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Name : lysS (KQS_10870) Accession : YP_005358153.1 Strain : Flavobacterium indicum GPTSA100-9 Genome accession: NC_017025 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lysine--tRNA ligase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 6.1.1.6 Position : 2310850 - 2312541 bp Length : 1692 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGCAATTGTCAGAACAAGAAATCATTAGAAGAGAAAAGCTTACTGCTTTACGCCAATTGGGAATTAATCCCTATCCTGC AAATTTGTATCCAGTTAATCACACTTCTAAACAGGTGAAGGAACAGTTTGAAGAAGGCAAGAAGGTTATTGTAGCTGGAC GTTTAATGAGTGTTCGTGACCAAGGTAAAGCTTCTTTTGCTGAACTTCAAGACAGCGAAGGCAGAATTCAATTGTATTTT AATAGAGATGTCATTTGTGAAGGTGAAGACAAAACACTATACAACCAAGTATTTAAAAAATTAACCGATTTAGGGGATTT TATTGGCGTTGAAGGTGAATTATTTACTACACAAGTAGGAGCGAAATGTATACGTGTTACTCATTTTACATTTTTAAGTA AAACATTACGCCCCCTTCCTTTACCTAAAACCGATGAAGAAGGCAAAGTGTATGATGCATTTAACGACCCTGAATTGAGA TACAGAATGCGTTATGTTGATTTAGTGGTAAATCCACAAGTTAAAGACGTTTTTATTAAAAGAACAAAACTGTTCACTGC TATGAGAACTTTCTTTAACAAGGCTGGCTATATGGAAGTAGAAACTCCGGTTTTACAGTCTATTCCTGGAGGCGCTGCTG CGAGACCATTTATTACGCATCATAACAGTTTAGACATTCCTCTTTACATGCGAATTGCAAACGAATTGTACTTAAAAAGA CTGATTGTTGGTGGTTTTGACGGAGTTTATGAGTTTTCAAAAAATTTCCGAAATGAAGGAATGGACAGAACACACAATCC TGAATTTACAGCAATGGAAATATATGTTGCTTATAAAGATTATAATTGGATGATGGAATTCACAGAAAACTTATTAGAAT TCTGTGCTACTCAGGTTAACGGAACAACTGAAGCGACTTTTGGCGAACATAAAGTAAATTTTAAAGCGCCTTATGCTCGT GTTACTATGACCGATGCCATTAAACAATTTACAGGATTTGATATCACTGGAAAATCGGAAGATGAATTGCGTGAAGCTGC AAAAGCAATGGGAATTGAAGTGAATGACACTATGGGTAAAGGTAAATTGATTGATGAAATTTTTGGCGAAAAATGTGAAG GTAACTTCATTCAGCCTACATTCATTACAGATTATCCTAAAGAAATGTCGCCTTTATGTAAATCTCATCGTGATAATCCT GAATTAACAGAGCGTTTTGAATTAATGGTTTGCGGAAAAGAAATTGCCAATGCTTATTCTGAATTAAACGACCCTATTGA CCAAAGAGAACGTTTTGTTGCACAAATGGAGTTGGCCCAAAAAGGCGATGATGAAGCAAATGGTATCATCGATGAAGATT TCTTAAGAGCTTTAGAATATGGTATGCCTCCAACTTCTGGATTAGGAATTGGAATGGATCGATTAATTATGTTCCTAACC AATAATCCATCTATTCAAGAAGTTTTATTCTTCCCACAAATGCGTCCGGAGAAAAAAGGTCCTGAATTAACAGAAGATGA AAAATTAATTATAGGTCTGCTAAAAACGGAAAACAATCAACCTATTGCCAGCTTAAAAGAAAAAACAGGATTAAGCGGTA AAAAATGGGACGCAGCTATGAAAGGTTTAGCCAAACATGGCTTAACAAAAGTTGTGGTTGATGGAGATTTAAAAACTGTT GTTTTAAGTTAA Protein sequence : MQLSEQEIIRREKLTALRQLGINPYPANLYPVNHTSKQVKEQFEEGKKVIVAGRLMSVRDQGKASFAELQDSEGRIQLYF NRDVICEGEDKTLYNQVFKKLTDLGDFIGVEGELFTTQVGAKCIRVTHFTFLSKTLRPLPLPKTDEEGKVYDAFNDPELR YRMRYVDLVVNPQVKDVFIKRTKLFTAMRTFFNKAGYMEVETPVLQSIPGGAAARPFITHHNSLDIPLYMRIANELYLKR LIVGGFDGVYEFSKNFRNEGMDRTHNPEFTAMEIYVAYKDYNWMMEFTENLLEFCATQVNGTTEATFGEHKVNFKAPYAR VTMTDAIKQFTGFDITGKSEDELREAAKAMGIEVNDTMGKGKLIDEIFGEKCEGNFIQPTFITDYPKEMSPLCKSHRDNP ELTERFELMVCGKEIANAYSELNDPIDQRERFVAQMELAQKGDDEANGIIDEDFLRALEYGMPPTSGLGIGMDRLIMFLT NNPSIQEVLFFPQMRPEKKGPELTEDEKLIIGLLKTENNQPIASLKEKTGLSGKKWDAAMKGLAKHGLTKVVVDGDLKTV VLS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 4e-97 | 45 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysS | YP_005358153.1 | lysine--tRNA ligase | VFG1668 | Protein | 2e-97 | 45 |
