Gene Information

Name : lp12_0883 (lp12_0883)
Accession : YP_005185252.1
Strain : Legionella pneumophila ATCC 43290
Genome accession: NC_016811
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 954311 - 956263 bp
Length : 1953 bp
Strand : +
Note : Energy Metabolism

DNA sequence :
ATGATAGCGGAATTAGGGCTGTTTTTTTTGATTTTGGCTTTAGTGGCTTCTTTGATGTTAGCTTTGATTCCATTGGCGGG
TTTGCAATTCAATCGGAAAGACTGGATTGATTCCTCCAGGAATTATGTCGTACTGCAATTTTTATTTGTGGCATGTGCTT
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CCGAGAAAGTGCGTTGTTATTAAACAATGTGTTTTTAGTGGTTATTATGCTGACGGTATTAATGGGCACGGTTTATCCAT
TGCTGGTGGAAGGGTTAGGGTTAGGTAAATTATCCGTTGGAGCGCCCTATTTTAATGCGGTATTTGTTCCATTAATGATT
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GGAGTTGGACAGGCTTATTGGGGGATGGTTTTGGCTCATTGTGGTGTCGCAGCAACAGTGATTGGCATTGCTGTTTCTTC
AGCTTATGGCGTACAAGATGATGTACGTATGTCTCCTGGCAAGCAAGTGAATCTGCTGGATTATCAGATTGGATTCATTA
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ATTTTTCCTGAAAAAAGAGTGTATACCATTGGACAAATGCCAATGACTGAGTCTGCGATTGATGTGACTCCTTTCCGAGA
TATTTACATTGCTTTGGGGGAGCCACTGTCTGAGGATGCCTGGTCGGTACGTATTTATTATAAACCGTTGGTCCGCTGGA
TTTGGGCTGGCGGATTTATGATTTTAGCCGGAGGCGTTTTGGCATTAACAGATAGAAGGTATTACAGAAAAAGGCAAGTA
ACGGTAATGTCAGGGCAGGAGATCAAGATATGA

Protein sequence :
MIAELGLFFLILALVASLMLALIPLAGLQFNRKDWIDSSRNYVVLQFLFVACAYLCLTACFLMDDFSVNYVLNNSSLLLP
WFYKFCAVWGGHEGSMLLWVAILSFWMILVCFFSSSLDTEMRARVLVILGWLSIGFILFLLMTSNPFLRQFQVLNTQGRD
LNPLLQDPGFLFHPPMLYMGYVGFCVAFAFAIAALWAGKVETSWSKWTRPWTLAAWCCLTAGITLGSWWAYRELGWGGWW
FWDPVENASFMPWLVGTALLHSLAVTEQRQQFKAWTMLLAIAAFSLSLIGTFLVRSGVLTSVHAFAVDPQRGLYILGFLL
FVIGGSLTLFLFRAQTLQVNKHPGLLSRESALLLNNVFLVVIMLTVLMGTVYPLLVEGLGLGKLSVGAPYFNAVFVPLMI
PLLLLMGLGVRLKWQNDCWRDVFRKLNRIFLLSLILPVILLFCTSTEIHLTALLGLILAFWVLLSTANAAYHKVRDRGVA
GVGQAYWGMVLAHCGVAATVIGIAVSSAYGVQDDVRMSPGKQVNLLDYQIGFINQTPLSGPNYKGTRAEFSIQYQNKTRQ
IFPEKRVYTIGQMPMTESAIDVTPFRDIYIALGEPLSEDAWSVRIYYKPLVRWIWAGGFMILAGGVLALTDRRYYRKRQV
TVMSGQEIKI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ccmF AAN62106.1 putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF Not tested PAGI-2(C) Protein 8e-122 51
ccmF YP_217241.1 cytochrome c-type biogenesis protein Not tested SPI-12 Protein 3e-113 50