Name : ccmF (R2866_1306) Accession : YP_005827973.1 Strain : Haemophilus influenzae R2866 Genome accession: NC_017451 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c maturation heme lyase subunit CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1332896 - 1334842 bp Length : 1947 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTGCTGAATTAGGAAATTATGCGCTGGCTTTAAGTTTAGCTGTATCGCTTATGTTGGCGATTTTCCCTTTGTGGGG GGCGGAAAAGGGCAATGCACAATTAATGGCATTAGCTCGCCCAATGACTTATGGTTTATTTGCAAGTCTAAGCATTGCTT TTGCTGCGCTATTTTATTTATTCGCAGTCAATGATTTTAGCGTGCAATATATTGTAAATAATTCTAATACTACTTTACCC ATTTATTATCGTTTATCTGCGGTATGGGGTTCCCATGAAGGCTCTTTGTTACTGTGGATTTGGTTACTGGCGGTTTGGTC ATTTGCCGTTGCTTTATTGAGTAAACATTTACCCCAAGAAGCGGTTGCTCGCGTGCTTGGTATTATGGGGATTATTAGCG TCGGTTTTGTATTGTTCGTCTTGTTTACCTCAAATCCTTTCACGCGTACTTTCCCTGATTTCCCAGTGGATGGAAAAGAA CTTAACCCAATGTTGCAAGATGTGGGCTTAATTTTCCACCCTCCATTACTTTATATGGGCTATGTGGGTTTTTCTGTGGC ATTTGCGTTTGCGATAGCATCCTTAATGACTGGAAAATTAGATTCAGCTTGGGCACGTTGGTCACGTCCTTGGACGCTTG CTGCTTGGGTGTTTTTAACTTTAGGTATCGTACTCGGTTCTTGGTGGGCTTATTATGAGCTTGGCTGGGGGGGCTGGTGG TTCTGGGATCCAGTAGAAAACTCATCGTTTATGCCGTGGCTTGCTGGTACTGCATTGATTCACTCTCTTTCTGTGACAGA AAAACGTGGTTCTTTTAAAGCTTGGACGGTATTACTTGCGATTTTAGCCTTTTCACTTTGTTTACTCGGCACGTTCTTAG TTCGTTCTGGTATCTTAGTTTCAGTTCACGCATTTGCATCGGATCCAACTCGTGGTTTGTATATTTTGGCTTACCTCGTT GTGGTAATTGGCGGTTCGCTTGCGCTCTATGCGTATAAAGGCAGTCAAATTCGTTCTCGTGATAATGCAGAACGCTATTC ACGTGAAAGTATGTTGTTATTAAATAATATCTTATTAATGACCGCACTTTGCGTTGTATTCTTAGGAACGTTGTTACCAC TCGTTCACAAACAACTTGGTTTAGGCTCTATTTCTATTGGTGCGCCGTTCTTTGATCAAATGTTCTTAATTATTATGACA CCATTTGCATTATTGCTTGGTATTGGACCTTTAGTGAAATGGCGTAGAGACCAATTTTCTGCAATTCGTACGCCTGTTGT TATCTGCGTATTTGTTATGCTGATTGCAGGTTTTGCGTTACCTTATTTCTTGCAAGATAAAATTACCGTGAGTTCAGTGC TTGGTTCAATGATGACTGTGATTATTGTGTTACTTGTGCTTTATGAATTGCAACAACGTGCGACGCATCGTGAATCATTC TTTGTTGGCGTACGCAAACTATCTCGTTCTCATTGGGGAATGATGTTAGCTCACTTAGGCGTAGCTATGACTGTTTGGGG GATCGCATTTAGCCAAAACTTTAGCGTAGAACGTGATGTGAGAATGAAAGTTGGCGAGAACGCACAAATTGGTCGTTACG ATTTTAAATTCGCTGGTGTGACGGATGAAAATGGTCCAAACTATATTGGTGGAAAAGCTCAAATTGATATTTCGAAAGAT GGGCAACCAGAGGCAAGTTTATTCGCAGAAAAACGTTTTTACACAGTAAGTCGGATGTCTATGACAGAAGCCGCAATTGC TGGTGGTTTAACTCGTGACCTCTATGTGGCTCTCGGTGAAAAACTTGAGGACAATTCTTGGGCGTTACGCTTATATTACA AGCCATTTATTCGCTGGATTTGGATTGGTGGCTTATTTATGGCGTTAGGTGGATTGTTGTGCATGTTCGATCGACGCTAT CGGTTTAATGTGTTGTTGAAGAAATAA Protein sequence : MIAELGNYALALSLAVSLMLAIFPLWGAEKGNAQLMALARPMTYGLFASLSIAFAALFYLFAVNDFSVQYIVNNSNTTLP IYYRLSAVWGSHEGSLLLWIWLLAVWSFAVALLSKHLPQEAVARVLGIMGIISVGFVLFVLFTSNPFTRTFPDFPVDGKE LNPMLQDVGLIFHPPLLYMGYVGFSVAFAFAIASLMTGKLDSAWARWSRPWTLAAWVFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENSSFMPWLAGTALIHSLSVTEKRGSFKAWTVLLAILAFSLCLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPTRGLYILAYLV VVIGGSLALYAYKGSQIRSRDNAERYSRESMLLLNNILLMTALCVVFLGTLLPLVHKQLGLGSISIGAPFFDQMFLIIMT PFALLLGIGPLVKWRRDQFSAIRTPVVICVFVMLIAGFALPYFLQDKITVSSVLGSMMTVIIVLLVLYELQQRATHRESF FVGVRKLSRSHWGMMLAHLGVAMTVWGIAFSQNFSVERDVRMKVGENAQIGRYDFKFAGVTDENGPNYIGGKAQIDISKD GQPEASLFAEKRFYTVSRMSMTEAAIAGGLTRDLYVALGEKLEDNSWALRLYYKPFIRWIWIGGLFMALGGLLCMFDRRY RFNVLLKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 3e-157 | 63 |
ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 3e-136 | 55 |