Name : ccmF (R2846_1244) Accession : YP_005829691.1 Strain : Haemophilus influenzae R2846 Genome accession: NC_017452 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c maturation heme lyase subunit CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1306537 - 1308483 bp Length : 1947 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTGCTGAATTAGGAAATTATGCGCTGGCTTTAAGTTTAGCTGTATCGCTTATGTTGGCGATTTTCCCTTTGTGGGG GGCGGAAAAGGGCAATGTACAATTAATGGCATTAGCTCGCCCAATGACTTATGGTTTATTTGCAAGCCTAAGCATTGCTT TTGCTGCGCTATTTTATTTATTCGCAGTCAATGATTTTAGCGTGCAATATATTGTAAATAATTCTAATACTACTTTACCC ATTTATTATCGTTTATCTGCGGTATGGGGTTCCCATGAAGGCTCTTTGTTACTGTGGATTTGGTTACTGGCGGTTTGGTC ATTTGCCGTTGCTTTATTGAGTAAACATTTACCCCAAGAAGCGGTTGCTCGCGTGCTTGGTATTATGGGGATTATTAGCG TCGGTTTTGTATTGTTCGTCTTGTTTACCTCAAATCCTTTCACGCGTACTTTCCCTGATTTCCCAGTAGATGGAAAAGAA CTTAATCCAATGTTGCAAGATGTAGGCTTGATTTTCCACCCTCCATTACTTTATATGGGCTATGTGGGTTTTTCGGTGGC ATTTGCGTTTGCGATAGCATCCTTAATGACTGGAAAATTAGATTCAGCTTGGGCGCGTTGGTCACGTCCTTGGACGCTTG CTGCTTGGGTGTTTTTAACTTTAGGTATCGTACTCGGTTCTTGGTGGGCTTATTATGAGCTTGGCTGGGGGGGCTGGTGG TTCTGGGATCCAGTAGAAAACTCATCGTTTATGCCGTGGCTTGCTGGTACTGCATTGATTCACTCTCTTTCTGTGACAGA AAAACGAGGTTCTTTCAAAGCTTGGACGGTATTACTTGCGATTTTAGCCTTTTCACTTTGTCTGCTCGGCACCTTCTTAG TTCGTTCTGGTATCTTAGTTTCAGTTCACGCATTTGCATCGGATCCAACTCGTGGTTTGTATATTTTGGCTTACCTCGTT GTGGTAATTGGCGGTTCGCTTGCACTCTATGCGTATAAAGGCAGTCAAATTCGTTCTCGTGATAATGCAGAACGCTATTC ACGTGAAAGTATGTTGTTATTGAATAATATCTTATTAATGACCGCACTTTGCGTTGTATTCTTAGGAACGTTGTTACCAC TCGTTCACAAACAACTTGGTTTAGGCTCTATTTCTATTGGTGCGCCGTTCTTTGATCAAATGTTCTTAATTATTATGACA CCATTTGCATTATTGCTTGGTATTGGACCTTTAGTGAAATGGCGTAGAGACCAATTTTCTGCAATTCGTACGCCTGTTGT TATCAGCGTATTTGTTATGCTGATTGCAGGTTTTGCGTTACCTTATTTCTTGCAAGATAAAATTACCGTGAGTTCAGTGC TTGGTTCAATGATGACTGTGATTATTGTGTTACTTGTGCTTTATGAATTGCAACAACGTGCGACGCATCGTGAATCATTC TTTGTTGGCGTACGCAAACTATCTCGTTCTCATTGGGGAATGATGTTAGCTCACTTAGGCGTAGCTATGACTGTTTGGGG GATCGCATTTAGCCAAAACTTTAGCGTAGAACGTGATGTGAGAATGAAAGTTGGCGAGAACGCACAAATTGGTCGTTACG ATTTTAAATTCGCTGGTGTGACGGATGAAAATGGTCCAAACTATATTGGTGGAAAAGCTCAAATTGATATTTCGAAAGAT GGGCAACCAGAGACAAGTTTATTCGCAGAAAAACGTTTTTACACAGTAAGTCGGATGTCTATGACAGAAGCCGCAATTGC TGGTGGTTTAACTCGTGACCTTTATGTGGCACTTGGCGAAAAACTTGAGGACAATTCTTGGGCGTTACGCTTATATTACA AGCCATTTATTCGCTGGATTTGGATTGGCGGCTTATTTATGGCGTTAGGTGGATTGTTGTGCATGTTCGATCGACGCTAT CGGTTTAATGTGTTGTTGAAGAAATAG Protein sequence : MIAELGNYALALSLAVSLMLAIFPLWGAEKGNVQLMALARPMTYGLFASLSIAFAALFYLFAVNDFSVQYIVNNSNTTLP IYYRLSAVWGSHEGSLLLWIWLLAVWSFAVALLSKHLPQEAVARVLGIMGIISVGFVLFVLFTSNPFTRTFPDFPVDGKE LNPMLQDVGLIFHPPLLYMGYVGFSVAFAFAIASLMTGKLDSAWARWSRPWTLAAWVFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWW FWDPVENSSFMPWLAGTALIHSLSVTEKRGSFKAWTVLLAILAFSLCLLGTFLVRSGILVSVHAFASDPTRGLYILAYLV VVIGGSLALYAYKGSQIRSRDNAERYSRESMLLLNNILLMTALCVVFLGTLLPLVHKQLGLGSISIGAPFFDQMFLIIMT PFALLLGIGPLVKWRRDQFSAIRTPVVISVFVMLIAGFALPYFLQDKITVSSVLGSMMTVIIVLLVLYELQQRATHRESF FVGVRKLSRSHWGMMLAHLGVAMTVWGIAFSQNFSVERDVRMKVGENAQIGRYDFKFAGVTDENGPNYIGGKAQIDISKD GQPETSLFAEKRFYTVSRMSMTEAAIAGGLTRDLYVALGEKLEDNSWALRLYYKPFIRWIWIGGLFMALGGLLCMFDRRY RFNVLLKK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-157 | 62 |
ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 2e-136 | 53 |