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Name : NT08PM_1366 (NT08PM_1366) Accession : YP_006240243.1 Strain : Pasteurella multocida 3480 Genome accession: NC_017764 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c-type biogenesis protein CcmF Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1428418 - 1430343 bp Length : 1926 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATCCCAGAACTTGGTTTTTTGGCTTTACTGATCGCTTCTTTGTGTGCGTTCTTGCTTGCGCTAGTGCCACAAGTCGG TATTTTTTTGCGTAAGCCGTATATGATTGGTACTGCGTGGAATTTGAGTTATCTCTTTGGGATATTTACCTGTATAGCGT TATTCTGCCTTGCCTATGCCTTTGCGCTCGATGATTTTTCTGTGCAATATGTGGCACATCATTCTAATTCACAACTGCCA ATTTTCTTTAAAGTGTCTGCTACTTGGGGTGGACATGAAGGGTCGATGCTATTTTGGTTGTTTGCTTTAGCACTCTGGTT GATGCTCTTTGCGTTTTCCAGTCGTCATAAAGATCCGATTATTTGTGCGCGAGCACTTTCAGTGCTTGGGCTCATTTGTT TTGGTTTTTGTCTCTTTATTTTATTTTTATCAAATCCATTTGAACGCAGTTTTCCACAAGCATTTGAAGGGCGTGATTTA AATCCGATGTTGCAAGATGTGGGGCTGATTTTTCACCCGCCTTTATTGTATTTGGGCTATGTGGGCTTTGCCGTCAATTT TGCTATTACTATTTCTGCTTTAGTGAGTGGGCATTTAGATGCCGCCGTGGCTCGCATGATGCGCCCTTGGGTTTTGCTAT CTTGGTTATTTTTAACTTTAGGGATTGTGTTAGGGTCTTGGTGGGCGTATTACGAACTAGGCTGGGGCGGCTGGTGGTTT TGGGATCCGGTCGAAAACGCCTCATTGATGCCTTGGTTATTAGGTTTGGCACTATTACATAGTCTATCTATCACAGAACA GCGTGGCATTTTTAGTTACTGGACGCTGCTATTTTCACTTTTGGCATTTTCTTTCAGTTTACTGGGTACCTTCATCGTAC GCTCGGGCGTCTTAACTTCTGTGCACGCGTTTGCAGTAGATGGTGATCGGGGAATTGCCTTACTGATTTTATTCTTTTTA TTGACTGTGAGTGCATTCACTTTATTTGCATTAAAGGTTAACTTGCCACAAAGTGCGGTACGTTTCCGTTTAATTTCGAA GGAAAATGCTCTGTTGCTTCTCAATATTTTATTGACGATTGCCACGGTCAGTGTCTTTTTAGGCACTTTTTATCCGATTG TCTTTACCGCATTACAATGGGGATCTATTTCAGTCGGCGCGCCGTATTTTAATACAATTTTTCTGCCACTGTTTGTGATG GCAATGCTTGCTATGATTTTGGTGTTGTCTTTACGTTGGAAAACACTGAATAAAAAACCGTTTATTCAACGTACGTTATT GTTATTTCCCGCGCTTATATTGGCTTATGGATTAATCCGTTATTATGTAGATCATAACCAAGGGTTGCCTTTCAATTTCA GCGCTTATGGCTTGTTAAGCCTGTCGATTTGGTTAATTCTGGCGACGTTATGGCTCCCATGGACGCAGCTGAAACTGAAA CAGCTCGCCATGGTGATCGCGCATTTAGGTGTAGCGATAACGGCAATTGGGGCGATCATGAGTAGCTATTACAGCAGTGA GATTGGCGTGCGCTTGGCACCGCAACAACGCCAAAAACTCGGTGATTACGAGTTTCACTATCAGGGTTTTCAGCATGTGT TAGGTCCGAATTACACCAGTGAAAAAGCCCATTTTGTGGTGACAAAGCAAAACCAAGCTTATGCTGAGATTTACCCAGAA CGCCGTTATTATGATGTGCGTACTATGAACATGAGCGAAGTTGGGATTGATTGGGGGTGGCTTGGTGATGTCTATATTGT AATGGGCGATAAATTGGGACAAGGCGAATTTACTTTCCGCTTGCAATATAAACCTTTTATCCGTTGGTTATGGTTTGGCG GGCTTTTAATGGCACTGGGCGCCTTGCTTGCCATATTTTCCTTGTGCAATAGCAATGAACCAAAACCACGTCGTCAGTCA GATTGA Protein sequence : MIPELGFLALLIASLCAFLLALVPQVGIFLRKPYMIGTAWNLSYLFGIFTCIALFCLAYAFALDDFSVQYVAHHSNSQLP IFFKVSATWGGHEGSMLFWLFALALWLMLFAFSSRHKDPIICARALSVLGLICFGFCLFILFLSNPFERSFPQAFEGRDL NPMLQDVGLIFHPPLLYLGYVGFAVNFAITISALVSGHLDAAVARMMRPWVLLSWLFLTLGIVLGSWWAYYELGWGGWWF WDPVENASLMPWLLGLALLHSLSITEQRGIFSYWTLLFSLLAFSFSLLGTFIVRSGVLTSVHAFAVDGDRGIALLILFFL LTVSAFTLFALKVNLPQSAVRFRLISKENALLLLNILLTIATVSVFLGTFYPIVFTALQWGSISVGAPYFNTIFLPLFVM AMLAMILVLSLRWKTLNKKPFIQRTLLLFPALILAYGLIRYYVDHNQGLPFNFSAYGLLSLSIWLILATLWLPWTQLKLK QLAMVIAHLGVAITAIGAIMSSYYSSEIGVRLAPQQRQKLGDYEFHYQGFQHVLGPNYTSEKAHFVVTKQNQAYAEIYPE RRYYDVRTMNMSEVGIDWGWLGDVYIVMGDKLGQGEFTFRLQYKPFIRWLWFGGLLMALGALLAIFSLCNSNEPKPRRQS D |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| ccmF | YP_217241.1 | cytochrome c-type biogenesis protein | Not tested | SPI-12 | Protein | 2e-83 | 47 |
| ccmF | AAN62106.1 | putative cytochrome C-type biogenesis protein CcmF | Not tested | PAGI-2(C) | Protein | 1e-83 | 43 |
