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Name : SPSE_0465 (SPSE_0465) Accession : YP_006014641.1 Strain : Staphylococcus pseudintermedius ED99 Genome accession: NC_017568 Putative virulence/resistance : Virulence Product : ABC-type bacteriocin transporter family protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 541589 - 543733 bp Length : 2145 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00005, match to protein family HMM PF00664, match to protein family HMM PF03412, match to protein family HMM TIGR01193 DNA sequence : ATGAAAATTAAATTAATAAGACAATTTGATGAAACGGATTGTGGACCTACGTGTTTAGCAATGATAAGCAGATATTACGG TAAAAATGTTTCAGTTACTAAAATAAGAGAACTAGCTAAAACGGATAAATTTGGAACTAGTATTTTTGGTCTGATTCAAG CAGGAAAGGAATTAGGTTTATTAGTTGAAGCATATGAATTAGATGAAATAAAAGAGCTAGAGGTTTTTAATCACCCAATA ATAGCACACGTAAAAACTCAAAATAACTTTGAGCACTTTATTGTGATTGAAAAAACCTTAAATGGCAAAGTAATTATTAA AGATCCAGATAAAGGAAGTTATTCATTAACATATGAAGAATTTTATGAGATATTTACATTAATTATTTTAGATATTAATA AAGAGAAGCACTTTTCAAAATCTAATGAAGTTACAACGGTTAGAAAAGTTTTAATGCCATTGCTAAAAAATAATGTTAAA TTTTTAATATTGATAATTGTCATTTCATTATTAATAAATTTAGTAGGAATTGCAGGAGCTTTATACTTTCAATATCTAAT CGATGATATAATACCTATTGAAGATTTTCATGCTTTACATAAGGTTTCAGCGTCAATATTATTATTATATTTTATTAATT TATTTGTATCATTCTTCAGATATTATCTTAGTTTGAAAATAAGTTTGAATATTGATTATAGTCTTATGAAAAAATATTAT AATCATGTAATAAAATTACCTAGCAGTTTTTTTGACAATAGAAAAACTGGAGAAATACTATCACGTTTTAACGACATTCA CAATATTAGGGAATCATTATCTTCAGTAACAGTAACTTTATTTGTTGATCTTATACTTGTTTTGGGAGGCAGTATTATTC TTTATCAAGAAAGTGGAATATTACTTCTACTATGTTCTTGTATTCTTCCTATTTACATCATTTTATCTTTAGTTTTAAAA AGACCATTTGAAATAAATAATAGAAAATTAATGGAAGAAAGTGCAGTATTAAGCTCGTATTTAATTGAATCATTTGAAAA TAATTTAATAATAAAAAGTTATAATTATGAGAATGATATGTATAGTAGGGGGAAGAAAAGATTTAACTCTCTTGTAAATA AAGCATTAAAGTTAGGGTTATATAACAATTATCAATTATCAATAAGTAACTTTGTAAATATTTTTATCAGTCTGATAGTC TTATGGGTTGGTTCATATTTAGTTATTGACAAGGAATTAACTTTAGGCTCTTTAATAGCATTTAATGCGTTATTAATTTA TTTTTTAGATCCATTTGAAAGAATTATAAATATGCAACCAATTATACAATCATCTATAGTTGCAATTAAGCGTGTAGGCG AAATTTTTGATTTGGAAACTGAAAAAAGAGAAAAAAGTATGTTTCGTCCATTGCAAAATGCAATTGTTTTTAATGATGTT TGCTTTCAATATGGCTTTAGAAGAGATATATTATCAAATGTTAATATGACCTTTACTAAAGGGAAAAAAGTAGGTATTGT TGGATCAAGTGGATCGGGAAAATCTACAATTGGAAAATTACTAATACAACTTTATAGTTGTCAGAATGGGAATATTTATT GGGATGGAAAACCAATAGAAGATTTATCACTTATGAAATTGAGGGATAATATTGGATATGTGCCACAAGATGATTTTTGG TTCAATGGTTCTATTATTGAAAACCTAACTTTAAACAAAAAAAATGTTTCAAAAGAAGTAGTTATTCAAGCTTGTAAAGA ATCAGGAGCACATGATTTTATAAGTGACCTTACTAACAAATATGAATCAATTATCGAAAACGGGGGGGGGAATTTGTCAG GTGGTCAAAAACAGAAATTATCCATAGCGCGTGCTCTTATTAAAGATCCTGATATTTATATATTTGATGAACCAACTAGT TCTTTGGATACTTTATCTGAATATAAAATATTAGAGTTATTAGAAAAACTATCTTCAAATAATAAAACAATCATTTTAAT TTCTCATAAATTAAAGAGTATAGCAAATTCGGATTATATATACGTATTGAAACATGGGAGGATTATTGAAGAAGGTTCCC ATAACGAATTGATTTTTAATGGTAGTGAATATAAGTCATTGTGGGAGAAGCAATGTGCTAGGTAA Protein sequence : MKIKLIRQFDETDCGPTCLAMISRYYGKNVSVTKIRELAKTDKFGTSIFGLIQAGKELGLLVEAYELDEIKELEVFNHPI IAHVKTQNNFEHFIVIEKTLNGKVIIKDPDKGSYSLTYEEFYEIFTLIILDINKEKHFSKSNEVTTVRKVLMPLLKNNVK FLILIIVISLLINLVGIAGALYFQYLIDDIIPIEDFHALHKVSASILLLYFINLFVSFFRYYLSLKISLNIDYSLMKKYY NHVIKLPSSFFDNRKTGEILSRFNDIHNIRESLSSVTVTLFVDLILVLGGSIILYQESGILLLLCSCILPIYIILSLVLK RPFEINNRKLMEESAVLSSYLIESFENNLIIKSYNYENDMYSRGKKRFNSLVNKALKLGLYNNYQLSISNFVNIFISLIV LWVGSYLVIDKELTLGSLIAFNALLIYFLDPFERIINMQPIIQSSIVAIKRVGEIFDLETEKREKSMFRPLQNAIVFNDV CFQYGFRRDILSNVNMTFTKGKKVGIVGSSGSGKSTIGKLLIQLYSCQNGNIYWDGKPIEDLSLMKLRDNIGYVPQDDFW FNGSIIENLTLNKKNVSKEVVIQACKESGAHDFISDLTNKYESIIENGGGNLSGGQKQKLSIARALIKDPDIYIFDEPTS SLDTLSEYKILELLEKLSSNNKTIILISHKLKSIANSDYIYVLKHGRIIEEGSHNELIFNGSEYKSLWEKQCAR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| CPR_1082 | YP_698404.1 | bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease | Virulence | Not named | Protein | 1e-107 | 41 |
