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Name : HCW_07090 (HCW_07090) Accession : YP_006223306.1 Strain : Helicobacter cetorum MIT 00-7128 Genome accession: NC_017737 Putative virulence/resistance : Unknown Product : sodium-dependent transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1543881 - 1545521 bp Length : 1641 bp Strand : - Note : COG0471 Di- and tricarboxylate transporters DNA sequence : ATGGAAGATAACTCGTATACAGATGATAAAAGCACAAAAATAGTGCGTGTTGTTGGTTTAATAGGTGGGGTGCTTTTAGC ACTCATTGTCTATTACGCTCTACACGCACAAATGCCCTATGCAATAGAGCAAATCCCCAAACTGAGTTCCTTAAATTATA CAGCCATGCCTATTGTGGCATCAGTATCTATTTTAATGGGTGTGTGGTGGATGACTGAAGCTATTGACTTACCCGCAACG GCTCTTTTACCCTTAGTATTATTTAGTGTTTTTGGCGTGGATAAATTTGCTAGTGTTAGTGCGTCTTATGCATCGCCGAT TATCTTTTTGTTTATGGGGGGGTTTATTTTAGCGCTAAGCATGCAAAAATGGAATTTACACACTCGTATAGCTTTAGGCA TAATCTTACTTGTTGGCACAAGCCCTAGAAGATTGATTTTGGGTTTTATGATAGCTACAGGCTTTCTATCCATGTGGGTG AGCAATACTGCAACAGCTGTGATGATGCTCCCAGTTGGCATGAGCGTGCTGCATTTAGTAGCAAAGCTAGTAGGCACAGA AAATGAAAAAAAAACTAACAAATTGCATAAAGAAGAAATCACTAAAGCGCATGGGGGAATGCTTAGTCATGTAGTGCATA AGGGTAAGGATATTGCTCAAAAAGTGCAAGAAAAGACAATGATTTATCGCACGAATTTCAGCATTTGTTTAATGCTTGGC ATTGCCTATTCAGCCTCTATTGGCTCTTTAGGCACTCTTATTGGCACTCCACCTAATGCTTTACTAGCCGGCTATATGAA AACAGCCTTTAATGTTGAGATAGATTTTGGAAAATGGATGCTTTTTGGCACGCCTTTAGCCTTTATTATGCTTATTATTT CATGGCTTTTACTCACTTATGTGATTTTCCCTTTGAAAATTAAAGAAATTCCGGGTGGCAAGGAAGTTGTTAGGCAAGAA TTGCATAAACTAGGGCGTTTGAGTCAAGCTGAAATTTCAGTAGGTATTATTTTTATTTTAGCGTCTTTAGGGTGGATTTT TTTAGGCACTCTTTTAAAAAGTTATGGTATTAAAATAGATAAGATTGATTCTGTGATTGCTATGGGGGTTTCTGTTCTTT TGTTTATTTTGCCAGCAAATAATAAGGGCGAAAGACTTATTGATTGGGATACGACTAAAAAACTTCCTTGGGATGTGTTG CTCTTATTTGGTGGGGGACTTGCCTTAAGCGCTCAATTTTCTAAAACCGGCTTGAGTTTGTGGATTGGTCATCAAGTTTC TAGCTTTGCAAACTTGCCAATTTTACTCATTATTGTAGCTGTGGCAACTATGGTGATTTTCTTAACTGAAATCACTTCTA ATACCGCTACAGCTGCTGCCTTTTTACCCGTAATTGGAGGGGTTGCAATGGGTATGGGCTATGAAGGTCAATCAAGTTTA TTATTTACTATTCCTGTAGCCTTAAGTGCGACTTGTGCGTTCATGCTCCCTGTAGCCACTCCGCCTAATGCAATTGCTTA TGGCTCGGGGTATGTTAAAATAACAGACATGATTAAAGCGGGACTATGGCTTAATGTAATAGGGGTTATTTTAATTAGTG CATTTACCTATGCGCTTGTTTCGCTTGTATTTGTGAATTAA Protein sequence : MEDNSYTDDKSTKIVRVVGLIGGVLLALIVYYALHAQMPYAIEQIPKLSSLNYTAMPIVASVSILMGVWWMTEAIDLPAT ALLPLVLFSVFGVDKFASVSASYASPIIFLFMGGFILALSMQKWNLHTRIALGIILLVGTSPRRLILGFMIATGFLSMWV SNTATAVMMLPVGMSVLHLVAKLVGTENEKKTNKLHKEEITKAHGGMLSHVVHKGKDIAQKVQEKTMIYRTNFSICLMLG IAYSASIGSLGTLIGTPPNALLAGYMKTAFNVEIDFGKWMLFGTPLAFIMLIISWLLLTYVIFPLKIKEIPGGKEVVRQE LHKLGRLSQAEISVGIIFILASLGWIFLGTLLKSYGIKIDKIDSVIAMGVSVLLFILPANNKGERLIDWDTTKKLPWDVL LLFGGGLALSAQFSKTGLSLWIGHQVSSFANLPILLIIVAVATMVIFLTEITSNTATAAAFLPVIGGVAMGMGYEGQSSL LFTIPVALSATCAFMLPVATPPNAIAYGSGYVKITDMIKAGLWLNVIGVILISAFTYALVSLVFVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| DIP0179 | NP_938571.1 | hypothetical protein | Not tested | Not named | Protein | 8e-110 | 54 |
