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Name : LJP_0571 (LJP_0571) Accession : YP_005861853.1 Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026 Genome accession: NC_017477 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lactacin F ABC transporter permease component Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 636632 - 638818 bp Length : 2187 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTATTCAAATATAAATCTGTTTATGTACCTCAAGTAGATGAGATGGATTGCGGAGTTGCTTGTTTAGCGATGATCTT AAAACAATATCATTCTCGTATATCTTTAGCTCATTTACGTCATGAAGCGCGTACTAATCTTGAAGGAACAACTGCTTTAG GGTTAGTTAAAACAGCCCAGAAATTTAATTTAAAAACAGAAGCCGTAAAGGCAGATATGTCTTTATTTAATGATGACGGT ATTCAGTATCCTTTTATTGCTCACGTACTTAAACAGGGAGAATTGCTTCACTATTATGTGGTGCTAAAAAATACTAAAAA TTATTTATTAATTGCCGATCCAGATCCTTCAGTTGGTGTGATAAAAATGCCTAAAGATAGGTTCGCTCAAGAATGGACAG GGATTGCACTCTTTATGGTTCCCAATGAAAACTTTGAACCAATTAAAGAAAAGAAGAATAACCTATGGTCTCTCTTTCCA TATATGTTTAAACAAAAGCGGCTAATGATTAATATCATTTTAGCCGCTTTATTAATGACCATAATTAGTATCTGTAGTTC ATATTTTGTTCAAGGAATAATTGATACTTATATTCCAAGTGGTACTTATCAGACTTTATCAATCTTAGCAGTCGGATTGT TAATTGCTTATGTCTTTAATTCTATCTTCTCCTATGGACAGAATTTTTTGCTAAATGTTTTAGGACAAAGATTAAGTATT GATTTAAATCTTCAATATATTAGACATATTTTTGAATTACCGATGGAATTTTTTGTAACAAGAAGAACGGGTGAAATTAC TTCACGTTTTTCTGATGCAAGTAGAATTATTGATGCTTTGGCAAGTACGGTTATCTCGCTTTTCTTAGATCTATCAATTG TAATCGTAATGGGATTAGTATTAGCGGCTCAGAGTATGACTTTGTTTGGAATCACATTATTGGCTTTACCTATTTATGCA GTTGTAATTCTAGGTTTTACTAAAAAGTTTGAAAAATTAAATAATGAGCAAATGGAAAGTAATGCTGTTTTGAGTTCGTC AGTTATTGAAGACATTCAAGGAATTGAAACAATTAAAGCATTAAATAGTGAGAATACAAGGTATAGAAGAATCGATAGTC AGTTTGTAGATTACTTAAAAAAATCTTTTAAATACAGCAAAACTGAGAGCTTGCAGACAGCACTCAAGACATTTATTCAA TTATCTCTTAATGTAATTATTCTTTGGGTTGGTGCAAAAGTTGTAATGCAAGGACAATTGAGCATTGGTCAGTTGATGAC TTTTAATGCGTTGCTGGCATATTTTATTGATCCACTGCAAAATATTATTAATCTGCAACCGCGACTTCAATCAGCTAGTG TTGCTCAAAATCGATTGAATGAGGTCTATCAAGTAAAAAGTGAATTCAATCAGAAGACTGCTATTGAAGATTGTAAGCTC CTAGAAGGAAATATTGAATATAAGAATGTGGATTATCGCTATGGTTATGGTGCAGATGTCTTAAAAGATATTAATCTAAA AATTAACCAGGGCGAAAAATTAACGATTGTTGGAATGAGTGGATCTGGAAAATCAACAATGGTTAAGTTGTTAGTAGATT TCTTTTCGCCAAGTAAGGGTCAAGTCATTTTAAATGGCCATGCAACAAGTGAGATTAATAAGCATAGCTTGCGATCATAT GTGAATTATGTACCTCAAACCCCATATATCTTTTCTGGAACAGTTAGAGAGAATTTGTTGTTAGGTTGTAGGCCAGATAT CACTGAAGAAGATGTAATAGAGGCTTGTCAGATTGCTGAGATTGACCAAGAAATAGCTAATCTACCTTTGCAATTTGAAA CAAAATTAGATGAAAATGCAAAAATTCTATCTGGTGGACAAAAACAAAGGTTAACAATTGCTCGGGCATTATTATCTCCT GCAAAGGTATTTATCTTTGATGAAGTAACAAGTGGCTTAGATACAATTACTGAGAAGAGAGTAATTGATAATTTGATGAA GCTCAAAGATAAGACAATTATTTTTATCGCACACCGTCTGGCAATTGCGGAACGAGCAGATAAGGTTGTTGTAATTGATC GTGGCCAGATAGTTGAAGAAGGCAGTCACAGCGAATTGATGAATATGCATGGCTTTTTCTACGTAAAGTCAAGCATAATA AGAAGTTTGGCTTCATTTTTTATTTAA Protein sequence : MLFKYKSVYVPQVDEMDCGVACLAMILKQYHSRISLAHLRHEARTNLEGTTALGLVKTAQKFNLKTEAVKADMSLFNDDG IQYPFIAHVLKQGELLHYYVVLKNTKNYLLIADPDPSVGVIKMPKDRFAQEWTGIALFMVPNENFEPIKEKKNNLWSLFP YMFKQKRLMINIILAALLMTIISICSSYFVQGIIDTYIPSGTYQTLSILAVGLLIAYVFNSIFSYGQNFLLNVLGQRLSI DLNLQYIRHIFELPMEFFVTRRTGEITSRFSDASRIIDALASTVISLFLDLSIVIVMGLVLAAQSMTLFGITLLALPIYA VVILGFTKKFEKLNNEQMESNAVLSSSVIEDIQGIETIKALNSENTRYRRIDSQFVDYLKKSFKYSKTESLQTALKTFIQ LSLNVIILWVGAKVVMQGQLSIGQLMTFNALLAYFIDPLQNIINLQPRLQSASVAQNRLNEVYQVKSEFNQKTAIEDCKL LEGNIEYKNVDYRYGYGADVLKDINLKINQGEKLTIVGMSGSGKSTMVKLLVDFFSPSKGQVILNGHATSEINKHSLRSY VNYVPQTPYIFSGTVRENLLLGCRPDITEEDVIEACQIAEIDQEIANLPLQFETKLDENAKILSGGQKQRLTIARALLSP AKVFIFDEVTSGLDTITEKRVIDNLMKLKDKTIIFIAHRLAIAERADKVVVIDRGQIVEEGSHSELMNMHGFFYVKSSII RSLASFFI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 4e-123 | 42 |
