Gene Information

Name : ABTJ_02080 (ABTJ_02080)
Accession : YP_006289978.1
Strain : Acinetobacter baumannii MDR-TJ
Genome accession: NC_017847
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : malate synthase G
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2156213 - 2158378 bp
Length : 2166 bp
Strand : -
Note : PFAM: Malate synthase; TIGRFAM: malate synthase G

DNA sequence :
ATGACTGCACGTATTCAAAAAGGCAAGTTAGCGATTGCTAAAGAACTTTACGATTTTATCGAAAATGAAGCTTTACCAGG
TTCTGGTTTAGATAGTGAAACTTACTGGAAGAACTTTGAGCAAGTTGTTGTCGACCTTAGTCCAAAGAATAAAGCATTAT
TGGCTAAGCGTGATGAATTACAAGCAAAAATTGATGAATGGCACCGCAACAATAAATTTGAATTAGGTGCTTACAAAGCA
TTTTTAACTGAAATTGGTTATTTATTACCAGAAGTTGAAGACTTCCAAATTACTACTGAAAACGTAGATGAAGAAATTGC
ATTGTTAGCAGGCCCACAATTAGTAGTACCTGTACGTAATGCACGTTATTGCTTAAATGCAGCAAATGCGCGCTGGGGTT
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AGTTTGTGGGTTTCAATGGTGAAGAAGCGAACCCTTCAGAAGTTGTTCTTTTGAGTAATGGCCTACATGTCATTATTGAA
ATTGATGCGAATAGCCCAATTGGCCAAACTGATTTAGCGGGTGTTAAAGATCTAACACTTGAAGCTGCGGTTACAACAAT
TCAGGATCTTGAAGACTCTGTAGCAGCTGTTGATGCAGAAGAAAAGGTTGAAGGTTATCGTAACTGGTTAGGTTTGATGA
AGGGCACTCTTCAAGAATCTATCGAAAAAAATGGTAAAACAATTGTTCGCGCTTTGAACAAAGACCGTGAAATTAAAAAT
TTGATCGGTGGCACAACAAAACTTCATGGTCGTTCACTTATGTTACTTCGTAACGTAGGTCATTTAATGACGAATCCAGC
AATTTTAGTTGATGGCGAAGAAATTTTCGAAGGTATTATGGATGCGTTGGTAACACCATTGTTGTCAATTGCTGACATCC
GTAGTGAAAACGAAAATAAAAACTCTCGTAAAGGGTCTATGTATATTGTTAAACCAAAAATGCATGGTCCTGAAGAAGTT
GCTTTTGCTGTTGAGTTATTTGAGCGTGCTGAGCAAGCCCTAGGATTACCAGCGAAGTCTTTAAAAATCGGTATTATGGA
TGAAGAACGCCGTACATCTGTAAACCTGAAAAACTGTATTGCTGCTGCTAAAGATCGCACAATCTTTATTAACACTGGGT
TCATGGACCGTACGGGTGACGAAATCCATACCTCTATGGAAGCTGCACCAGTTGTTCGTAAAGAAGCTGTTAAAACACAA
AAATGGATTGCTGCTTACGAAAATCGTAACGTTGCAATCGGTTTGAAATGTGGTTTACAAGGTAAAGCACAGATTGGTAA
AGGCATGTGGCCAAAACCAGATAGCATGAAAGATATGTTGGCAACTAAAGCTGCTCATCCAAATGCTGGTGCTTCATGTG
CTTGGGTTCCATCACCAACTGGTGCTGTACTTCATGCGATGCATTACCACCAAGTAAATGTAAAAGCACGTCAAGATCAG
TTAAAAGCTGAAGAAATGTTGTCATTAGATGACTTGTTAACTCCTCCATTTGCAACTGATACAAACTGGTCAGCAGAAGA
AATTAATAACGAACTTGAAAATAACTGCCAAGGTATTTTAGGTTACGTTGTTCGTTGGGTGGACTTAGGTGTAGGTTGTT
CAAAAGTTCCGGATATTAACAATGTGGGCTTAATGGAAGACCGTGCAACATTACGTATTTCTTCTCAACATGTTGCCAAC
TGGTTACGTCACGGTATCGTGACTCGTGAACAAGTTGAAGAAGTGCTTAAACGCATGGCAAAAATTGTTGATGAACAAAA
TGCGAATGATCCATTGTATAAACCAATGGCAGCTAACTTTGAAACTAATATTGCTTTCCAAGCAGCTTCAGATCTTATCT
TTAAAGGTTGTGAACAGCCTTCTGGTTATACTGAGCCATTACTACATGCGGCTCGTTTAAAATTAAAAGGTTATACAGGT
GACTAA

Protein sequence :
MTARIQKGKLAIAKELYDFIENEALPGSGLDSETYWKNFEQVVVDLSPKNKALLAKRDELQAKIDEWHRNNKFELGAYKA
FLTEIGYLLPEVEDFQITTENVDEEIALLAGPQLVVPVRNARYCLNAANARWGSLYDALYGFDVISEEGGAEKGKGYNPV
RGAKVIEFAKNFLNEIFPLAQGSHADATKYAIEQNKLVVTLKDGTKTGLAHEAQFVGFNGEEANPSEVVLLSNGLHVIIE
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WLRHGIVTREQVEEVLKRMAKIVDEQNANDPLYKPMAANFETNIAFQAASDLIFKGCEQPSGYTEPLLHAARLKLKGYTG
D

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcB CAE85241.1 GlcB protein, malate synthase G Not tested PAI V 536 Protein 0.0 57