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Name : HPB14_01040 (HPB14_01040) Accession : YP_006218943.1 Strain : Helicobacter pylori HUP-B14 Genome accession: NC_017733 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium-dependent transporter (huNaDC-1) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 212016 - 213674 bp Length : 1659 bp Strand : + Note : COG0471 Di- and tricarboxylate transporters DNA sequence : ATGGAAAATCATTCGCATGCCGATACGCATACCGATACGAACACTGATGACAAAAGCACCAAGATCGTGCGCTTGTTGGG GTTAATAGGAGGGGCGTTAATCGCGCTTATTGTCTATTACGCTTTGAACACTCAAATGCCTCATATTGTAGAAGAAATCC CCAAGCTCAATTCTTTGAATTATAAGGCGATGCCTGTTGTGGCTGGGGTGGCTGTTTTAATGGGGATATGGTGGATGACT GAAGCCATTGATTTGCCTGCAACCGCGCTTTTACCTTTGGTGCTTTTTAGCGTCTTTAGCGTGGATCAATTCGCTAGCGT TAGCTCTTCTTACGCATCGCCGATTATTTTCCTTTTTATGGGAGGGTTTATTTTAGCCTTAAGCATGCAAAAATGGAACT TGCACACGCGCATCGCTTTAAGTATTATTTTATTGGTAGGCACAAGCCCTAGGAGATTGATTTTAGGTTTCATGATAGCT ACAGGCTTTTTGTCTATGTGGGTGAGTAATACCGCAACGGCGGTGATGATGCTCCCTGTTGGCATGAGCGTTTTGCAATT AGTCGCTAAGCTTGTGGGTAAAGAAAACACTTCTAATTCATGGTATCAAAAAGAAGAAATCACCAAAGCGCATGGGGGTA TTATGGGCAATATCGTGCATAAGGGTAAAGATTTTGCGAATGTGATTCAAGAAAAGACGACTATCTATCGCACGAATTTC AGCATTTGCTTGATGCTTGGCATCGCTTATGCGGCTTCTATTGGCTCTTTAGGCACTCTGATTGGCACGCCCCCTAACGC TTTATTGGCCGGCTATATGAAAACCGCTTTCAATATTGAAATTGGTTTCGCTCAGTGGATGGTGTTTGGAACACCATTAG CCTTTATCATGCTCATTTTAGCGTGGCTCTTGCTCACTTATGTGATTTTCCCTTTAAAGATTAAAGAAATCCCAGGGGGT AAGGAAGTTATTAGGGTAGAGTTAAAAAAATTAGGCCGTTTGAGTCAGGCGGAAATCTCTGTGGGGATTCTTTTTATATT AGCGTCTTTAGGGTGGATTTTTTTAGGCGTGATTTTAAAAACTTGGGGCATTAAAATAGATAGGATTGATTCGGTGATTG CGATAGGAGTTTCTGTGCTTTTGTTTATTTTGCCCGCTAACAACCAAGGCAATAGGCTCATTGATTGGGGCACTACTAAA AAACTCCCTTGGGATGTGTTGCTTTTATTTGGCGGCGGGTTAGCCTTGAGCGCGCAATTTTCTAAAACTGGGTTGAGTTT GTGGATCGGGCATTTGGTCTCTGGCTTTTCGCATTTACCGATTTTATTCATCATTGTCATGGTAACTTTAATGGTCATTT TCTTAACCGAAATCACTTCTAACACCGCTACTGCTGCCGCGTTTTTACCGGTGATTGGAGGAGTGGCGATGGGCATGGGT TATGAAAATTATCAGAGCTTGTTATTGACCATTCCTGTAGCCTTGAGCGCGACTTGCGCGTTCATGCTCCCTGTAGCCAC CCCACCCAATGCGATAGCTTATGGCTCTGGGTATGTTAAAATAACGGATATGATTAAAGCTGGTTTGTGGCTTAATTTGG TGGGCGTTGTTTTGATTAGCTCGTTTAGCTATTTTTTAGTTTCGTTAATATTTAATTGA Protein sequence : MENHSHADTHTDTNTDDKSTKIVRLLGLIGGALIALIVYYALNTQMPHIVEEIPKLNSLNYKAMPVVAGVAVLMGIWWMT EAIDLPATALLPLVLFSVFSVDQFASVSSSYASPIIFLFMGGFILALSMQKWNLHTRIALSIILLVGTSPRRLILGFMIA TGFLSMWVSNTATAVMMLPVGMSVLQLVAKLVGKENTSNSWYQKEEITKAHGGIMGNIVHKGKDFANVIQEKTTIYRTNF SICLMLGIAYAASIGSLGTLIGTPPNALLAGYMKTAFNIEIGFAQWMVFGTPLAFIMLILAWLLLTYVIFPLKIKEIPGG KEVIRVELKKLGRLSQAEISVGILFILASLGWIFLGVILKTWGIKIDRIDSVIAIGVSVLLFILPANNQGNRLIDWGTTK KLPWDVLLLFGGGLALSAQFSKTGLSLWIGHLVSGFSHLPILFIIVMVTLMVIFLTEITSNTATAAAFLPVIGGVAMGMG YENYQSLLLTIPVALSATCAFMLPVATPPNAIAYGSGYVKITDMIKAGLWLNLVGVVLISSFSYFLVSLIFN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| DIP0179 | NP_938571.1 | hypothetical protein | Not tested | Not named | Protein | 5e-104 | 52 |
