|
Name : pgk (HCD_04270) Accession : YP_006221078.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 99-5656 Genome accession: NC_017735 Putative virulence/resistance : Unknown Product : phosphoglycerate kinase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.2.3 Position : 888315 - 889523 bp Length : 1209 bp Strand : + Note : COG0126 3-phosphoglycerate kinase DNA sequence : ATGTTAGCTAAAATGTCGTTTATGCAAAATGTTAAAAACATTCAAGAAGTAGAAGTTAAGAATAAAAGGGTGCTAATTAG AGTGGATTTTAATGTGCCTTTAGATGAAAACCTTAATATCACTGATGACACACGCATAAGAGAGAGTCTCCCTACCATTC AATTTTGTATTGATAATAAGGCTAAAGATATTATTTTGGTCAGCCATTTAGGTCGTCCTAAGGGCGTTGAAGAGAAATTG AGCTTAAAGCCCTTTTTAAAACGCCTTGAAAGGCTATTGAACCACGAAGTGATTTTTTCACAGAATATCACGCAATTACA ACATACTCTAAAAGAAAAATCGCAAGCAAGGATTTTTCTTTTAGAAAATATTCGTTTTCTAAAGGGTGAAGAAGAAAATG ACAACAATCTAGCTAAAGAATTAGCGAGCCTGTGCGATGTGTTTGTTAATGATGCCTTTGGCACAAGCCACAGAAAGCAT GCAAGCACTTATGGGGCGGCTCAATTTGCCCCCATTAAGGTGAGCGGATTTTTACTCAAAAAAGAAATTGATTCTTTTTA TCAAGCGTTTAACCACCCCTTACGCCCCCTATTATTAATCGTGGGGGGAGCTAAGGTCAGCTCTAAACTCACTCTATTAA AAAACATTTTAGATTTAATTGACAAGCTCATTATTGCTGGGGCGATGAGCAACACCTTCTTAAAAGCCTTAGGTTATGAT GTAAAGGATTCTCTAGTAGAAGATGCTTTATTAGGAGAAGCCCTAGAATTATTAAAGAGTGCGAAAGAAAAAAAAGTCAA AGTCTATTTGCCCATAGATGCTGTTACAACTGATGATATTTTAAATCCTAAACAAATCAAAATTTCACCCGTTCAAGATA TTGAGCCTAAGCATAAAATCGCTGATATAGGACCTGCGAGCGTGAAGTTATTCTCTGAAGTCATAGAGAGCGCACCTACC ATTATATGGAATGGTCCCTTGGGTGTGCATGAAAAACAAGAATTTGCTAGAGGAACAACCTTTTTAGCTCATAAAATCGC TGACACTTACGCCTTTTCTCTCATCGGTGGGGGTGATACTATTGATGCGATTAATCGTGCGGGTGAAAAGGATAACATGA GCTTTATTTCTACAGGTGGGGGGGCGAGTTTGGAGCTGTTAGAAGGTAAGATTCTACCTTGTTTTGAGGTTTTAGATAAG CGTCATTAA Protein sequence : MLAKMSFMQNVKNIQEVEVKNKRVLIRVDFNVPLDENLNITDDTRIRESLPTIQFCIDNKAKDIILVSHLGRPKGVEEKL SLKPFLKRLERLLNHEVIFSQNITQLQHTLKEKSQARIFLLENIRFLKGEEENDNNLAKELASLCDVFVNDAFGTSHRKH ASTYGAAQFAPIKVSGFLLKKEIDSFYQAFNHPLRPLLLIVGGAKVSSKLTLLKNILDLIDKLIIAGAMSNTFLKALGYD VKDSLVEDALLGEALELLKSAKEKKVKVYLPIDAVTTDDILNPKQIKISPVQDIEPKHKIADIGPASVKLFSEVIESAPT IIWNGPLGVHEKQEFARGTTFLAHKIADTYAFSLIGGGDTIDAINRAGEKDNMSFISTGGGASLELLEGKILPCFEVLDK RH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| pgk | AAO17214.1 | Pgk | Not tested | tcd island | Protein | 6e-49 | 41 |
