GCGCTTATGGCTTGTTAAGCTTGTCGATTTGGTTAATTCTGGCGACGTTATGGCTCCCATGGACGCAGCTGAAACTGAAA CAGCTCGCCATGGTGATCGCGCATTTAGGTGTAGCGATAACGGCAATTGGGGCGATCATGAGTAGCTATTACAGCAGTGA GATTGGCGTGCGCTTGGCACCGCAACAACGCCAAAAACTCGGTGATTACGAGTTTCACTATCAGGGTTTTCAGCATGTGT TAGGTCCGAATTACACCAGTGAAAAAGCCCATTTTGTGGTGACAAAGCAAAACCAAGCTTATACTGAGATTTACCCAGAA CGCCGTTATTATGATGTGCGTACTATGAACATGAGCGAAGTTGGGATTGATTGGGGGTGGCTTGGTGATGTCTATATTGT AATGGGCGATAAATTGGGACAAGGCGAATTTACTTTCCGCTTGCAATATAAACCTTTTATCCGTTGGTTATGGTTTGGCG GGCTTTTAATGGCACTCGGTGCCTTGCTTGCCATATTTTCCTTGCGCAATAGCAATAAACTAAAACCACGTCGTCAGTCA GATTGA Protein sequence : MIPELGFLALLIASLCAFLLALVPQVGIFLRKPYMIGTAWNLSYLFGIFTCIALFCLAYAFALDDFSVQYVAHHSNSQLP IFFKVSATWGGHEGSMLFWLFALALWLILFAFSSRHKDPIICARALSVLGLICFGFCLFILFLSNPFERSFPQAFEGRDL NPMLQDVGLIFHPPLLYLGYVGFAVNFAITISALVSGHLDAAVARMMRPWVLLSWLFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLLGLALLHSLSITEQRGIFSYWTLLFSLLAFSFSLLGTFIVRSGVLTSVHAFAVDGDRGIALLILFFL LTVSAFTLFALKVNLPQSAVRFRLISKENALLLLNILLTIATVSVFLGTFYPIVFTALQWGSISVGAPYFNTIFLPLFVM AMLAMILVLSLRWKTLNKKPFIQRTLLLFPALILAYGLIRYYVDHNQGLPFNFSAYGLLSLSIWLILATLWLPWTQLKLK QLAMVIAHLGVAITAIGAIMSSYYSSEIGVRLAPQQRQKLGDYEFHYQGFQHVLGPNYTSEKAHFVVTKQNQAYTEIYPE RRYYDVRTMNMSEVGIDWGWLGDVYIVMGDKLGQGEFTFRLQYKPFIRWLWFGGLLMALGALLAIFSLRNSNKLKPRRQS D |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 5e-84 | 47 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 8e-85 | 43 |
