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Name : LJP_0581 (LJP_0581) Accession : YP_005861863.1 Strain : Lactobacillus johnsonii DPC 6026 Genome accession: NC_017477 Putative virulence/resistance : Virulence Product : lactacin F ABC transporter permease component Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 644524 - 646683 bp Length : 2160 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTATTCAAATATAAATCTGTTTATGTACCTCAAGTAGATGAAATGGATTGCGGAGTTGCTTGTCTAGCAATGATTTT AAAGCAGTATCATTCTCGTGTATCTTTAGCACATTTGCGTCATGAAGCTCGCACAAATCTTGAAGGTACAACTGCGCTGG GACTAGTTAAAACAGCACAGAAATTTAATTTTAAAACTGAAGCCGTAAAAGCTGATATGTCTCTTTTTAATGAGGATAGT ATTCAATACCCTTTTATTGTGCATGTTCTTAAGCAAGGAGAATTACTTCATTATTACGTAGTTCTTAAAAATACTAAGCA TTACTTAGTAATTGCCGACCCAGATCCATCAGTTGGCATAATAAAGATGCCTAAAGATAAATTTGCTCAAGAATGGACTG GTATTGCGCTTTTTATGGTTCCGAATGAAGATTTTGAACCAATTAAAGAAAAGAAAAATAACCTATGGTCTCTCTTTCCA TATATGTTTAAGCAAAAGCGGCTGATGATTAATATCATTTTAGCCGCTTTATTAATGACAATAATTAGTATTTGTAGTTC ATACTTTGTGCAAGGAATAATCGATACTTATATTCCCGATGGAACTTATCAGACTCTTTCAATTTTAGCTGTTGGACTAT TAATTGCTTATATTTTTAATTCAATCTTTTCTTATGGACAGAATTTTTTATTAAATGTTCTAGGTCAAAGATTAAGTATT GATTTAAACCTCCAATATATAAGGCATATTTTTGAATTGCCAATGGAATTCTTTGTGACTAGAAGAACTGGTGAAATAAC CTCACGTTTCTCTGATGCAAGTAGAATTATTGATGCTCTAGCAAGTACTGTTATTTCACTTTTCTTAGACTTAGCGATTG TAATTGTAATGGGAATAGTGTTAGCTGCTCAAAATATGACTTTATTTGGAATCACATTATTAGCTTTACCAGTATATGCT GTAGTAATTCTGGGATTTACTAAGAAATTTGAAAAGTTAAATGATGAACAAATGGAGAGCAATGCAGTACTAAGTTCTTC AGTCATCGAAGATATTCAAGGTATTGAAACTATCAAAGCTCTCAATAGTGAAGATACAAGATATCGTAGAATCGATAGCC AATTTGTAAATTATTTAAAGAAGTCATTTAAATATAGTAAGGCTGAGAGTTTGCAGACGGCGTTAAAGACATTTATTCAA CTATCTCTTAATGTAATTATTTTATGGGTTGGCGCACGAGTAGTGATACAAGGACAGATGAGTATCGGTCAATTAATGAC TTTTAATGCATTACTATCTTATTTCATTGACCCACTTCAAAATATTATTAACTTACAACCTCGTCTTCAATCAGCTAGTG TTGCACAAAATAGATTGAACGAGGTTTATCAGGTGCAAAGTGAATTTAATGCAGATACTTCTATCCAGAACTCAGCTGCT TTAGAAGGAATGATTGAATACAAGCATGTTCATTATCGATATGGTTATGGGACGGATGTTTTAAAAAACATTAATCTAAA AATTAAGCCAGATGAAAAATTAGCAATTGTTGGCATGAGTGGATCAGGAAAATCGACAATGGTTAAGTTACTCGTTGATT TCTTTTCACCAAGTAAGGGAGAAGTAACTTTAAATGGTCATGCAACTAGTGAAGTTAATAAACATACCTTACGCTCATAT GTTAACTATGTTCCTCAAACGCCATATATCTTTTCTGGAACAGTTAAGGAGAATTTATTACTCGGCTGCAGACCGGATAT TAGCGAAGAAGATGTAATTAAAGCCTGTCAGATTGCTGGAATTGATCAGGAGATAGCTAGTTTGCCACTACAATTCGAGA CAAAGTTAGATGAGAATGCCAAGATTTTATCCGGTGGACAAAAGCAGAGATTAACTATTGCTAGAGCATTACTCTCGCCA GCAAAAGTTTTTATCTTTGATGAAGTAACAAGTGGCTTAGATACAATTACAGAAAAAAGAGTAGTTGACAATCTTATGAA ACTAAAAGACAAGACAATCATTTTTATTGCACACCGTCTAGCCATTGCGGAACGTGCGGATAAAGTAGTTGTAATTGATC AGGGGCAAATTGTTGAAGAAGGAAGTCATGAAGAGCTTATGGAGCAACATGGTTTTTATTATGACTTAGTAAAGGGATAG Protein sequence : MLFKYKSVYVPQVDEMDCGVACLAMILKQYHSRVSLAHLRHEARTNLEGTTALGLVKTAQKFNFKTEAVKADMSLFNEDS IQYPFIVHVLKQGELLHYYVVLKNTKHYLVIADPDPSVGIIKMPKDKFAQEWTGIALFMVPNEDFEPIKEKKNNLWSLFP YMFKQKRLMINIILAALLMTIISICSSYFVQGIIDTYIPDGTYQTLSILAVGLLIAYIFNSIFSYGQNFLLNVLGQRLSI DLNLQYIRHIFELPMEFFVTRRTGEITSRFSDASRIIDALASTVISLFLDLAIVIVMGIVLAAQNMTLFGITLLALPVYA VVILGFTKKFEKLNDEQMESNAVLSSSVIEDIQGIETIKALNSEDTRYRRIDSQFVNYLKKSFKYSKAESLQTALKTFIQ LSLNVIILWVGARVVIQGQMSIGQLMTFNALLSYFIDPLQNIINLQPRLQSASVAQNRLNEVYQVQSEFNADTSIQNSAA LEGMIEYKHVHYRYGYGTDVLKNINLKIKPDEKLAIVGMSGSGKSTMVKLLVDFFSPSKGEVTLNGHATSEVNKHTLRSY VNYVPQTPYIFSGTVKENLLLGCRPDISEEDVIKACQIAGIDQEIASLPLQFETKLDENAKILSGGQKQRLTIARALLSP AKVFIFDEVTSGLDTITEKRVVDNLMKLKDKTIIFIAHRLAIAERADKVVVIDQGQIVEEGSHEELMEQHGFYYDLVKG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 1e-122 | 41 |
