|
Name : SRH_03175 (SRH_03175) Accession : YP_005905229.1 Strain : Mycoplasma hyorhinis MCLD Genome accession: NC_017519 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Lysyl-tRNA synthetase 1 Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 666285 - 667763 bp Length : 1479 bp Strand : + Note : COG1190 Lysyl-tRNA synthetase (class II) DNA sequence : ATGTCTATAAATAAATTATCAGAGCAAGAATTAGTAAGGCAAAAAAAAGTTGAGTTATTAAATAAAAAAAACATTCCAGC TTATTCAGAAACTAAATTAGAAAATACTAATTGGCAAGAAGTAGTTGCTGAATTTAATGTTTTTAGTAAAGAAGAACTTG AACAAAAAAGTGTTATTATCAATGTTGCAGGTCGTATAGTTGCAATGCGTGGACCTTTTATAATTATTAATAGTTATTTT GATAAAATTCAACTTTATTATGATAAAAAATTACTTCAAATCGAAGAAAATAAAGACTTATTTGAACTTCTTGACTTGGG TGATATTATCCAAGCACAAGGTGTTGTTTTTAAAACTAAAACCAATGAATTGTCTTTAAAAGTAAATAAACTACAACTTC TTACTAAAGCTTTAAAACCCTTGCCTGATAAATTCCACGGAATTAATGATGTTGATGAAAAATATAGAAAACGTTATTTA GATTTAATCTCAAATCCAGAAACAAAACAAGTTTTTTTCACCAGAACAAAAATTATTTCTTTAATTAGACAGTTTTTAGA TAACCTCAATTATATGGAAGTTACTACTCCGATTTTACAATCTTTATTAACAGGAGCTAGCGCTCGTCCCTTTACTACTT TTTATAATTCGTTACATGCAAATTTTTATTTAAGAATAGCAACAGAATTACCACTTAAAAAATTATTAGTAGGTGGTTTA GATCGAGTTTATGAAATTGGAAAAATCTTTAGAAATGAAGGAGTGGATACAACTCACAATCCTGAATTTACTTCAATAGA GTTTTATGAGGCATATGCTAATTTAGAAACAATGATGGAAAGAACAGAAGCAATTTTCAAATTTTTAGTTGATAAATTAA ACATTAAAAATAAAAAAATTGTTTTTGGTGAGTACGAAATTGATTTTAATTTACCATTTAATAAATTTGATTTAGTAGAT AAAACTTCGGAAATTTTAGGAATTAATTTAAAAACACAATCATTTGAACAGTTAAAAGCTATTGCTCAAGCACACAATAT CAAAATTGAAAAATTTTATCAATCAGGTCATATTATTAATGCTCTTTTTGAAGAATTTGTTGAACCCAAACTTATTCAGC CAACTTTTGTTTATGGACATCCTATTGAAATTTCTCCATTAGCTAAAAAGGATGAAAAAGATCCTCGTTTCACACAAAGA GCAGAACTTTTTATTGCTAAAAAAGAATTTGCTAATATGTTTAATGAATTAAATGATCCTGAGGATCAATTACAGCGTTT TGAAAATCAAATAAAAGAAAAAGATTTAGGAAATGAAGAAGCAAATGAAATTGACTATGATTTTGTTGATTCTTTAAAAT ACGGAATGCCACCAGCTGGTGGCTGTGGAATAGGAATTGACAGACTTGTAATGCTCTTAACTTCCAAAACATCTATTCGT GAAGTAATTTTATTTCCACAATTAAAGGCTAAAAAATAA Protein sequence : MSINKLSEQELVRQKKVELLNKKNIPAYSETKLENTNWQEVVAEFNVFSKEELEQKSVIINVAGRIVAMRGPFIIINSYF DKIQLYYDKKLLQIEENKDLFELLDLGDIIQAQGVVFKTKTNELSLKVNKLQLLTKALKPLPDKFHGINDVDEKYRKRYL DLISNPETKQVFFTRTKIISLIRQFLDNLNYMEVTTPILQSLLTGASARPFTTFYNSLHANFYLRIATELPLKKLLVGGL DRVYEIGKIFRNEGVDTTHNPEFTSIEFYEAYANLETMMERTEAIFKFLVDKLNIKNKKIVFGEYEIDFNLPFNKFDLVD KTSEILGINLKTQSFEQLKAIAQAHNIKIEKFYQSGHIINALFEEFVEPKLIQPTFVYGHPIEISPLAKKDEKDPRFTQR AELFIAKKEFANMFNELNDPEDQLQRFENQIKEKDLGNEEANEIDYDFVDSLKYGMPPAGGCGIGIDRLVMLLTSKTSIR EVILFPQLKAKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 2e-89 | 42 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| SRH_03175 | YP_005905229.1 | Lysyl-tRNA synthetase 1 | VFG1668 | Protein | 1e-89 | 42 |
