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Name : secD (R2866_0344) Accession : YP_005827058.1 Strain : Haemophilus influenzae R2866 Genome accession: NC_017451 Putative virulence/resistance : Unknown Product : General secretory pathway component SecD Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 334884 - 336734 bp Length : 1851 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAAACCGTTATCCATTATGGAAGAATTTGATGGTTATTTTTATTGTGGCCATCGGGATTTTATATTCTCTTCCAAA TATTTATGGTGAAGATCCTGCGGTGCAAATTTCCGGTACACGCGGTCAAGAAGCGAATACTAGCGTGCTTGGACAAGTTC AAGATGTGCTTAAAACTAATAATCTTCCAACCAAATCTATCGTGCTTGAGAATGGCTCAATTCTAGCTCGCTTTACTAAT ACCGATGATCAACTTCTTGCTAAAGATAAAATTGCTGAACGTCTTGGCAATAATTACACCACCGCATTAAATCTTGCTCC AGCCACTCCAGCTTGGTTAAGTATGTTTGGTGCGAATCCTATGAAATGGGGATTAGACTTACGCGGTGGGGTTCGTTTTT TGATGGAAGTCGATATGAATGCCGCACTTGTAAAACGCCAAGAGCAATTACAAGATAGTTTGCGTGGCGAACTTCGTAAA GAAAAAATTCAATATACTGCCATTAAAAATACTGAGCATTTTGGTACGTTGATAACCTTAGCTAATGTGAGCCAGCGTGC TAAAGCTGAGCGAATTATTCGCCAATTACATCCAACATTAGACATTACTGAGCCTGATGCTGATAGTATTAATTTAGGGC TATCTACTGCAGCATTAAATGAAGCACGCGACTTAGCCATTGAGCAAAACTTAACGATTTTACGTAAACGTGTTGCTGAA TTAGGTGTTGCAGAAGCGGTAATTCAACGTCAAGGTGCGGAGCGTATTGTGATTGAATTACCAGGTGTTCAAGACACTGC ACGTGCAAAAGAAATTTTAGGGGCAACGGCAACACTTGAGTTTCGTATCGTAAATCAAAATGTTACAGCCGATGCTATTT CTCGTAATATGTTACCAGCTGATTCGGAAGTTAAATATGATCGCCAAGGTCATCCTGTTGCATTATTTAAACGTACCGTA TTAGGTGGGGAGCATATTATTAATTCAAGCTCTGGTTTAGATCAGCATTCAAGCACGCCGCAAGTAAGTGTAACCTTGGA TAGCGAAGGTGGCGAGATTATGTCTCAGACCACTAAAAAATATTACAAAAAACCAATGGCAACGCTTTATGTTGAATATA AAGATAACGGTAAAAAAGATGAAAATGGTAAAACCATTTTAGAAAAGCATGAAGAAGTGATTAATGTTGCAACAATTCAA GGTCGTTTTGGTTCTAATTTCCAAATTACTGGTGTTGATAGTATTGCTGAAGCACATAATCTTTCTACCTTATTGAAATC TGGTGCATTAATTGCGCCAATTCAAATTGTTGAAGAACGTACAATTGGCCCATCATTAGGTGCGCAAAACGTAGAGCAAG GGATTAATGCGAGCCTTTGGGGATTAGTTGCGGTTATTGCCTTTATGTTGTTTTACTACAAAATGTTTGGTGTGATTGCA AGTTTTGCACTTGTTATTAATATCGTATTACTTGTGGGCTTGATGTCTATTTTACCAGGCGCGACGCTTTCAATGCCAGG TATTGCGGGTATCGTTTTAACTTTAGGTATGTCAGTAGATGCGAACGTATTGATTTTTGAACGTATTAAAGAAGAAATTC GTAACGGTCGTTCAATTCAGCAAGCGATTAATGAAGGTTATAACGGTGCATTTACTTCTATTTTTGACGCAAACTTAACC ACAATCTTAACCGCAATTATTCTATACGCGGTAGGAACAGGCCCAATTCAAGGTTTTGCGATTACGCTTTCACTTGGTGT TGCGATTTCTATGTTTACCGCGATTACAGGTACTCGCGCATTAGTTAATGCCCTTTACGGCGGTAAACAACTTAAAAAAT TATTAATTTAG Protein sequence : MLNRYPLWKNLMVIFIVAIGILYSLPNIYGEDPAVQISGTRGQEANTSVLGQVQDVLKTNNLPTKSIVLENGSILARFTN TDDQLLAKDKIAERLGNNYTTALNLAPATPAWLSMFGANPMKWGLDLRGGVRFLMEVDMNAALVKRQEQLQDSLRGELRK EKIQYTAIKNTEHFGTLITLANVSQRAKAERIIRQLHPTLDITEPDADSINLGLSTAALNEARDLAIEQNLTILRKRVAE LGVAEAVIQRQGAERIVIELPGVQDTARAKEILGATATLEFRIVNQNVTADAISRNMLPADSEVKYDRQGHPVALFKRTV LGGEHIINSSSGLDQHSSTPQVSVTLDSEGGEIMSQTTKKYYKKPMATLYVEYKDNGKKDENGKTILEKHEEVINVATIQ GRFGSNFQITGVDSIAEAHNLSTLLKSGALIAPIQIVEERTIGPSLGAQNVEQGINASLWGLVAVIAFMLFYYKMFGVIA SFALVINIVLLVGLMSILPGATLSMPGIAGIVLTLGMSVDANVLIFERIKEEIRNGRSIQQAINEGYNGAFTSIFDANLT TILTAIILYAVGTGPIQGFAITLSLGVAISMFTAITGTRALVNALYGGKQLKKLLI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 1e-116 | 45 |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 5e-117 | 45 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-117 | 45 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-117 | 45 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-117 | 45 |
