|
Name : RCA_04945 (RCA_04945) Accession : YP_005300020.1 Strain : Rickettsia canadensis CA410 Genome accession: NC_016929 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Heme exporter protein C Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1084744 - 1085433 bp Length : 690 bp Strand : - Note : COG0755 ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis, permease component DNA sequence : ATGTTAATATTAACCCCATATTATTTTAATAAATTATCAAAGGTTATAATACCTATATTAACTATATCTACCTTCGTAAT AATGGTTATAGGTCTTTATTTAGCTCTCATAGTTTCACCGGTAGATTATCAACAAGGTGCGTTTGTACGCATTATGTATG TTCATGTACCTGCTTCTTGGATGGCCCTTGGTATTTATATTTTTATGGCAGCATGCAGCTTTAGTTATTTAGTATGGAAA ACTACTATTAGCTATTTGCTAGCTGTAGCTTCTAGTTACATTGGCGCTAATTTTACTTTGATTAGTTTAGTAACAGGCTC TTTATGGGGAAAGCCTATATGGGGAACATGGTGGGTTTGGGATGCAAGACTTACCTCTATGCTTATATTATTTTTATTAT ATTTAAGCTATATTATAATAGTGAATAGTGCGGATAATATAAGAAAGACACAAAATCCTGCTTCGATTATTGCTCTTATC GGTTTAATTAACATACCGATAGTAAAATTCTCGGTAAATATTTGGTATAGCCTGCATCAGCCAGCTAGTGTTTTAAGGCT TGGTTCTCCTACTATTCATTCTTCAATGTTAAAACCCTTAATTATTATGTTTATAAGTTTTGTGCTATATTTTTTATTAA TACTCACTATGCGTACTTCTGTATTAATTTATAAAATTAAGAATCGATAA Protein sequence : MLILTPYYFNKLSKVIIPILTISTFVIMVIGLYLALIVSPVDYQQGAFVRIMYVHVPASWMALGIYIFMAACSFSYLVWK TTISYLLAVASSYIGANFTLISLVTGSLWGKPIWGTWWVWDARLTSMLILFLLYLSYIIIVNSADNIRKTQNPASIIALI GLINIPIVKFSVNIWYSLHQPASVLRLGSPTIHSSMLKPLIIMFISFVLYFLLILTMRTSVLIYKIKNR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmC | AAN62109.1 | putative heme exporter protein C | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-21 | 42 |
