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Name : HCD_08040 (HCD_08040) Accession : YP_006221802.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656 Genome accession: NC_017735 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium-dependent transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1705777 - 1707414 bp Length : 1638 bp Strand : + Note : COG0471 Di- and tricarboxylate transporters DNA sequence : ATGGAAAATAACTCGTATACAGATGATAAAAGCACAAAAATAGTGCGTGTTGTTGGTTTAATAGGAGGGGTGCTTTTAGC ACTCATTGTCTATTACGCTCTACACGCACAAATGCCCTATGCAATAGAGCAAATCCCCAAACTCAGCTCTTTAAATTCTG CGGCCATGCCTATTGTGGCATCAGTATCTATTTTAATGGGTGTGTGGTGGATGACCGAAGCTATTGACTTACCCGCAACC GCCCTTTTGCCCCTAGTGCTCTTTAGTGTTTTTGGTGTGGATAAATTTGCTAGTGTTAGTGCGTCTTATGCATCGCCGAT TATCTTTTTGTTTATGGGGGGCTTTATTTTAGCACTAGGTATGCAAAAATGGAATTTACACACTCGCATAGCCCTAAGCA TTATCTTACTCGTAGGCACAAGCCCTAGAAGATTGATTTTAGGTTTTATGATAGCCACAGGCTTTCTATCCATGTGGGTG AGTAATACCGCAACGGCTGTAATGATGCTTCCGGTGGGATTGAGTGTTTTGCACCTAGTGGCAAAATTAGTTGGCACAGA GAATAAAGAAAAAACCAAAAGATTGCAAGAAGAAATTACCAAAGCCCATGGGGGCATAATGAGTCATATTGTGCATAAGG GTAAGGATATTACGCATGCCATTCAAGAAAAAAGCGCCATTTATCGCACGAATTTCAGTATTTGTTTAATGCTTGGTATT GCGTATTCAGCTTCTATCGGTTCTTTAGGCACTCTTATTGGCACTCCGCCTAATGCTTTACTAGCGGGCTATATGAAAAC CGCTTTTAACATTGAAATTGGTTTTTCTCAGTGGATGGTGTTTGGAGTGCCATTAGCCTTTATCATGTTACTTTTGGCGT GGCTCTTACTCACTTATGTGATTTTTCCTTTGAAGATTAAAGAAATTCCAGGTGGCAAAGAAGTGGTGAGAGCCGAGTTG CATAAACTAGGGCGTTTGAGTCAGGCTGAAATCTTAGTAGGCATTATTTTCATCTTGGCTTCCTTGGGGTGGATTTTTCT AGGCACGCTTTTAAAAAATTATGGCATTAAAGTAGATAAAATTGACTCCGTGATTGCTATGGGGGTTTCTGTTCTTTTGT TTATTTTACCAGCGAATAATAAGGGTGAAAGACTCATTGATTGGGACACAACCAAAAAACTTCCTTGGGATGTGTTGCTC TTATTTGGTGGGGGACTTGCACTAAGCGCTCAATTTTCTAAAACCGGATTGAGTTTGTGGATTGGGCATCTTGTCTCTAG CTTTTCACATTTGCCGATTCTACTCATCATTGTCGTGGTTACTTTAATGGTGATTTTTTTAACTGAAATCACTTCTAATA CCGCCACAGCCGCCGCATTTTTACCTGTGATTGGGGGAGTTGCAATGGGCATGGGCTATGAAGGTCAATCAAGTTTATTA TTTACTATTCCTGTGGCTTTGAGTGCGACTTGTGCGTTCATGCTTCCTGTAGCCACTCCACCTAATGCGATAGCTTATGG CTCTGGGTATGTTAAAATAGCGGATATGATTAAGGCGGGTTTATGGCTGAACTTAGTGGGCGTAGTATTGATTAGTGCGT TTTGTTACATGCTGACAGGTTTGGTGTTTGGAAGTTAA Protein sequence : MENNSYTDDKSTKIVRVVGLIGGVLLALIVYYALHAQMPYAIEQIPKLSSLNSAAMPIVASVSILMGVWWMTEAIDLPAT ALLPLVLFSVFGVDKFASVSASYASPIIFLFMGGFILALGMQKWNLHTRIALSIILLVGTSPRRLILGFMIATGFLSMWV SNTATAVMMLPVGLSVLHLVAKLVGTENKEKTKRLQEEITKAHGGIMSHIVHKGKDITHAIQEKSAIYRTNFSICLMLGI AYSASIGSLGTLIGTPPNALLAGYMKTAFNIEIGFSQWMVFGVPLAFIMLLLAWLLLTYVIFPLKIKEIPGGKEVVRAEL HKLGRLSQAEILVGIIFILASLGWIFLGTLLKNYGIKVDKIDSVIAMGVSVLLFILPANNKGERLIDWDTTKKLPWDVLL LFGGGLALSAQFSKTGLSLWIGHLVSSFSHLPILLIIVVVTLMVIFLTEITSNTATAAAFLPVIGGVAMGMGYEGQSSLL FTIPVALSATCAFMLPVATPPNAIAYGSGYVKIADMIKAGLWLNLVGVVLISAFCYMLTGLVFGS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| DIP0179 | NP_938571.1 | hypothetical protein | Not tested | Not named | Protein | 5e-105 | 54 |
