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Name : nrfE (PMCN06_1283) Accession : YP_005363690.1 Strain : Pasteurella multocida HN06 Genome accession: NC_017027 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1381905 - 1383845 bp Length : 1941 bp Strand : - Note : - DNA sequence : TTGTTTATATTCACTATGATCCCAGAACTTGGTTTTTTGGCTTTACTGATCGCTTCTTTGTGTGCGTTCTTGCTTGCGCT AGTGCCACAAGTCGGTATTTTTTTGCGTAAGCCGTATATGATTGGTACTGCGTGGAATTTGAGTTATCTCTTTGGGATAT TTACCTGTATAGCGTTATTCTGCCTTGCCTATGCCTTTGCGCTCGATGATTTTTCTGTGCAATATGTGGCACATCATTCT AATTCACAACTGCCAATTTTCTTTAAAGTGTCTGCTACTTGGGGTGGACATGAAGGGTCGATGCTATTTTGGTTGTTTGC TTTAGCACTCTGGTTGATGCTCTTTGCGTTTTCCAGTCGTCATAAAGATCCGATTATTTGTGCGCGAGCACTTTCAGTGC TTGGGCTCATTTGTTTTGGTTTTTGTCTCTTTATTTTATTTTTATCAAATCCATTTGAACGCAGTTTTCCACAAGCATTT GAAGGGCGTGATTTAAATCCGATGTTGCAAGATGTGGGGCTGATTTTTCACCCGCCTTTATTGTATTTGGGCTATGTGGG CTTTGCCGTCAATTTTGCTATTACTATTTCTGCTTTAGTGAGTGGGCATTTAGATGCCGCCGTGGCTCGCATGATGCGCC CTTGGGTTTTGCTATCTTGGTTATTTTTAACTTTAGGGATTGTGTTAGGGTCTTGGTGGGCGTATTACGAACTAGGCTGG GGCGGCTGGTGGTTTTGGGATCCGGTCGAAAACGCCTCATTGATGCCTTGGTTATTAGGTTTGGCACTATTACATAGTCT ATCTATCACAGAACAGCGTGGCATTTTTAGTTACTGGACGCTGCTATTTTCACTTTTGGCATTTTCTTTCAGTTTACTGG GTACCTTCATCGTACGCTCGGGCGTCTTAACTTCTGTGCACGCGTTTGCAGTAGATGGTGATCGGGGAATTGCCTTACTG ATTTTATTCTTTTTATTGACTGTGAGTGCATTCACTTTATTTGCATTAAAGGTTAACTTGCCACAAAGTGCGGTACGTTT CCGTTTAATTTCGAAGGAAAATGCTCTGTTGCTTCTCAATATTTTATTGACGATTGCCACGGTCAGTGTCTTTTTAGGCA CTTTTTATCCGATTGTCTTTACCGGATTACAATGGGGATCTATTTCAGTCGGCGCGCCGTATTTTAATACAATTTTTCTG CCACTGTTTGTGATGGCAATGCTTGCTATGATTTTGGTGTTGTCTTTACGTTGGAAAACACTGAATAAAAAACCGTTTAT TCAACGTACGTTATTGTTATTTCCCGCGCTTATATTGGCTTATGGATTAATCCGTTATTATGTAGATCATAACCAAGGGT TGCCTTTCAATTTCAGCGCTTATGGCTTGTTAAGCCTGTCGATTTGGTTAATTCTGGCGACGTTATGGCTCCCATGGACG CAGCTGAAACTGAAACAGCTCGCCATGGTGATCGCGCATTTAGGTGTAGCGATAACGGCAATTGGGGCGATCATGAGTAG CTATTACAGCAGTGAGATTGGCGTGCGCTTGGCACCGCAACAACGCCAAAAACTCGGTGATTACGAGTTTCACTATCAGG GTTTTCAGCATGTGTTAGGTCCGAATTACACCAGTGAAAAAGCCCATTTTGTGGTGACAAAGCAAAACCAAGCTTATGCT GAGATTTACCCAGAACGCCGTTATTATGATGTGCGTACTATGAACATGAGCGAAGTTGGGATTGATTGGGGGTGGCTTGG TGATGTCTATATTGTAATGGGCGATAAATTGGGACAAGGCGAATTTACTTTCCGCTTGCAATATAAACCTTTTATCCGTT GGTTATGGTTTGGCGGGCTTTTAATGGCACTGGGCGCCTTGCTTGCCATATTTTCCTTGTGCAATAGCAATGAACCAAAA CCACGTCGTCAGTCAGATTGA Protein sequence : MFIFTMIPELGFLALLIASLCAFLLALVPQVGIFLRKPYMIGTAWNLSYLFGIFTCIALFCLAYAFALDDFSVQYVAHHS NSQLPIFFKVSATWGGHEGSMLFWLFALALWLMLFAFSSRHKDPIICARALSVLGLICFGFCLFILFLSNPFERSFPQAF EGRDLNPMLQDVGLIFHPPLLYLGYVGFAVNFAITISALVSGHLDAAVARMMRPWVLLSWLFLTLGIVLGSWWAYYELGW GGWWFWDPVENASLMPWLLGLALLHSLSITEQRGIFSYWTLLFSLLAFSFSLLGTFIVRSGVLTSVHAFAVDGDRGIALL ILFFLLTVSAFTLFALKVNLPQSAVRFRLISKENALLLLNILLTIATVSVFLGTFYPIVFTGLQWGSISVGAPYFNTIFL PLFVMAMLAMILVLSLRWKTLNKKPFIQRTLLLFPALILAYGLIRYYVDHNQGLPFNFSAYGLLSLSIWLILATLWLPWT QLKLKQLAMVIAHLGVAITAIGAIMSSYYSSEIGVRLAPQQRQKLGDYEFHYQGFQHVLGPNYTSEKAHFVVTKQNQAYA EIYPERRYYDVRTMNMSEVGIDWGWLGDVYIVMGDKLGQGEFTFRLQYKPFIRWLWFGGLLMALGALLAIFSLCNSNEPK PRRQSD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-83 | 47 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-83 | 42 |
