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Name : HPF57_0233 (HPF57_0233) Accession : YP_005776947.1 Strain : Helicobacter pylori F57 Genome accession: NC_017367 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium-dependent transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 236449 - 238107 bp Length : 1659 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAAAATTATTCGCATGCCAATACGCATACAGATACGCGCGCCGATGATAAAAGCACTAAAATCGTGCGCTTGTTGGG GTTAATAGGGGGAGCGCTAATCGCGCTCATTATCTATTACGCTTTAAACGCTCAACTGCCTCATATTGTAGAAGAAATCC CCAAGCTTAATTCCTTAAATTATAAGGCGATGCCTGTTGTGGCTGGGGTGGCTGTTTTAATGGGGATATGGTGGATGACT GAAGCCATTGACCTGCCCGCAACCGCGCTTTTACCTTTAGTGCTTTTTAGCGTCTTTAGCGTGGATCAATTCTCTAGCGT TAGCTCTTCTTACGCATCGCCGATTATCTTTCTTTTCATGGGAGGGTTTATTTTAGCTTTAAGCATGCAAAAATGGAACT TGCACACACGCATCGCTCTAAGCATTATTTTATTAGTAGGCACAAGCCCTAGGAGATTGATTCTAGGTTTCATGATAGCT ACAGGCTTTCTGTCTATGTGGGTGAGCAATACAGCAACGGCGGTGATGATGCTCCCTATTGGCATGAGCGTTTTGCAATT AGTCGCTAAACTTGTGGGCAAAGAAAACGCCTCTAATTCATGGCATCAAAAAGAAGAAATCACCAAAGCGCATGGGGGTA TTATGGGCAATATCGTGCATAAGGGAAAAGATATTTCTCAAGTCATTCAAGAAAAGACCATCATTTATCGCACGAATTTC AGTATTTGCTTGATGCTTGGCATCGCTTATGCGGCTTCTATTGGCTCTTTAGGCACTCTTATTGGCACGCCGCCTAACGC TTTATTGGCCGGCTATATGAAAACCGCTTTCAATATTGGAATTGATTTCGCCCGGTGGATGGTGTTTGGGACGCCGTTAG CCTTCATCATGCTCATTTTATCGTGGCTCTTGCTCACTTATGTGATTTTCCCTTTAAAGATTAAAGAAATCCCAGGTGGT AAGGAAGTCATTAGGGCAGAGTTAAAAAAATTAGGCCGTTTGAGTTGGGCGGAAATCTCTGTGGGCGTTATTTTTATTTT AGCGTCTTTAGGGTGGATTTTTTTAGATACGATCTTAAAATCTTGGGGCATTAAAATAGATAAAATTGATTCAGTGATCG CTATGGGGGTTTCTGCGCTTTTATTCATTTTGCCCGCTAATAATCAGGGCGATAGGCTCATTGATTGGAGTGTTGCTAAA AAACTCCCTTGGGATGTGTTGCTTTTATTTGGTGGCGGGTTAGCCTTGAGCGTGCAATTTTCTAAAACCGGGTTGAGTTT GTGGATCGGGCATTTAGTTTCTGGCTTTTCGCATTTACCGATTTTATTCATTATTTTCATGGTAACTTTAATGGTCATCT TCTTAACCGAAATCACTTCTAACACCGCCACCGCTGCGGCGTTTTTACCGGTGATTGGAGGGGTTGCGATGGGCATGGGT TATGAAAATCATCAGAGCTTGTTATTGACCATTCCTGTAGCCTTGAGCGCGACTTGCGCGTTCATGCTCCCTGTAGCCAC CCCACCCAATGCGATAGCTTATGGCTCTGGGTATGTTAAAATAACGGATATGATTAAAGCCGGTTTGTGGCTTAATCTGG TAGGAGTTGTTTTGATTAGCGCGTTTAGCTATTTTTTAGTTTCGCTGGTATTTAATTGA Protein sequence : MENYSHANTHTDTRADDKSTKIVRLLGLIGGALIALIIYYALNAQLPHIVEEIPKLNSLNYKAMPVVAGVAVLMGIWWMT EAIDLPATALLPLVLFSVFSVDQFSSVSSSYASPIIFLFMGGFILALSMQKWNLHTRIALSIILLVGTSPRRLILGFMIA TGFLSMWVSNTATAVMMLPIGMSVLQLVAKLVGKENASNSWHQKEEITKAHGGIMGNIVHKGKDISQVIQEKTIIYRTNF SICLMLGIAYAASIGSLGTLIGTPPNALLAGYMKTAFNIGIDFARWMVFGTPLAFIMLILSWLLLTYVIFPLKIKEIPGG KEVIRAELKKLGRLSWAEISVGVIFILASLGWIFLDTILKSWGIKIDKIDSVIAMGVSALLFILPANNQGDRLIDWSVAK KLPWDVLLLFGGGLALSVQFSKTGLSLWIGHLVSGFSHLPILFIIFMVTLMVIFLTEITSNTATAAAFLPVIGGVAMGMG YENHQSLLLTIPVALSATCAFMLPVATPPNAIAYGSGYVKITDMIKAGLWLNLVGVVLISAFSYFLVSLVFN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| DIP0179 | NP_938571.1 | hypothetical protein | Not tested | Not named | Protein | 6e-101 | 53 |
