|
Name : hunaDC (HMPREF0462_0269) Accession : YP_005784836.1 Strain : Helicobacter pylori 83 Genome accession: NC_017375 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium-dependent transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 256839 - 258497 bp Length : 1659 bp Strand : + Note : COG: COG0471; Pfam: PF00939; InterPro: IPR001898 DNA sequence : ATGGAAAATCATTCGCATGCCAATACGCATACAGATACGCGCACCGATGATAAAAGCACTAAAATCGTGCGCTTGTTGGG GTTAATAGGAGGGGTGTTAATCGCGCTCATTATCTATTACGCTTTAAACGCTCAACTGCCTCATATTGTAGAAGAAATCC CCAAGCTTAATTCCTTAAATTATAAAGCGATGCCTGTTGTGGCTGGGGTGGCTGTTTTAATGGGGATATGGTGGATGACT GAAGCCATTGACCTGCCCGCAACCGCGCTTTTACCTTTAGTGCTTTTTAGCGTCTTTAGCGTGGATCAATTCGCTAGCGT CAGCTCTTCTTACGCATCGCCGATTATCTTTCTTTTCATGGGAGGGTTTATTTTAGCTTTAAGCATGCAAAAATGGAACT TGCACACGCGCATCGCTTTAAGCATTATTTTATTAGTAGGCACAAGCCCTAGGAGGTTGATTCTAGGTTTCATGATAGCT ACAGGCTTTCTGTCTATGTGGGTGAGTAATACCGCAACGGCGGTGATGATGCTCCCTATTGGCATGAGCGTTTTGCAATT AGTCGCTAAACTTGTGGGCAAAGAAAACGCCTCTAATTCATGGCATCAAAAAGAAGAAATCACCAAAGTGCATGGGGGTA TTATGGGCAATATCGTGCATAAGGGCAAAGATATTACCCAAGTCATTCAAGAAAAGACCACCATTTATCGCACGAATTTC AGTATTTGCTTGATGCTTGGCATCGCTTATGCGGCTTCTATTGGATCTTTAGGCACTCTTATTGGCACGCCGCCTAACGC TTTATTAGCCGGCTATATGAAAACCGCTTTCAATATTGAAATTGATTTCGCCCGGTGGATGGTGTTTGGGACGCCGTTAG CCTTCATCATGCTCATTTTATCGTGGCTCTTGCTCACTTATGTGATTTTCCCTTTAAAGATTAAAGAAATCCCAGGTGGT AAGGAAGTCATTAGGGCAGAGTTAAAAAAATTAGGCCGTTTGAGTTGGGCGGAAATCTCTGTGGGCGTTATTTTTATTTT AGCGTCTTTAGGGTGGATTTTTTTAGATACGATCTTAAAAACTTGGGGCATTAAGATAGATAAAATTGATTCAGTGATCG CTATGGGGGTTTCTGCGCTTTTATTCATTTTGCCCGCTAATAATCAGGGTGATAGGCTCATTGATTGGGGTGTTGCTAAA AAACTCCCTTGGGATGTGTTGCTTTTATTTGGCGGCGGGTTAGCCTTGAGCGCGCAATTTTCTAAAACCGGGTTGAGTTT GTGGATCGGGCATTTAGTTTCTGGCTTTTCGCATTTACCGATTTTATTCATTATTTTCATGGTAACTTTAATGGTCATTT TCTTAACCGAAATCACTTCTAACACCGCCACCGCTGCCGCGTTTTTACCGGTGATTGGAGGGGTTGCGATGGGCATGGGT TATGAAAATCATCAGAGCTTGTTATTGACCATTCCTGTAGCCTTGAGCGCGACTTGCGCGTTCATGCTCCCTGTAGCCAC CCCACCCAATGCGATAGCTTATGGCTCTGGGTATGTTAAAATAATGGACATGATTAAAGCCGGTTTGTGGCTTAATCTGG TAGGAGTTGTTTTGATTAGCGCGTTTAGCTATTTTTTAGTTTCGCTGGTATTTAATTGA Protein sequence : MENHSHANTHTDTRTDDKSTKIVRLLGLIGGVLIALIIYYALNAQLPHIVEEIPKLNSLNYKAMPVVAGVAVLMGIWWMT EAIDLPATALLPLVLFSVFSVDQFASVSSSYASPIIFLFMGGFILALSMQKWNLHTRIALSIILLVGTSPRRLILGFMIA TGFLSMWVSNTATAVMMLPIGMSVLQLVAKLVGKENASNSWHQKEEITKVHGGIMGNIVHKGKDITQVIQEKTTIYRTNF SICLMLGIAYAASIGSLGTLIGTPPNALLAGYMKTAFNIEIDFARWMVFGTPLAFIMLILSWLLLTYVIFPLKIKEIPGG KEVIRAELKKLGRLSWAEISVGVIFILASLGWIFLDTILKTWGIKIDKIDSVIAMGVSALLFILPANNQGDRLIDWGVAK KLPWDVLLLFGGGLALSAQFSKTGLSLWIGHLVSGFSHLPILFIIFMVTLMVIFLTEITSNTATAAAFLPVIGGVAMGMG YENHQSLLLTIPVALSATCAFMLPVATPPNAIAYGSGYVKIMDMIKAGLWLNLVGVVLISAFSYFLVSLVFN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| DIP0179 | NP_938571.1 | hypothetical protein | Not tested | Not named | Protein | 5e-104 | 52 |
