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Name : secD (R2846_0362) Accession : YP_005828871.1 Strain : Haemophilus influenzae R2846 Genome accession: NC_017452 Putative virulence/resistance : Unknown Product : General secretory pathway component SecD Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 349846 - 351696 bp Length : 1851 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAAACCGTTATCCATTATGGAAGAATTTGATGGTTATTTTTATTGTGGCCATCGGGATTTTATATTCTCTTCCAAA TATTTATGGTGAAGATCCTGCGGTGCAAATTTCCGGTACGCGCGGTCAAGAAGCAAATACTAGCGTGCTTGGACAAGTTC AAGATGTGCTTAAAACCAATAATCTTCCAACCAAATCTATCGTGCTTGAGAATGGCTCAATTCTAGCTCGTTTTACTAAT ACCGATGATCAACTTCTTGCTAAAGATAAAATTGCTGAACGTCTTGGCAATAATTACACCACCGCATTAAATCTTGCTCC AGCCACTCCAGCTTGGTTAAGTATGTTTGGTGCGAATCCTATGAAATGGGGATTAGACTTACGCGGTGGGGTTCGTTTTT TGATGGAAGTCGATATGAATGCCGCACTTGTAAAACGCCAAGAGCAATTACAAGACAGTTTGCGTGGCGAACTTCGCAAA GAAAAAATTCAATATACGGCAATTAAAAATACTGAGCATTTTGGTACGTTGATAACCTTAGCTAATGTGAGCCAGCGTGC TAAAGCTGAGCGAATTATTCGACAATTACATCCAACATTAGACATTACTGAGCCTGATGCTGATAGTATTAATTTAGGGC TATCTACTGCAGCATTAAATGAAGCACGCGACTTAGCCATTGAGCAAAACTTAACGATTTTACGTAAACGTGTTGCTGAA TTAGGTGTTGCAGAAGCGGTAATTCAACGTCAAGGTGCTGAACGTATTGTGATTGAATTACCAGGTGTTCAAGACACTGC ACGCGCAAAAGAAATTTTAGGGGCAACGGCAACACTTGAGTTTCGTATCGTAAATCAAAATGTTACAGCTGATGCTATTT CTCGTAATATGTTACCAGCTGATTCGGAAGTTAAATATGATCGCCAAGGGCATCCTGTTGCGCTATTTAAACGTGCCGTA TTAGGTGGGGAGCATATTATTAATTCAAGCTCTGGTTTAGATCAGCATTCAAGCACGCCGCAAGTGAGTGTAACCTTGGA TAGCGAAGGTGGCGAGATTATGTCTCAGACCACTAAAAAATATTACAAAAAACCAATGGCAACGCTTTATGTTGAATATA AAGATAATGGCAAAAAAGATGAAAATGGCAAAACCATTTTAGAAAAGCATGAAGAAGTTATTAATGTTGCAACAATTCAA GGTCGTTTTGGTTCTAATTTCCAAATTACTGGTGTTGATAGTATTGCCGAAGCACATAATCTTTCTACCTTGTTGAAATC TGGCGCATTAATTGCACCAATTCAAATTGTTGAAGAACGCACAATTGGCCCATCATTAGGTGCACAAAACGTAGAGCAAG GGATTAATGCGAGTCTTTGGGGATTAGTTGCTGTTATTGCCTTTATGTTGTTTTACTACAAAATGTTTGGTGTGATTGCA AGTTTTGCACTTGTTATTAATATCGTATTACTTGTGGGATTAATGTCTATTTTACCCGGCGCGACACTTTCAATGCCGGG TATTGCGGGTATCGTTTTAACTTTAGGTATGTCAGTAGATGCGAATGTATTGATTTTTGAACGTATTAAAGAAGAAATTC GTAATGGTCGTTCAATTCAGCAAGCCATTAATGAAGGTTATAACGGTGCATTTACTTCTATTTTTGATGCTAACTTAACC ACAATCTTAACCGCAATTATTCTATACGCGGTAGGAACAGGCCCAATTCAAGGTTTTGCGATTACGCTTTCACTTGGTGT TGCGATTTCTATGTTTACCGCGATTACTGGAACTCGCGCATTAGTTAATGCCCTTTACGGCGGCAAACAACTTAAAAAAT TATTAATTTAG Protein sequence : MLNRYPLWKNLMVIFIVAIGILYSLPNIYGEDPAVQISGTRGQEANTSVLGQVQDVLKTNNLPTKSIVLENGSILARFTN TDDQLLAKDKIAERLGNNYTTALNLAPATPAWLSMFGANPMKWGLDLRGGVRFLMEVDMNAALVKRQEQLQDSLRGELRK EKIQYTAIKNTEHFGTLITLANVSQRAKAERIIRQLHPTLDITEPDADSINLGLSTAALNEARDLAIEQNLTILRKRVAE LGVAEAVIQRQGAERIVIELPGVQDTARAKEILGATATLEFRIVNQNVTADAISRNMLPADSEVKYDRQGHPVALFKRAV LGGEHIINSSSGLDQHSSTPQVSVTLDSEGGEIMSQTTKKYYKKPMATLYVEYKDNGKKDENGKTILEKHEEVINVATIQ GRFGSNFQITGVDSIAEAHNLSTLLKSGALIAPIQIVEERTIGPSLGAQNVEQGINASLWGLVAVIAFMLFYYKMFGVIA SFALVINIVLLVGLMSILPGATLSMPGIAGIVLTLGMSVDANVLIFERIKEEIRNGRSIQQAINEGYNGAFTSIFDANLT TILTAIILYAVGTGPIQGFAITLSLGVAISMFTAITGTRALVNALYGGKQLKKLLI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secD | AAT96103.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 8e-117 | 45 |
| secD | AAT96179.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 3e-117 | 45 |
| secD | AAT96039.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 2e-117 | 45 |
| secD | AAT96067.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 2e-117 | 45 |
| secD | AAT96119.1 | SecD | Not tested | T-PAI | Protein | 2e-117 | 45 |
