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Name : HCN_1429 (HCN_1429) Accession : YP_006235741.1 Strain : Helicobacter cinaedi PAGU611 Genome accession: NC_017761 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type VI secretion protein VC_A0114 family Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1423676 - 1425076 bp Length : 1401 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCAAATCAACTAAAAGTTGCTTGGTTTAATGGTTTAAATATTGATAAAATTCATTTTGAACAGCAAGAGAGATATTT TCAAAGAAATATAGATTTAAAAACCATTGAAGTATCAAATAATCTTTATGGAATTATTGATTTAAAATTTTCTAATGAAC TGCTTATACAAGGTAAGATTGCATTAGAAAAAATTTCTGGGATAGCTAAAGATGGAAGTATTTTTAACGCTCCAGAACAA GATTTATTGCCAGAAGCTTTAGAAATCAATTATGAATCATTAGAAAATTCGGTTATAGTATTAAAAATCCCTCTAAGCAC TGCTAGCATTGCTGATGTAGCCCTACAAAATAATTTTCCTAATTCTAAATACCTAACTTTAAGAAGCATTATTGCCTCAA GAACTTATGATGATAACCATAGTGTAGGTATTTCAAGGGAATTATTAGAAGATGAAAAAGATTTACAAAATACAACTTTT ACTCAGGAAAAAATTAACTTAACGCTTGCGAGTTTGAGACTGAAACTCGGAATTTTAGGCAATGCAACACCTGATGAACT TGAGATTCCTATTGCCAAAATTAAAAATATAGATTCAAATAAAAAAATAGAGCTTGAAGAAAATTTTATTCCTACCTGTA TTAATATCAACAAAGTTTCCATTGTCAAGTCTTTTTTAGAAGAAACATTATATTCTATCAAACAACATAAAGAGATACTT TGGGAAGTTTTTAAAGGCATTGACCAAACAAAAAATACTTTAGATTTTAGCACTTATTTATCTTTAAATCTTCTTAAAAA ATGGTTTTTAATTTTTTCTTACCTTATTCACAAGAACAAATTACACCCCGAATATTTATATGAAAAGCTTATTGAATTTC AGGGGGAACTTGGGGCATTTGGCGTTGAAAATTCCTTTTTAGAATTTATTGCCTACCAACACGATAATTTAAATGAAACT TTTTTTCCTTTAATCAATAATATAAAGATTTTATTTGCTAAAATTACTTCTCCGAGATATTCAATGGCAAAACTTATAGA TAATGGTAATGGTTTCTATGATTTGTTATTTGATAACGCTGGAATTTTAGAAGAATCTGAACTTTTCTTAGCCATTAATG CTGATGTTAATCACGAATATTTATTAAAAAACTTTAAAACACAAAGTAAAATCCATACGCAGAGTAAAATCAAAAATATA GTAGCTACTCAACTTAGAGGATTGAATATTATCCAAATTCCAAATATTCCTTCAGCTATCCCTTATTTAAATGGCTATGT TTATTATAAGCTAGATAAAAAAGATGAATTGTTTAAACATTTTAAAGGAGAAAACGCAATAAGTATTTACCTTACTCATA ATATTAAGAATCCTGATATAAAAATGTGGGCAGTATTTTAA Protein sequence : MANQLKVAWFNGLNIDKIHFEQQERYFQRNIDLKTIEVSNNLYGIIDLKFSNELLIQGKIALEKISGIAKDGSIFNAPEQ DLLPEALEINYESLENSVIVLKIPLSTASIADVALQNNFPNSKYLTLRSIIASRTYDDNHSVGISRELLEDEKDLQNTTF TQEKINLTLASLRLKLGILGNATPDELEIPIAKIKNIDSNKKIELEENFIPTCININKVSIVKSFLEETLYSIKQHKEIL WEVFKGIDQTKNTLDFSTYLSLNLLKKWFLIFSYLIHKNKLHPEYLYEKLIEFQGELGAFGVENSFLEFIAYQHDNLNET FFPLINNIKILFAKITSPRYSMAKLIDNGNGFYDLLFDNAGILEESELFLAINADVNHEYLLKNFKTQSKIHTQSKIKNI VATQLRGLNIIQIPNIPSAIPYLNGYVYYKLDKKDELFKHFKGENAISIYLTHNIKNPDIKMWAVF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| HH0250 | NP_859781.1 | hypothetical protein | Not tested | HHGI1 | Protein | 3e-132 | 57 |
