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Name : HIB_12520 (HIB_12520) Accession : YP_005179277.1 Strain : Haemophilus influenzae 10810 Genome accession: NC_016809 Putative virulence/resistance : Unknown Product : heme lyase, CcmF subunit Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1286579 - 1288525 bp Length : 1947 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTGCTGAATTAGGAAATTATGCGCTGGCTTTAAGTTTAGCTGTATCGCTTATGTTGGCGATTTTCCCTTTGTGGGG GGCGGAAAAGGGCAATGCACAATTAATGGCATTAGCTCGCCCAATGACTTATGGTTTATTTGCAAGCCTAAGCGTTGCTT TTGCTGCGCTATTTTATTTATTCGCAGTCAATGATTTTAGCGTGCAATATATTGTAAATAATTCTAATACTACTTTACCC ATTTATTATCGTTTATCTGCTGTATGGGGTTCCCATGAAGGCTCTTTGTTACTGTGGATTTGGTTACTGGCGGTTTGGTC ATTTGCCGTTGCTTTATTGAGTAAACATTTACCCCAAGAAGCGGTTGCTCGCGTGCTTGGTATTATGGGGATTATTAGCG TCGGTTTTGTATTGTTCGTCTTGTTTACCTCAAATCCTTTCACGCGTACTTTCCCTGATTTCCCAGTGGATGGAAAAGAA CTTAACCCAATGTTGCAAGATGTGGGCTTAATTTTCCACCCTCCATTACTTTATATGGGCTATGTGGGTTTTTCTGTGGC ATTTGCGTTTGCGATTGCATCCTTAATGACTGGAAAATTAGATTCAGCTTGGGCGCGTTGGTCACGTCCTTGGACGCTTG CTGCTTGGGTGTTTTTAACTTTAGGTATCGTACTCGGTTCTTGGTGGGCTTATTATGAGCTTGGCTGGGGGGGCTGGTGG TTCTGGGATCCAGTAGAAAACTCATCGTTTATGCCGTGGCTTGCTGGTACTGCATTGATTCACTCTCTTTCTGTGACAGA AAAACGTGGTTCTTTTAAAGCTTGGACGGTATTACTTGCGATTTTAGCCTTTTCACTTTGTCTGCTCGGCACATTCTTAG TTCGTTCTGGTATCTTAGTTTCAGTTCACGCATTTGCATCGGATCCAACTCGTGGTTTGTATATTTTGGCTTACCTCGTT GTGGTAATTGGCGGTTCGCTTGCGCTCTATGCGTATAAAGGCAGTCAAATTCGTTCTCGTGATAATGCAGAACGCTATTC ACGTGAAAGTATGTTGTTATTAAATAATATCTTATTAATGACCGCACTTTGCGTTGTATTCTTAGGAACGTTGTTACCAC TTGTTCACAAACAACTGGGTTTAGGCTCTATTTCTATTGGTGCGCCGTTCTTTGATCAAATGTTCTTAATTATTATGACA CCATTTGCATTATTGCTTGGTATTGGACCTTTAGTGAAATGGCGTAGAGACCAATTTTCTGCAATTCGTACGCCTGTTGT TATCTGCGTATTTGTTATGCTGATTGCAGGTTTTGCGTTACCTTATTTCTTGCAAGATAAAATTACCGTGAGTTCAGTGC TTGGTTCAATGATGACTGTGATTATTGCGTTACTTGCGCTTTATGAATTGCAACAACGTGCGACGCATCGTGAATCATTC TTTGTTGGCGTACGCAAACTATCTCGTTCTCATTGGGGAATGATGTTAGCTCACTTAGGCGTAGCAATGACTGTTTGGGG GATCGCGTTTAGCCAAAACTTTAGCGTAGAACGTGATGTGAGAATGAAAGTTGGCGAGAGCGCACAAATTGGTCGTTACG ATTTTAAATTCACTGGTGTGACGGATGAAAATGGTCCAAACTATATTGGTGGAAAAGCTCAAATTGATATTTCTAAAGAT GGGCAACCAGAGGCGAGTTTATTCGCAGAAAAACGTTTTTACACAGTAAGTCGGATGTCTATGACAGAAGCCGCTATTGC TGGTGGTTTAACTCGTGACCTTTATGTGGCACTTGGCGAAAAACTTGAGGATAATTCTTGGGCGTTACGCTTATATTACA AGCCATTTATTCGCTGGATTTGGATTGGCGGCTTATTTATGGCGTTAGGTGGATTGTTGTGCATGTTCGATCGACGCTAT CGGTTTAATGTGTTGTTGAAGAAATAA Protein sequence : MIAELGNYALALSLAVSLMLAIFPLWGAEKGNAQLMALARPMTYGLFASLSVAFAALFYLFAVNDFSVQYIVNNSNTTLP IYYRLSAVWGSHEGSLLLWIWLLAVWSFAVALLSKHLPQEAVARVLGIMGIISVGFVLFVLFTSNPFTRTFPDFPVDGKE LNPMLQDVGLIFHPPLLYMGYVGFSVAFAFAIASLMTGKLDSAWARWSRPWTLAAWVFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENSSFMPWLAGTALIHSLSVTEKRGSFKAWTVLLAILAFSLCLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPTRGLYILAYLV VVIGGSLALYAYKGSQIRSRDNAERYSRESMLLLNNILLMTALCVVFLGTLLPLVHKQLGLGSISIGAPFFDQMFLIIMT PFALLLGIGPLVKWRRDQFSAIRTPVVICVFVMLIAGFALPYFLQDKITVSSVLGSMMTVIIALLALYELQQRATHRESF FVGVRKLSRSHWGMMLAHLGVAMTVWGIAFSQNFSVERDVRMKVGESAQIGRYDFKFTGVTDENGPNYIGGKAQIDISKD GQPEASLFAEKRFYTVSRMSMTEAAIAGGLTRDLYVALGEKLEDNSWALRLYYKPFIRWIWIGGLFMALGGLLCMFDRRY RFNVLLKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 3e-157 | 63 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-136 | 55 |
